Protein–RNA interactions for Protein: O95484

CLDN9, Claudin-9, humanhuman

Predictions only

Length 217 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDN9O95484 ARID4B-201ENST00000264183 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
CLDN9O95484 TLE1-203ENST00000376499 3893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
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CLDN9O95484 SSBP2-220ENST00000615665 4465 ntTSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
CLDN9O95484 ATCAY-201ENST00000450849 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
CLDN9O95484 RAB40A-201ENST00000304236 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
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CLDN9O95484 RPL35A-205ENST00000448864 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
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CLDN9O95484 SGK3-208ENST00000521198 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
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CLDN9O95484 PTPN23-201ENST00000265562 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
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CLDN9O95484 ALG3-205ENST00000445626 1533 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
CLDN9O95484 LINC00339-208ENST00000634934 1518 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
CLDN9O95484 SCAF4-202ENST00000399804 4127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
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CLDN9O95484 SLC4A7-213ENST00000454389 4159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
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CLDN9O95484 RNASEH1-AS1-202ENST00000438436 1218 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
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CLDN9O95484 METTL13-203ENST00000367737 2865 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
CLDN9O95484 IFITM10-201ENST00000340134 3706 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.85□□□□□ -0.19
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CLDN9O95484 ANK1-205ENST00000347528 8237 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
CLDN9O95484 PTPRO-201ENST00000281171 5301 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
CLDN9O95484 PGLYRP2-201ENST00000292609 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
CLDN9O95484 OPA1-205ENST00000361908 6439 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
CLDN9O95484 TONSL-201ENST00000409379 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
CLDN9O95484 VPS26B-201ENST00000281187 3691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
CLDN9O95484 ZFP82-201ENST00000392161 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
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CLDN9O95484 ANGPTL2-202ENST00000373425 3707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
CLDN9O95484 PLSCR1-214ENST00000487389 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
CLDN9O95484 TAF6-205ENST00000437822 2318 ntTSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
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CLDN9O95484 AP1G2-201ENST00000308724 3298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
CLDN9O95484 CD164L2-203ENST00000374030 993 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
CLDN9O95484 CD8B-204ENST00000393759 1096 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
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