Protein–RNA interactions for Protein: Q96DM1

PGBD4, PiggyBac transposable element-derived protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 585 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGBD4Q96DM1 SH2D3C-206ENST00000429553 2794 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PGBD4Q96DM1 KMT2E-202ENST00000311117 6874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PGBD4Q96DM1 LHFPL2-207ENST00000515007 4680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PGBD4Q96DM1 GDF11-201ENST00000257868 8657 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PGBD4Q96DM1 KATNBL1-201ENST00000256544 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PGBD4Q96DM1 PES1-201ENST00000335214 1988 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PGBD4Q96DM1 DYDC1-201ENST00000372202 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PGBD4Q96DM1 SYNGR1-204ENST00000381535 1295 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PGBD4Q96DM1 IGHV4-39-201ENST00000390619 425 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PGBD4Q96DM1 AL139241.1-201ENST00000433374 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PGBD4Q96DM1 AC105254.1-201ENST00000507782 621 ntTSL 4 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PGBD4Q96DM1 RTN4RL2-203ENST00000533205 637 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PGBD4Q96DM1 MT3-203ENST00000565838 421 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PGBD4Q96DM1 TMEM205-216ENST00000593256 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PGBD4Q96DM1 AC010422.5-201ENST00000597961 585 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PGBD4Q96DM1 SIGLEC22P-201ENST00000599104 714 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
PGBD4Q96DM1 SIGLEC22P-202ENST00000602065 544 ntTSL 4 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PGBD4Q96DM1 AC242426.4-201ENST00000606856 573 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PGBD4Q96DM1 ANXA8L1-206ENST00000619162 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PGBD4Q96DM1 LINC00969-294ENST00000627609 992 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PGBD4Q96DM1 ABCA7-201ENST00000263094 6816 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PGBD4Q96DM1 GPR83-201ENST00000243673 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PGBD4Q96DM1 S1PR2-201ENST00000590320 3582 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PGBD4Q96DM1 METTL17-201ENST00000339374 1749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PGBD4Q96DM1 MOCS1-205ENST00000373195 2852 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PGBD4Q96DM1 NAA60-203ENST00000414063 2619 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PGBD4Q96DM1 GLIPR1L2-204ENST00000550916 2609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PGBD4Q96DM1 ATL3-203ENST00000538786 1920 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PGBD4Q96DM1 ARMCX6-208ENST00000539247 1928 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PGBD4Q96DM1 ITGBL1-207ENST00000622834 2369 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PGBD4Q96DM1 CDCA2-201ENST00000330560 3731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PGBD4Q96DM1 CD8A-203ENST00000409511 3048 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PGBD4Q96DM1 DSE-202ENST00000359564 4037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PGBD4Q96DM1 TELO2-201ENST00000262319 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PGBD4Q96DM1 TMPRSS6-202ENST00000381792 3260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PGBD4Q96DM1 OR2V1-205ENST00000642036 2609 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PGBD4Q96DM1 CUX1-215ENST00000556210 4044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PGBD4Q96DM1 SERHL-201ENST00000359906 1346 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PGBD4Q96DM1 UBE2V2-205ENST00000521346 1322 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PGBD4Q96DM1 COLCA2-202ENST00000526216 1332 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PGBD4Q96DM1 PCDH10-203ENST00000618019 4574 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PGBD4Q96DM1 RUSC1-202ENST00000368347 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PGBD4Q96DM1 PEX26-205ENST00000610387 3924 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PGBD4Q96DM1 CTTN-202ENST00000346329 3272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PGBD4Q96DM1 CCDC169-SOHLH2-201ENST00000511166 2051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PGBD4Q96DM1 CCDC43-203ENST00000588210 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PGBD4Q96DM1 OPRM1-201ENST00000229768 1465 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PGBD4Q96DM1 OPRM1-207ENST00000428397 1481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PGBD4Q96DM1 IL17B-201ENST00000261796 696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PGBD4Q96DM1 PSMB10-201ENST00000358514 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PGBD4Q96DM1 SAT1-201ENST00000379251 801 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PGBD4Q96DM1 SAT1-202ENST00000379253 909 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PGBD4Q96DM1 SAT1-203ENST00000379254 868 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PGBD4Q96DM1 SAT1-204ENST00000379270 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PGBD4Q96DM1 AC013448.2-201ENST00000440341 787 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PGBD4Q96DM1 AC098934.1-203ENST00000442868 1262 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
