Protein–RNA interactions for Protein: Q8NCT1

ARRDC4, Arrestin domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 418 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARRDC4Q8NCT1 AC068057.1-201ENST00000453322 709 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ARRDC4Q8NCT1 LINC01056-201ENST00000455711 1234 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ARRDC4Q8NCT1 AC078785.1-204ENST00000460707 764 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ARRDC4Q8NCT1 AC025186.1-201ENST00000478174 870 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
ARRDC4Q8NCT1 C21orf62-204ENST00000490358 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ARRDC4Q8NCT1 AC093300.1-201ENST00000510368 1201 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
ARRDC4Q8NCT1 NR4A1-209ENST00000548232 1101 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ARRDC4Q8NCT1 TPM1-220ENST00000559556 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ARRDC4Q8NCT1 PPCDC-206ENST00000564923 757 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ARRDC4Q8NCT1 AC018846.1-201ENST00000568231 183 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
ARRDC4Q8NCT1 AC115099.1-201ENST00000570413 362 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ARRDC4Q8NCT1 ANAPC11-206ENST00000571874 636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ARRDC4Q8NCT1 KXD1-211ENST00000599319 707 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ARRDC4Q8NCT1 AC104506.1-201ENST00000609247 429 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
ARRDC4Q8NCT1 ADAMTS9-AS1-216ENST00000626280 882 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ARRDC4Q8NCT1 OSMR-AS1-204ENST00000636516 850 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ARRDC4Q8NCT1 AC015712.6-201ENST00000431060 5068 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ARRDC4Q8NCT1 KIFC3-205ENST00000540079 2781 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ARRDC4Q8NCT1 LRFN2-201ENST00000338305 3270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ARRDC4Q8NCT1 LEF1-202ENST00000379951 3477 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ARRDC4Q8NCT1 TMPO-203ENST00000343315 2465 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ARRDC4Q8NCT1 RAVER2-202ENST00000371072 4362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ARRDC4Q8NCT1 FBN1-205ENST00000560355 4109 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ARRDC4Q8NCT1 EIF4G1-209ENST00000414031 5569 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ARRDC4Q8NCT1 LATS2-201ENST00000382592 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ARRDC4Q8NCT1 UBE3B-202ENST00000342494 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ARRDC4Q8NCT1 MYB-201ENST00000316528 3571 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ARRDC4Q8NCT1 MYB-241ENST00000616088 3573 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ARRDC4Q8NCT1 BLMH-201ENST00000261714 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ARRDC4Q8NCT1 ITGBL1-207ENST00000622834 2369 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ARRDC4Q8NCT1 ARAP2-201ENST00000303965 7514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ARRDC4Q8NCT1 CYB561A3-203ENST00000447532 1803 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ARRDC4Q8NCT1 LINC02395-201ENST00000546821 3157 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ARRDC4Q8NCT1 FAM227B-212ENST00000561064 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ARRDC4Q8NCT1 BBS1-202ENST00000393994 1790 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ARRDC4Q8NCT1 STAG1-206ENST00000480733 1304 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ARRDC4Q8NCT1 AC013472.1-203ENST00000380387 1966 ntTSL 4 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ARRDC4Q8NCT1 GARS-201ENST00000389266 2634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ARRDC4Q8NCT1 FAM96A-203ENST00000557835 1536 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ARRDC4Q8NCT1 BTBD11-204ENST00000420571 3478 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ARRDC4Q8NCT1 WDR46-231ENST00000374617 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ARRDC4Q8NCT1 ATP5A1-201ENST00000282050 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ARRDC4Q8NCT1 CTSD-201ENST00000236671 2123 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ARRDC4Q8NCT1 BTBD3-201ENST00000254977 4686 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ARRDC4Q8NCT1 TNNT3-201ENST00000278317 1210 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ARRDC4Q8NCT1 SSR4-202ENST00000370085 526 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ARRDC4Q8NCT1 SNRPC-202ENST00000374017 1054 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ARRDC4Q8NCT1 TNNT3-207ENST00000381589 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ARRDC4Q8NCT1 ABCD1P4-201ENST00000399687 604 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
