Protein–RNA interactions for Protein: Q71RG4

TMUB2, Transmembrane and ubiquitin-like domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 321 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMUB2Q71RG4 LGR5-202ENST00000536515 2664 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
TMUB2Q71RG4 MRVI1-202ENST00000424001 5815 ntTSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
TMUB2Q71RG4 WSCD2-201ENST00000332082 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
TMUB2Q71RG4 POLL-202ENST00000339310 2289 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
TMUB2Q71RG4 AAGAB-207ENST00000561452 2251 ntTSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
TMUB2Q71RG4 C1QTNF9-201ENST00000332018 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
TMUB2Q71RG4 CHD1L-202ENST00000369258 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
TMUB2Q71RG4 CREB3L3-204ENST00000602147 1382 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
TMUB2Q71RG4 SLC4A2-204ENST00000461735 4387 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
TMUB2Q71RG4 AC000068.1-201ENST00000431090 2097 ntTSL 2 BASIC11.79□□□□□ -0.52
TMUB2Q71RG4 SRC-204ENST00000373578 4630 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
TMUB2Q71RG4 RMND1-202ENST00000367303 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
TMUB2Q71RG4 SARS-202ENST00000369923 1882 ntTSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
TMUB2Q71RG4 TMEM246-202ENST00000374848 4244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
TMUB2Q71RG4 EMBP1-203ENST00000622787 4235 ntTSL 2 BASIC11.78□□□□□ -0.52
TMUB2Q71RG4 GRIK5-202ENST00000301218 3310 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
TMUB2Q71RG4 OTOL1-201ENST00000327928 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.78□□□□□ -0.52
TMUB2Q71RG4 TRMT2B-202ENST00000372936 3327 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
TMUB2Q71RG4 KSR1-216ENST00000582410 2392 ntTSL 2 BASIC11.78□□□□□ -0.52
TMUB2Q71RG4 EEF2K-201ENST00000263026 7388 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
TMUB2Q71RG4 KCNC2-201ENST00000298972 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
TMUB2Q71RG4 MME-204ENST00000462745 3590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
TMUB2Q71RG4 STAT3-202ENST00000389272 2615 ntTSL 2 BASIC11.78□□□□□ -0.52
TMUB2Q71RG4 RTN4IP1-201ENST00000369063 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
TMUB2Q71RG4 DGKD-202ENST00000409813 6228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
TMUB2Q71RG4 HEXA-201ENST00000268097 5252 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
TMUB2Q71RG4 TOP3B-202ENST00000398793 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
TMUB2Q71RG4 CTAGE10P-201ENST00000318353 2408 ntBASIC11.78□□□□□ -0.52
TMUB2Q71RG4 ADAMTS10-211ENST00000597188 3749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
TMUB2Q71RG4 STXBP5L-201ENST00000273666 9496 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
TMUB2Q71RG4 QRICH1-204ENST00000424300 3009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.78□□□□□ -0.52
TMUB2Q71RG4 TMEM30A-203ENST00000475111 2791 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
TMUB2Q71RG4 TCF12-201ENST00000267811 6061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
TMUB2Q71RG4 TPM2-204ENST00000378300 1771 ntTSL 3 BASIC11.78□□□□□ -0.52
TMUB2Q71RG4 TMEM14A-201ENST00000211314 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
TMUB2Q71RG4 PXMP4-201ENST00000217398 979 ntTSL 2 BASIC11.78□□□□□ -0.52
TMUB2Q71RG4 ATP23-201ENST00000300145 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
TMUB2Q71RG4 C11orf88-201ENST00000332814 795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
TMUB2Q71RG4 BLZF1-202ENST00000367807 1295 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
TMUB2Q71RG4 TFAMP1-201ENST00000412727 736 ntBASIC11.78□□□□□ -0.52
TMUB2Q71RG4 AC008105.2-201ENST00000420431 579 ntTSL 4 BASIC11.78□□□□□ -0.52
TMUB2Q71RG4 ISOC2-202ENST00000425675 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
TMUB2Q71RG4 HNRNPDP1-201ENST00000439535 754 ntBASIC11.78□□□□□ -0.52
TMUB2Q71RG4 AL611929.1-201ENST00000457340 449 ntTSL 3 BASIC11.78□□□□□ -0.52
TMUB2Q71RG4 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC11.78□□□□□ -0.52
TMUB2Q71RG4 SMIM15-AS1-201ENST00000506902 796 ntTSL 3 BASIC11.78□□□□□ -0.52
TMUB2Q71RG4 MRPL49-206ENST00000531705 489 ntTSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
TMUB2Q71RG4 AC131206.1-201ENST00000538078 1211 ntBASIC11.78□□□□□ -0.52
TMUB2Q71RG4 NME3-204ENST00000563498 920 ntTSL 2 BASIC11.78□□□□□ -0.52
TMUB2Q71RG4 INO80E-210ENST00000567705 880 ntTSL 3 BASIC11.78□□□□□ -0.52