PGBD4Q96DM1 BUD31-205ENST00000456893 512 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PGBD4Q96DM1 RPL18AP3-201ENST00000462885 528 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
PGBD4Q96DM1 CD164-210ENST00000512821 964 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PGBD4Q96DM1 AC246817.2-203ENST00000517357 569 ntTSL 4 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PGBD4Q96DM1 AC246817.2-202ENST00000519393 564 ntTSL 4 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PGBD4Q96DM1 NACA-221ENST00000552540 1074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PGBD4Q96DM1 AC005696.1-201ENST00000572876 443 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PGBD4Q96DM1 MIR4649-201ENST00000582839 64 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
PGBD4Q96DM1 LGALS9C-215ENST00000584941 1104 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PGBD4Q96DM1 AP000322.3-201ENST00000608665 388 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
PGBD4Q96DM1 AC084781.1-201ENST00000613737 656 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
PGBD4Q96DM1 HIST1H4I-201ENST00000615353 1294 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PGBD4Q96DM1 SNRPA1-216ENST00000626000 539 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PGBD4Q96DM1 C15orf52-206ENST00000559313 3022 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PGBD4Q96DM1 ZBED1-201ENST00000381218 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PGBD4Q96DM1 AC067750.1-201ENST00000608826 6545 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
PGBD4Q96DM1 PTK7-210ENST00000471863 2412 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PGBD4Q96DM1 SOGA3-201ENST00000465909 3756 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PGBD4Q96DM1 HCK-209ENST00000538448 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PGBD4Q96DM1 LIN9-201ENST00000328205 3567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PGBD4Q96DM1 MEGF11-203ENST00000409699 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PGBD4Q96DM1 KCTD1-207ENST00000580059 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PGBD4Q96DM1 LINC01815-202ENST00000641468 1409 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
PGBD4Q96DM1 GALNTL6-205ENST00000511251 2905 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PGBD4Q96DM1 COL25A1-203ENST00000399132 2724 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PGBD4Q96DM1 SCLY-202ENST00000409736 1774 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PGBD4Q96DM1 PPM1F-201ENST00000263212 5143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PGBD4Q96DM1 DLX6-202ENST00000518156 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PGBD4Q96DM1 UCKL1-AS1-201ENST00000623569 3602 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
PGBD4Q96DM1 CYP4F11-202ENST00000326742 2877 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PGBD4Q96DM1 DBR1-201ENST00000260803 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PGBD4Q96DM1 IMPACT-201ENST00000284202 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PGBD4Q96DM1 ZNF333-209ENST00000601134 1392 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PGBD4Q96DM1 HIST1H2AG-201ENST00000359193 2250 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PGBD4Q96DM1 AC092053.3-201ENST00000641308 4975 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
PGBD4Q96DM1 AC138761.4-201ENST00000578881 1514 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PGBD4Q96DM1 TNFRSF11A-202ENST00000586569 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PGBD4Q96DM1 USP38-202ENST00000510377 4135 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PGBD4Q96DM1 PXDNL-201ENST00000356297 4805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PGBD4Q96DM1 TNFSF13-201ENST00000338784 1971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PGBD4Q96DM1 SRRD-201ENST00000215917 4020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PGBD4Q96DM1 PPFIBP1-216ENST00000545334 2805 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PGBD4Q96DM1 MAGI1-201ENST00000330909 7415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PGBD4Q96DM1 AL590132.1-202ENST00000638983 4184 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.2 ms