ARRDC4Q8NCT1 LINC01278-201ENST00000433061 529 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ARRDC4Q8NCT1 AP001057.1-201ENST00000437557 799 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ARRDC4Q8NCT1 RNLS-203ENST00000437752 525 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ARRDC4Q8NCT1 AL356218.1-201ENST00000450864 353 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ARRDC4Q8NCT1 AC074050.2-201ENST00000563338 538 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ARRDC4Q8NCT1 AC132825.4-202ENST00000578792 434 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
ARRDC4Q8NCT1 RN7SL121P-201ENST00000584223 273 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
ARRDC4Q8NCT1 AC093503.1-201ENST00000593888 495 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ARRDC4Q8NCT1 AL451165.2-201ENST00000606971 718 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ARRDC4Q8NCT1 LINC01278-206ENST00000610088 554 ntTSL 4 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ARRDC4Q8NCT1 MIR6816-201ENST00000620368 66 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
ARRDC4Q8NCT1 PSMA6-215ENST00000622405 978 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ARRDC4Q8NCT1 PFDN5-220ENST00000628881 231 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ARRDC4Q8NCT1 UBAC2-202ENST00000376440 2525 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ARRDC4Q8NCT1 AQP1-204ENST00000441328 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ARRDC4Q8NCT1 POFUT2-214ENST00000615172 2472 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ARRDC4Q8NCT1 TARBP2-202ENST00000394357 1402 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ARRDC4Q8NCT1 AC138761.6-201ENST00000583997 1423 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
ARRDC4Q8NCT1 RNF34-211ENST00000613529 1449 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ARRDC4Q8NCT1 AC060234.2-201ENST00000428825 1610 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ARRDC4Q8NCT1 ZNF556-202ENST00000586426 1643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ARRDC4Q8NCT1 CSTB-201ENST00000291568 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ARRDC4Q8NCT1 TMEM230-202ENST00000342308 1562 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ARRDC4Q8NCT1 MED7-202ENST00000420343 1382 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ARRDC4Q8NCT1 FGR-203ENST00000374005 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ARRDC4Q8NCT1 DEGS1-201ENST00000323699 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ARRDC4Q8NCT1 WIZ-207ENST00000599910 4609 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ARRDC4Q8NCT1 GPKOW-201ENST00000156109 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ARRDC4Q8NCT1 BNIP2-201ENST00000267859 6325 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ARRDC4Q8NCT1 RPS6KL1-201ENST00000354625 5195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ARRDC4Q8NCT1 CTSV-201ENST00000259470 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ARRDC4Q8NCT1 COQ4-201ENST00000300452 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ARRDC4Q8NCT1 ZNF575-202ENST00000458714 2285 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ARRDC4Q8NCT1 AC064801.2-201ENST00000625052 1303 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
ARRDC4Q8NCT1 NEBL-203ENST00000417816 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ARRDC4Q8NCT1 CNPPD1-202ENST00000409789 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ARRDC4Q8NCT1 CTNNB1-210ENST00000453024 2841 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ARRDC4Q8NCT1 SLC25A36-203ENST00000446041 4638 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ARRDC4Q8NCT1 DGKI-201ENST00000288490 3895 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ARRDC4Q8NCT1 AC138517.2-201ENST00000637503 2594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ARRDC4Q8NCT1 TMEM14C-201ENST00000229563 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ARRDC4Q8NCT1 RPL10-202ENST00000369817 1284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ARRDC4Q8NCT1 OPN1MW2-201ENST00000369929 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ARRDC4Q8NCT1 GEMIN8P4-201ENST00000380526 729 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
ARRDC4Q8NCT1 TEX33-201ENST00000381821 978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ARRDC4Q8NCT1 AC092570.1-201ENST00000414446 469 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
ARRDC4Q8NCT1 AC073210.1-201ENST00000414799 232 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
ARRDC4Q8NCT1 IFI35-204ENST00000438323 1232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ARRDC4Q8NCT1 STK24P1-201ENST00000455035 1291 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
ARRDC4Q8NCT1 AC005486.1-201ENST00000466775 216 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ARRDC4Q8NCT1 RN7SL128P-201ENST00000467883 305 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
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