Protein–RNA interactions for Protein: B5MD39

GGTLC3, Putative glutathione hydrolase light chain 3, humanhuman

Predictions only

Length 225 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GGTLC3B5MD39 RIC8B-209ENST00000549643 571 ntTSL 4 BASIC11.04□□□□□ -0.64
GGTLC3B5MD39 AC138123.2-203ENST00000552451 653 ntTSL 3 BASIC11.04□□□□□ -0.64
GGTLC3B5MD39 RRP7BP-205ENST00000566851 833 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
GGTLC3B5MD39 SLC25A3P1-206ENST00000569142 925 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
GGTLC3B5MD39 JPT2-214ENST00000569765 782 ntTSL 2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
GGTLC3B5MD39 AC015911.4-201ENST00000588022 1070 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
GGTLC3B5MD39 ASNA1-205ENST00000611688 1214 ntTSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
GGTLC3B5MD39 TBC1D3L-201ENST00000612727 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
GGTLC3B5MD39 AC015819.2-201ENST00000618730 555 ntTSL 3 BASIC11.04□□□□□ -0.64
GGTLC3B5MD39 TNRC18P1-201ENST00000502875 3650 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
GGTLC3B5MD39 RS1-201ENST00000379984 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
GGTLC3B5MD39 PDE9A-202ENST00000328862 1956 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
GGTLC3B5MD39 PDE9A-208ENST00000398225 1963 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
GGTLC3B5MD39 TMEM130-201ENST00000339375 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
GGTLC3B5MD39 GATA2-201ENST00000341105 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
GGTLC3B5MD39 AC007666.1-201ENST00000443935 1838 ntTSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
GGTLC3B5MD39 FOS-201ENST00000303562 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
GGTLC3B5MD39 PTPN6-202ENST00000399448 2159 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
GGTLC3B5MD39 DHX30-215ENST00000619982 3574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
GGTLC3B5MD39 SNX12-202ENST00000374274 2376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
GGTLC3B5MD39 DPEP2-202ENST00000393847 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
GGTLC3B5MD39 SNX19-213ENST00000534726 1656 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
GGTLC3B5MD39 MAPT-215ENST00000574436 1326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
GGTLC3B5MD39 COPS7B-203ENST00000373608 2563 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
GGTLC3B5MD39 MAP7D2-204ENST00000452324 2233 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
GGTLC3B5MD39 EIF3C-201ENST00000331666 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
GGTLC3B5MD39 C16orf45-202ENST00000452191 1865 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
GGTLC3B5MD39 FAM168B-202ENST00000409185 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
GGTLC3B5MD39 RNF214-201ENST00000300650 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
GGTLC3B5MD39 DDTL-201ENST00000215770 1545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
GGTLC3B5MD39 SGTB-201ENST00000381007 5469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
GGTLC3B5MD39 PAQR3-209ENST00000512733 9811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
GGTLC3B5MD39 GNG12-AS1-201ENST00000413628 2058 ntTSL 2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
GGTLC3B5MD39 FAM9C-205ENST00000542843 5858 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
GGTLC3B5MD39 TRAPPC10-201ENST00000291574 6976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
GGTLC3B5MD39 TAF12-201ENST00000263974 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
GGTLC3B5MD39 PRKCH-201ENST00000332981 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
GGTLC3B5MD39 AC102953.2-201ENST00000609755 3026 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
GGTLC3B5MD39 CCDC51-201ENST00000395694 1560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.03□□□□□ -0.64
GGTLC3B5MD39 R3HDM2-204ENST00000402412 4372 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
GGTLC3B5MD39 RPA2-203ENST00000373912 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
GGTLC3B5MD39 LINC01671-201ENST00000419628 1775 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
GGTLC3B5MD39 ALDH7A1-201ENST00000409134 4964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
GGTLC3B5MD39 HTR3A-201ENST00000299961 1994 ntTSL 2 BASIC11.03□□□□□ -0.64
GGTLC3B5MD39 C12orf76-201ENST00000309050 1964 ntTSL 2 BASIC11.03□□□□□ -0.64
GGTLC3B5MD39 AL117190.1-201ENST00000637474 1985 ntTSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
GGTLC3B5MD39 ZNF792-201ENST00000404801 3888 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.03□□□□□ -0.64
GGTLC3B5MD39 PCCB-215ENST00000482086 1436 ntTSL 3 BASIC11.03□□□□□ -0.64
GGTLC3B5MD39 ATP6V0E1-203ENST00000519374 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
