Protein–RNA interactions for Protein: Q8N3C7

CLIP4, CAP-Gly domain-containing linker protein 4, humanhuman

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Length 705 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLIP4Q8N3C7 SPRY1-208ENST00000622283 2352 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
CLIP4Q8N3C7 DNMT3L-201ENST00000270172 1706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
CLIP4Q8N3C7 CENPK-202ENST00000396679 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
CLIP4Q8N3C7 NUP98-204ENST00000397004 3923 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
CLIP4Q8N3C7 CYTH1-215ENST00000591455 3286 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
CLIP4Q8N3C7 STK33-203ENST00000396672 2558 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
CLIP4Q8N3C7 TUBGCP4-201ENST00000260383 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
CLIP4Q8N3C7 FAM83A-201ENST00000276699 1858 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
CLIP4Q8N3C7 CDH3-201ENST00000264012 4929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
CLIP4Q8N3C7 RIPOR3-202ENST00000327979 4377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
CLIP4Q8N3C7 MAP7-202ENST00000432797 4375 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
CLIP4Q8N3C7 ROPN1-206ENST00000479867 2056 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
CLIP4Q8N3C7 KCNV1-201ENST00000297404 2927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
CLIP4Q8N3C7 MOGAT3-201ENST00000223114 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
CLIP4Q8N3C7 NCR1-201ENST00000291890 1155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
CLIP4Q8N3C7 CSF2-201ENST00000296871 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
CLIP4Q8N3C7 DYNLRB2-201ENST00000305904 497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
CLIP4Q8N3C7 VCX2-201ENST00000317103 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
CLIP4Q8N3C7 NCR1-202ENST00000338835 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
CLIP4Q8N3C7 LINC01116-202ENST00000339037 838 ntTSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
CLIP4Q8N3C7 WDR54-201ENST00000348227 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
CLIP4Q8N3C7 NCR1-203ENST00000350790 739 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
CLIP4Q8N3C7 AC011450.1-202ENST00000358234 573 ntTSL 4 BASIC13.53□□□□□ -0.24
CLIP4Q8N3C7 S100A16-201ENST00000368703 946 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
CLIP4Q8N3C7 SNCA-205ENST00000394991 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
CLIP4Q8N3C7 MPV17-205ENST00000402310 906 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
CLIP4Q8N3C7 TPM1-207ENST00000403994 1049 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
CLIP4Q8N3C7 C2orf27AP3-201ENST00000434123 579 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
CLIP4Q8N3C7 AP000552.1-208ENST00000452952 576 ntTSL 4 BASIC13.53□□□□□ -0.24
CLIP4Q8N3C7 AL353747.3-201ENST00000454185 579 ntTSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
CLIP4Q8N3C7 NUTM2A-AS1-212ENST00000458739 733 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
CLIP4Q8N3C7 MAATS1-203ENST00000463700 939 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
CLIP4Q8N3C7 KCNK16-205ENST00000507712 889 ntTSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
CLIP4Q8N3C7 SLC45A2-204ENST00000509381 1040 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
CLIP4Q8N3C7 AP005018.1-201ENST00000525475 301 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
CLIP4Q8N3C7 OVOL1-AS1-202ENST00000532454 494 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
CLIP4Q8N3C7 ANAPC15-214ENST00000543587 883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
CLIP4Q8N3C7 MAX-211ENST00000555667 574 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
CLIP4Q8N3C7 AC093525.1-201ENST00000569317 596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
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CLIP4Q8N3C7 RBP1-207ENST00000619087 516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
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CLIP4Q8N3C7 CD27-201ENST00000266557 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
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CLIP4Q8N3C7 FAM153A-220ENST00000513554 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
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CLIP4Q8N3C7 PAK3-208ENST00000446737 2550 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
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CLIP4Q8N3C7 AAR2-202ENST00000373932 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
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CLIP4Q8N3C7 ZIK1-204ENST00000597850 4181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
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CLIP4Q8N3C7 NFYC-215ENST00000456393 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
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CLIP4Q8N3C7 GPR17-202ENST00000393018 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
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CLIP4Q8N3C7 FP565260.6-205ENST00000624120 898 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
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CLIP4Q8N3C7 DHPS-201ENST00000210060 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
CLIP4Q8N3C7 CRY2-202ENST00000443527 4203 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
CLIP4Q8N3C7 CREB3L4-202ENST00000368600 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
CLIP4Q8N3C7 SEZ6-201ENST00000317338 4471 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
CLIP4Q8N3C7 SMAD2-212ENST00000591214 1714 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
CLIP4Q8N3C7 CSRP1-201ENST00000340006 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
CLIP4Q8N3C7 TM9SF1-202ENST00000396854 2055 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
CLIP4Q8N3C7 BEND7-201ENST00000341083 2239 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
CLIP4Q8N3C7 UACA-201ENST00000322954 6939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
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