Protein–RNA interactions for Protein: O43294

TGFB1I1, Transforming growth factor beta-1-induced transcript 1 protein, humanhuman

Predictions only

Length 461 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TGFB1I1O43294 TPO-215ENST00000539820 1157 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TGFB1I1O43294 ACTG1P17-201ENST00000558391 1119 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
TGFB1I1O43294 AC015660.1-201ENST00000560103 395 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TGFB1I1O43294 SSTR5-AS1-201ENST00000565992 575 ntTSL 4 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TGFB1I1O43294 MIR6787-201ENST00000616675 61 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
TGFB1I1O43294 AC091544.8-201ENST00000619490 361 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
TGFB1I1O43294 ENO2-201ENST00000229277 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TGFB1I1O43294 PDE2A-203ENST00000418754 2855 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TGFB1I1O43294 PLEKHA8-205ENST00000449726 7835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TGFB1I1O43294 RBP1-203ENST00000483943 1935 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TGFB1I1O43294 PAPD7-207ENST00000631941 1902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TGFB1I1O43294 ATP6V1H-201ENST00000355221 2365 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TGFB1I1O43294 MIOS-201ENST00000340080 3453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TGFB1I1O43294 LINC01873-201ENST00000428647 1679 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TGFB1I1O43294 DSTN-203ENST00000474024 1853 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TGFB1I1O43294 LRP10-201ENST00000359591 6886 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TGFB1I1O43294 HSP90AA1-201ENST00000216281 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TGFB1I1O43294 FAM8A1-201ENST00000259963 4677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TGFB1I1O43294 SEPT9-220ENST00000588690 2919 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TGFB1I1O43294 ELAVL2-201ENST00000223951 3763 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TGFB1I1O43294 ADAM12-201ENST00000368676 3313 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TGFB1I1O43294 SLFNL1-204ENST00000372613 2654 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TGFB1I1O43294 UHRF1-204ENST00000616255 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TGFB1I1O43294 FSTL4-207ENST00000621681 2660 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TGFB1I1O43294 DDC-207ENST00000444124 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TGFB1I1O43294 METTL13-203ENST00000367737 2865 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TGFB1I1O43294 ALPL-206ENST00000539907 2241 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TGFB1I1O43294 VASH2-204ENST00000366966 1369 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TGFB1I1O43294 MBD1-201ENST00000269468 3259 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TGFB1I1O43294 MROH1-201ENST00000326134 5183 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TGFB1I1O43294 SLC19A2-201ENST00000236137 3671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TGFB1I1O43294 ZNF609-202ENST00000416172 3863 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TGFB1I1O43294 TPM2-204ENST00000378300 1771 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TGFB1I1O43294 HERPUD1-203ENST00000379792 1782 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TGFB1I1O43294 FAAP100-201ENST00000327787 3627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TGFB1I1O43294 HIST3H2BB-201ENST00000620438 2364 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TGFB1I1O43294 NR6A1-205ENST00000487099 7031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TGFB1I1O43294 MTA1-202ENST00000405646 2709 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TGFB1I1O43294 NCKIPSD-204ENST00000416649 2925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TGFB1I1O43294 FAM198B-203ENST00000585682 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TGFB1I1O43294 IFNAR1-201ENST00000270139 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TGFB1I1O43294 AJUBA-201ENST00000262713 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TGFB1I1O43294 GFI1B-207ENST00000636137 1870 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TGFB1I1O43294 GPNMB-203ENST00000409458 1673 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TGFB1I1O43294 ARID3B-206ENST00000622429 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TGFB1I1O43294 OR1J1-201ENST00000259357 969 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TGFB1I1O43294 MBP-201ENST00000354542 575 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TGFB1I1O43294 OPN1MW2-201ENST00000369929 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TGFB1I1O43294 HDDC2-202ENST00000398153 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TGFB1I1O43294 BANF1P3-201ENST00000412556 261 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
TGFB1I1O43294 KRTAP19-9P-201ENST00000421795 191 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
TGFB1I1O43294 SPRY4-AS1-203ENST00000443800 566 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TGFB1I1O43294 BTNL8-205ENST00000505126 1294 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TGFB1I1O43294 ALG1L13P-202ENST00000519320 584 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
TGFB1I1O43294 HOXA10-AS-202ENST00000519935 1161 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TGFB1I1O43294 REC114-202ENST00000560581 833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TGFB1I1O43294 CMC2-204ENST00000562713 573 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TGFB1I1O43294 CMC2-209ENST00000565108 399 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TGFB1I1O43294 AC005901.1-201ENST00000592766 552 ntTSL 4 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TGFB1I1O43294 AC063977.3-201ENST00000597569 547 ntTSL 4 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TGFB1I1O43294 LINC01517-203ENST00000616194 908 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TGFB1I1O43294 SLC12A5-216ENST00000626701 617 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TGFB1I1O43294 MEX3A-202ENST00000532414 6124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TGFB1I1O43294 CNN1-201ENST00000252456 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TGFB1I1O43294 MOGAT2-201ENST00000198801 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TGFB1I1O43294 CTSL-201ENST00000340342 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TGFB1I1O43294 FUK-201ENST00000288078 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TGFB1I1O43294 ADAMTS18-201ENST00000282849 5913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TGFB1I1O43294 AC008620.2-201ENST00000510294 1569 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
TGFB1I1O43294 TGIF2-202ENST00000373874 3432 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TGFB1I1O43294 AC239799.1-201ENST00000612520 3411 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TGFB1I1O43294 CDH23-202ENST00000299366 3954 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TGFB1I1O43294 SFMBT1-201ENST00000394752 4548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TGFB1I1O43294 PBXIP1-202ENST00000368463 3212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TGFB1I1O43294 MAD1L1-204ENST00000406869 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TGFB1I1O43294 PCDHB13-201ENST00000341948 5061 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TGFB1I1O43294 NFATC4-207ENST00000553469 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TGFB1I1O43294 INPP5B-202ENST00000373023 4694 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TGFB1I1O43294 HSPA6-201ENST00000309758 2371 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TGFB1I1O43294 SLC25A31-201ENST00000281154 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TGFB1I1O43294 TDRD5-201ENST00000294848 3525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TGFB1I1O43294 GJB1-201ENST00000361726 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TGFB1I1O43294 LIMS2-206ENST00000409754 1620 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TGFB1I1O43294 RAB2A-201ENST00000262646 3848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TGFB1I1O43294 KDM1B-201ENST00000297792 3811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TGFB1I1O43294 C19orf33-201ENST00000301246 467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TGFB1I1O43294 GTSF1-201ENST00000305879 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TGFB1I1O43294 ESD-202ENST00000378720 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TGFB1I1O43294 BLCAP-204ENST00000397135 685 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TGFB1I1O43294 AC069277.1-202ENST00000414438 761 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TGFB1I1O43294 CALR4P-201ENST00000431943 946 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
TGFB1I1O43294 MFAP3-202ENST00000439768 1186 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TGFB1I1O43294 AC005077.2-201ENST00000449786 690 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
TGFB1I1O43294 DNAJC27-AS1-207ENST00000451291 488 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TGFB1I1O43294 MYL7-209ENST00000458240 791 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TGFB1I1O43294 LAMA5-AS1-203ENST00000478167 690 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TGFB1I1O43294 PHBP15-201ENST00000574228 665 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
TGFB1I1O43294 AC011479.1-202ENST00000591889 528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TGFB1I1O43294 RPL18A-204ENST00000599898 491 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TGFB1I1O43294 MIR6769A-201ENST00000617340 73 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.9 ms