Protein–RNA interactions for Protein: P11532

DMD, Dystrophin, humanhuman

Predictions only

Length 3,685 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DMDP11532 KLF11-201ENST00000305883 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
DMDP11532 ILF2-201ENST00000361891 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
DMDP11532 SP2-201ENST00000376741 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
DMDP11532 AP001331.1-201ENST00000413008 1015 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
DMDP11532 LINC01494-201ENST00000419511 1011 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
DMDP11532 AP005273.1-201ENST00000444862 522 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
DMDP11532 SNRPN-208ENST00000577565 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
DMDP11532 FES-204ENST00000414248 2327 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
DMDP11532 FGF21-202ENST00000593756 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
DMDP11532 YIPF1-201ENST00000072644 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
DMDP11532 GGT6-204ENST00000574154 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
DMDP11532 NDUFC2-201ENST00000281031 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
DMDP11532 AC011455.3-201ENST00000599996 1967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
DMDP11532 MC1R-204ENST00000639847 2567 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
DMDP11532 TMEM74B-201ENST00000381894 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
DMDP11532 AC018904.2-201ENST00000561202 1757 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
DMDP11532 NR4A1-202ENST00000360284 2589 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
DMDP11532 SNCAIP-202ENST00000261368 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
DMDP11532 RPSAP69-201ENST00000445739 546 ntTSL 4 BASIC13.54□□□□□ -0.24
DMDP11532 NDUFB2P1-201ENST00000506966 295 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
DMDP11532 AC092296.1-201ENST00000587018 566 ntTSL 4 BASIC13.54□□□□□ -0.24
DMDP11532 AC245369.3-201ENST00000624687 411 ntAPPRIS P1 BASIC13.54□□□□□ -0.24
DMDP11532 DHRS12-202ENST00000280056 1324 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
DMDP11532 SOWAHA-201ENST00000378693 3211 ntAPPRIS P1 BASIC13.54□□□□□ -0.24
DMDP11532 AC026412.1-203ENST00000507841 2338 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
DMDP11532 ANP32B-201ENST00000339399 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
DMDP11532 EEF1G-201ENST00000329251 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
DMDP11532 PERM1-201ENST00000341290 3035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
DMDP11532 AL137077.1-201ENST00000442115 528 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
DMDP11532 C5orf38-203ENST00000457752 387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
DMDP11532 AC246817.2-204ENST00000517984 562 ntTSL 4 BASIC13.54□□□□□ -0.24
DMDP11532 SELENOK-205ENST00000541726 814 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
DMDP11532 LINC01836-201ENST00000586061 829 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
DMDP11532 SMIM22-207ENST00000589721 822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
DMDP11532 Metazoa_SRP.122-201ENST00000610476 285 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
DMDP11532 PNPLA3-203ENST00000423180 2222 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
DMDP11532 GATA4-206ENST00000528712 2614 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
DMDP11532 ZFYVE27-202ENST00000357540 2765 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
DMDP11532 ZFYVE27-204ENST00000370610 2769 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
DMDP11532 MCFD2-201ENST00000319466 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
DMDP11532 SRRD-201ENST00000215917 4020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
DMDP11532 KCNJ11-204ENST00000528731 2146 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
DMDP11532 EDEM2-201ENST00000374491 1756 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
DMDP11532 SLIRP-201ENST00000238688 394 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
DMDP11532 MORN2-201ENST00000340556 741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
DMDP11532 GRP-202ENST00000420468 579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
DMDP11532 AC116347.1-201ENST00000442824 720 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
DMDP11532 AL390961.2-201ENST00000454991 472 ntTSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
DMDP11532 PCTP-206ENST00000573500 919 ntTSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
DMDP11532 AL356740.1-201ENST00000602192 1297 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
DMDP11532 AL133551.1-201ENST00000610279 1222 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
DMDP11532 PXN-201ENST00000228307 3785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
DMDP11532 MAP2K1-201ENST00000307102 3410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
DMDP11532 TBC1D2-205ENST00000465784 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
DMDP11532 SERP1-201ENST00000239944 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
DMDP11532 ADAM33-207ENST00000619289 3195 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
DMDP11532 PPP1R21-202ENST00000294952 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
DMDP11532 GMIP-204ENST00000587238 2987 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
DMDP11532 PKD1P6-NPIPP1-202ENST00000605794 2902 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
DMDP11532 WDR20-205ENST00000424963 2695 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
DMDP11532 CCDC47-201ENST00000225726 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
DMDP11532 COASY-202ENST00000421097 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
DMDP11532 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
DMDP11532 BBS1-225ENST00000630659 1934 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
DMDP11532 B4GALNT1-201ENST00000341156 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
DMDP11532 SH3BGR-202ENST00000380631 780 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
DMDP11532 AL161644.1-201ENST00000426901 1111 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
DMDP11532 AL355482.2-201ENST00000428646 1145 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
DMDP11532 LINC01664-202ENST00000441544 1175 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
DMDP11532 AP000959.1-201ENST00000441759 977 ntTSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
DMDP11532 SHMT2-203ENST00000449049 2121 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
DMDP11532 AL662899.2-201ENST00000503322 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
DMDP11532 AP001979.1-201ENST00000529222 751 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
DMDP11532 NUDT16P1-202ENST00000499077 2208 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
DMDP11532 PROZ-201ENST00000342783 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
DMDP11532 LINC00675-202ENST00000581851 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
DMDP11532 PXN-221ENST00000637617 3246 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
DMDP11532 ZNF582-201ENST00000301310 2824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
DMDP11532 SGCA-202ENST00000344627 1057 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
DMDP11532 BNIP1-202ENST00000351486 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
DMDP11532 KRT19P4-201ENST00000443208 943 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
DMDP11532 AC012100.1-201ENST00000470304 282 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
DMDP11532 AC090589.3-201ENST00000524412 574 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
DMDP11532 ADGRG3-201ENST00000333493 2728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
DMDP11532 SMARCA2-254ENST00000636903 2471 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
DMDP11532 MLXIPL-204ENST00000414749 3224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
DMDP11532 CBX2-202ENST00000310942 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
DMDP11532 GOSR2-235ENST00000640269 2190 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
DMDP11532 TCP10-202ENST00000397829 2141 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
DMDP11532 METTL22-203ENST00000561758 1312 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
DMDP11532 ATP5C1-201ENST00000335698 1078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
DMDP11532 VASH2-205ENST00000366967 1206 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.24
DMDP11532 IDI2-AS1-204ENST00000437374 896 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
DMDP11532 PLAC9P1-203ENST00000440031 223 ntBASIC13.52□□□□□ -0.24
DMDP11532 TRAPPC4-212ENST00000533058 1209 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.24
DMDP11532 AC008982.2-201ENST00000600473 493 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
DMDP11532 AC008764.4-207ENST00000600705 956 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.24
DMDP11532 AL590094.1-208ENST00000636917 627 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
DMDP11532 RNF26-201ENST00000311413 2787 ntAPPRIS P1 BASIC13.52□□□□□ -0.24
DMDP11532 SIRT1-201ENST00000212015 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
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