GGTLC3B5MD39 RNF216-205ENST00000425013 5639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
GGTLC3B5MD39 ANGPTL2-201ENST00000373417 2575 ntTSL 2 BASIC11.03□□□□□ -0.64
GGTLC3B5MD39 AC036108.2-201ENST00000566974 2562 ntTSL 2 BASIC11.03□□□□□ -0.64
GGTLC3B5MD39 SCN2B-201ENST00000278947 5826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
GGTLC3B5MD39 RPGRIP1-202ENST00000400017 3940 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
GGTLC3B5MD39 CAMKK2-204ENST00000392473 2967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
GGTLC3B5MD39 LGALS12-204ENST00000415491 1816 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
GGTLC3B5MD39 MGAT1-205ENST00000446023 3175 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.03□□□□□ -0.64
GGTLC3B5MD39 NCOR2-201ENST00000356219 7226 ntTSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
GGTLC3B5MD39 CLUAP1-202ENST00000571025 5126 ntTSL 2 BASIC11.03□□□□□ -0.64
GGTLC3B5MD39 CEP85L-203ENST00000368491 7673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
GGTLC3B5MD39 ZBTB42-201ENST00000342537 3800 ntAPPRIS P1 BASIC11.03□□□□□ -0.64
GGTLC3B5MD39 PKIG-201ENST00000349959 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
GGTLC3B5MD39 MRPL55-208ENST00000366734 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.03□□□□□ -0.64
GGTLC3B5MD39 MRPL55-217ENST00000366746 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
GGTLC3B5MD39 NTMT1-201ENST00000372480 852 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.03□□□□□ -0.64
GGTLC3B5MD39 PKIG-202ENST00000372886 1180 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.03□□□□□ -0.64
GGTLC3B5MD39 PIR-201ENST00000380420 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
GGTLC3B5MD39 TMEM26-AS1-201ENST00000389640 863 ntTSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
GGTLC3B5MD39 AP001062.3-201ENST00000422357 704 ntTSL 2 BASIC11.03□□□□□ -0.64
GGTLC3B5MD39 TSEN15P1-201ENST00000423257 515 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
GGTLC3B5MD39 LINC00229-201ENST00000443783 500 ntTSL 2 BASIC11.03□□□□□ -0.64
GGTLC3B5MD39 AP006288.1-201ENST00000446065 395 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
GGTLC3B5MD39 LINC01160-202ENST00000450155 894 ntTSL 3 BASIC11.03□□□□□ -0.64
GGTLC3B5MD39 SNHG14-209ENST00000456576 544 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
GGTLC3B5MD39 HSPB7-207ENST00000487046 844 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
GGTLC3B5MD39 TIMM8B-201ENST00000504148 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
GGTLC3B5MD39 SERF1B-208ENST00000515588 792 ntTSL 2 BASIC11.03□□□□□ -0.64
GGTLC3B5MD39 LINC01605-204ENST00000522718 1093 ntTSL 3 BASIC11.03□□□□□ -0.64
GGTLC3B5MD39 WDR88-203ENST00000592765 651 ntTSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
GGTLC3B5MD39 AC011466.1-201ENST00000595201 566 ntTSL 4 BASIC11.03□□□□□ -0.64
GGTLC3B5MD39 AC010615.2-202ENST00000597444 832 ntTSL 3 BASIC11.03□□□□□ -0.64
GGTLC3B5MD39 APOBEC3H-206ENST00000613677 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
GGTLC3B5MD39 AC138466.3-201ENST00000619983 221 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
GGTLC3B5MD39 CKMT2-203ENST00000437669 1479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
GGTLC3B5MD39 MBP-205ENST00000397860 4844 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
GGTLC3B5MD39 PLAG1-203ENST00000429357 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
GGTLC3B5MD39 AC009093.2-202ENST00000620513 2079 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
GGTLC3B5MD39 TICAM1-201ENST00000248244 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
GGTLC3B5MD39 SHC1-202ENST00000368445 3472 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
GGTLC3B5MD39 CCT6P3-201ENST00000419314 3702 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
GGTLC3B5MD39 HERC5-201ENST00000264350 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
GGTLC3B5MD39 TRPM5-202ENST00000528453 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
GGTLC3B5MD39 HERPUD1-204ENST00000439977 2946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
GGTLC3B5MD39 C17orf53-203ENST00000585683 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.03□□□□□ -0.64
GGTLC3B5MD39 FAM212B-AS1-201ENST00000430373 2131 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
GGTLC3B5MD39 LILRA1-201ENST00000251372 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
GGTLC3B5MD39 GHET1-201ENST00000627071 1906 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
GGTLC3B5MD39 GALNT4-201ENST00000529983 5399 ntAPPRIS P1 BASIC11.03□□□□□ -0.64
GGTLC3B5MD39 AC108024.1-201ENST00000626286 1721 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
GGTLC3B5MD39 WDR45-224ENST00000485908 1301 ntTSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.5 ms