TMUB2Q71RG4 FAM220A-205ENST00000578372 207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
TMUB2Q71RG4 CIZ1-205ENST00000372948 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.78□□□□□ -0.52
TMUB2Q71RG4 EBF1-201ENST00000313708 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
TMUB2Q71RG4 PRMT7-201ENST00000339507 4238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.78□□□□□ -0.52
TMUB2Q71RG4 ZNF331-201ENST00000253144 5042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
TMUB2Q71RG4 DHRS4L2-205ENST00000543805 1334 ntTSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
TMUB2Q71RG4 USP33-203ENST00000370793 4502 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
TMUB2Q71RG4 GDAP2-201ENST00000369442 2436 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
TMUB2Q71RG4 VPS33B-202ENST00000535906 2420 ntTSL 2 BASIC11.78□□□□□ -0.52
TMUB2Q71RG4 GRIN2A-206ENST00000562109 4338 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
TMUB2Q71RG4 AC008764.8-201ENST00000623966 2717 ntBASIC11.78□□□□□ -0.52
TMUB2Q71RG4 UBE3A-226ENST00000637886 8725 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
TMUB2Q71RG4 STYXL1-203ENST00000359697 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
TMUB2Q71RG4 CLEC17A-202ENST00000417570 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
TMUB2Q71RG4 BDNF-208ENST00000418212 4125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
TMUB2Q71RG4 ZNF133-201ENST00000316358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
TMUB2Q71RG4 KCNN3-202ENST00000358505 1658 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
TMUB2Q71RG4 AL358216.1-201ENST00000451601 1657 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
TMUB2Q71RG4 BAIAP3-204ENST00000426824 3930 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.78□□□□□ -0.52
TMUB2Q71RG4 PTGR2-204ENST00000555228 2543 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
TMUB2Q71RG4 CASC15-204ENST00000606197 3969 ntTSL 2 BASIC11.77□□□□□ -0.52
TMUB2Q71RG4 RBM10-206ENST00000628161 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
TMUB2Q71RG4 PPCDC-201ENST00000342932 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
TMUB2Q71RG4 MICA-210ENST00000616296 2260 ntTSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.52
TMUB2Q71RG4 HSPB7-201ENST00000311890 2892 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
TMUB2Q71RG4 OXA1L-202ENST00000358043 1750 ntTSL 2 BASIC11.77□□□□□ -0.52
TMUB2Q71RG4 ZNF148-206ENST00000485866 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
TMUB2Q71RG4 SYMPK-201ENST00000245934 4195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
TMUB2Q71RG4 TIAM1-201ENST00000286827 7200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.52
TMUB2Q71RG4 CD3EAP-202ENST00000589804 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
TMUB2Q71RG4 IL12A-201ENST00000305579 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
TMUB2Q71RG4 FBLIM1-206ENST00000441801 1543 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
TMUB2Q71RG4 MED15-201ENST00000263205 3351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
TMUB2Q71RG4 ABI1-213ENST00000536334 3380 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
TMUB2Q71RG4 GLIPR2-202ENST00000377960 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
TMUB2Q71RG4 TRAPPC2L-211ENST00000565504 3102 ntTSL 2 BASIC11.77□□□□□ -0.53
TMUB2Q71RG4 CHIAP2-201ENST00000369743 2829 ntTSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
TMUB2Q71RG4 DENND1C-201ENST00000381480 2816 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
TMUB2Q71RG4 IKZF1-206ENST00000359197 3487 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
TMUB2Q71RG4 ZSCAN32-202ENST00000396846 3173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
TMUB2Q71RG4 ZSCAN32-203ENST00000396852 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
TMUB2Q71RG4 PCDHB4-201ENST00000194152 3825 ntAPPRIS P1 BASIC11.77□□□□□ -0.53
TMUB2Q71RG4 PLGRKT-201ENST00000223864 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
TMUB2Q71RG4 PAFAH1B3-201ENST00000262890 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
TMUB2Q71RG4 FCN1-201ENST00000371806 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
TMUB2Q71RG4 PDLIM4-202ENST00000379018 1006 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
TMUB2Q71RG4 AL353705.2-201ENST00000428243 662 ntBASIC11.77□□□□□ -0.53
TMUB2Q71RG4 AL671277.1-201ENST00000429656 993 ntBASIC11.77□□□□□ -0.53
TMUB2Q71RG4 MRPL28-203ENST00000429738 310 ntTSL 2 BASIC11.77□□□□□ -0.53
TMUB2Q71RG4 AC004975.2-201ENST00000442017 565 ntTSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 231.8 ms