Protein–RNA interactions for Protein: Q9P232

CNTN3, Contactin-3, humanhuman

Predictions only

Length 1,028 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNTN3Q9P232 PTPRO-202ENST00000348962 5061 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CNTN3Q9P232 ELMSAN1-202ENST00000394071 7721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CNTN3Q9P232 SYT13-201ENST00000020926 5144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CNTN3Q9P232 AICDA-201ENST00000229335 2819 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CNTN3Q9P232 HARS2-201ENST00000230771 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CNTN3Q9P232 PLXNC1-201ENST00000258526 7346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CNTN3Q9P232 MED4-201ENST00000258648 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CNTN3Q9P232 CMTM1-201ENST00000328020 981 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CNTN3Q9P232 LIN9-201ENST00000328205 3567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CNTN3Q9P232 CMTM1-202ENST00000332695 624 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CNTN3Q9P232 EPB41L3-201ENST00000341928 4706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CNTN3Q9P232 SEZ6L-202ENST00000343706 2898 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CNTN3Q9P232 SPAG11A-203ENST00000351436 534 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CNTN3Q9P232 SPOCK3-202ENST00000357545 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CNTN3Q9P232 SPAG11B-204ENST00000361111 534 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CNTN3Q9P232 CMTM1-205ENST00000379500 1064 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CNTN3Q9P232 CSAD-203ENST00000379846 1962 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CNTN3Q9P232 PIGS-203ENST00000395346 2815 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CNTN3Q9P232 ATF4-202ENST00000396680 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CNTN3Q9P232 CAB39L-204ENST00000409130 1411 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CNTN3Q9P232 FXNP2-201ENST00000411625 547 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
CNTN3Q9P232 LINC00265-2P-201ENST00000413372 782 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
CNTN3Q9P232 AL137058.1-201ENST00000418237 673 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CNTN3Q9P232 GDAP1-202ENST00000434412 1228 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CNTN3Q9P232 GPAT2-202ENST00000434632 3061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CNTN3Q9P232 SLC5A4-AS1-201ENST00000434942 876 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CNTN3Q9P232 AL136361.1-201ENST00000435429 506 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CNTN3Q9P232 KYAT1-205ENST00000436267 2487 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CNTN3Q9P232 PISD-209ENST00000439502 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CNTN3Q9P232 AC098934.1-203ENST00000442868 1262 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
CNTN3Q9P232 TDRD5-204ENST00000444136 3946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CNTN3Q9P232 AC098935.1-201ENST00000446057 611 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
CNTN3Q9P232 NOX5-203ENST00000448182 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CNTN3Q9P232 IMPA1-203ENST00000449740 1180 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CNTN3Q9P232 AL355376.1-201ENST00000456082 517 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CNTN3Q9P232 TIMP1-205ENST00000456754 1095 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CNTN3Q9P232 AC011247.2-201ENST00000457097 233 ntTSL 4 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CNTN3Q9P232 PGAP2-224ENST00000490830 810 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CNTN3Q9P232 SH3BP2-207ENST00000503393 9158 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CNTN3Q9P232 AC105254.1-201ENST00000507782 621 ntTSL 4 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CNTN3Q9P232 AC010255.3-203ENST00000509403 1727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CNTN3Q9P232 AC010285.2-201ENST00000510240 569 ntTSL 4 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CNTN3Q9P232 CMTM1-209ENST00000528324 749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CNTN3Q9P232 RTN4RL2-203ENST00000533205 637 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CNTN3Q9P232 CMTM1-217ENST00000533666 493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CNTN3Q9P232 SNX19-213ENST00000534726 1656 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CNTN3Q9P232 SPATS2-203ENST00000547865 1810 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CNTN3Q9P232 CRADD-205ENST00000548483 1056 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CNTN3Q9P232 AC138701.2-201ENST00000553634 226 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
CNTN3Q9P232 DUT-208ENST00000559540 1441 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CNTN3Q9P232 AC010531.4-203ENST00000561709 660 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CNTN3Q9P232 COX4I1-208ENST00000564903 1481 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CNTN3Q9P232 MT3-203ENST00000565838 421 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CNTN3Q9P232 MIR3147-201ENST00000577811 66 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
CNTN3Q9P232 PARD6G-AS1-205ENST00000589574 647 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CNTN3Q9P232 AC242426.4-201ENST00000606856 573 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CNTN3Q9P232 GP1BA-202ENST00000611961 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CNTN3Q9P232 PCGF2-203ENST00000616129 1534 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CNTN3Q9P232 ZSCAN32-215ENST00000618425 2788 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CNTN3Q9P232 NR2F2-AS1-215ENST00000620029 1223 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CNTN3Q9P232 AC006372.4-201ENST00000624122 1543 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
CNTN3Q9P232 TDRD6-201ENST00000316081 6817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CNTN3Q9P232 SHH-201ENST00000297261 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CNTN3Q9P232 CAMSAP3-202ENST00000446248 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CNTN3Q9P232 FAM110C-201ENST00000327669 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CNTN3Q9P232 UBC-205ENST00000536769 3745 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CNTN3Q9P232 TOP3B-201ENST00000357179 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CNTN3Q9P232 ADORA2A-AS1-201ENST00000326341 2557 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CNTN3Q9P232 TRMT1-217ENST00000592062 2579 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CNTN3Q9P232 GOLGA8VP-201ENST00000559009 1798 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
CNTN3Q9P232 COL6A2-202ENST00000310645 3446 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CNTN3Q9P232 TAGLN2-202ENST00000368096 1603 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CNTN3Q9P232 TAGLN2-203ENST00000368097 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CNTN3Q9P232 RNF150-201ENST00000306799 4535 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CNTN3Q9P232 GCFC2-201ENST00000321027 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CNTN3Q9P232 NFATC4-226ENST00000556279 2924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CNTN3Q9P232 ZBTB17-202ENST00000375743 2745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CNTN3Q9P232 NAA60-202ENST00000407558 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CNTN3Q9P232 NRP2-205ENST00000412873 2730 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CNTN3Q9P232 KANK2-201ENST00000586659 5162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CNTN3Q9P232 PPIL2-202ENST00000398831 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CNTN3Q9P232 NDUFB8-201ENST00000299166 671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CNTN3Q9P232 MRPS22-201ENST00000310776 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CNTN3Q9P232 PEA15-203ENST00000368077 1021 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CNTN3Q9P232 MAPK13-202ENST00000373759 1036 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CNTN3Q9P232 HLA-DMA-203ENST00000395305 777 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
CNTN3Q9P232 HPGD-203ENST00000422112 805 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CNTN3Q9P232 TALDO1-203ENST00000528097 1231 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CNTN3Q9P232 NDUFC2-KCTD14-202ENST00000530054 656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CNTN3Q9P232 IGHV3OR16-12-201ENST00000570121 353 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CNTN3Q9P232 PGPEP1-203ENST00000595066 762 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CNTN3Q9P232 DYRK1B-208ENST00000601972 772 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CNTN3Q9P232 SPCS2P2-201ENST00000603270 608 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
CNTN3Q9P232 HIST1H3C-201ENST00000612966 411 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CNTN3Q9P232 KRT33A-201ENST00000007735 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CNTN3Q9P232 TARSL2-201ENST00000335968 3610 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CNTN3Q9P232 MFSD4B-201ENST00000368847 5958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CNTN3Q9P232 CRACR2A-201ENST00000252322 2186 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CNTN3Q9P232 NAALADL1-202ENST00000355721 2100 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CNTN3Q9P232 ACSM1-201ENST00000307493 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 78.5 ms