Protein–RNA interactions for Protein: Q6PIJ6

FBXO38, F-box only protein 38, humanhuman

Predictions only

Length 1,188 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FBXO38Q6PIJ6 PRR12-203ENST00000615927 4479 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
FBXO38Q6PIJ6 LINC00511-213ENST00000581549 2265 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
FBXO38Q6PIJ6 CHD1-212ENST00000614616 8095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
FBXO38Q6PIJ6 UBE2W-201ENST00000419880 2315 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
FBXO38Q6PIJ6 TMOD1-202ENST00000375175 2516 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
FBXO38Q6PIJ6 RPL18A-201ENST00000222247 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
FBXO38Q6PIJ6 TMEM52-201ENST00000310991 929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
FBXO38Q6PIJ6 MRGPRF-202ENST00000320913 705 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
FBXO38Q6PIJ6 STMN1-204ENST00000426559 948 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
FBXO38Q6PIJ6 AL589986.1-201ENST00000429230 789 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
FBXO38Q6PIJ6 AC096536.1-201ENST00000443284 440 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
FBXO38Q6PIJ6 RPSAP31-202ENST00000445165 716 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
FBXO38Q6PIJ6 SERF1B-208ENST00000515588 792 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
FBXO38Q6PIJ6 IL32-234ENST00000552936 713 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
FBXO38Q6PIJ6 AC008050.1-201ENST00000554926 632 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
FBXO38Q6PIJ6 SPDYE22P-201ENST00000582158 798 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
FBXO38Q6PIJ6 YPEL2-205ENST00000585166 881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
FBXO38Q6PIJ6 UPK1A-204ENST00000617999 1268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
FBXO38Q6PIJ6 AC004834.1-204ENST00000640670 1055 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
FBXO38Q6PIJ6 OSBPL2-203ENST00000439951 3886 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
FBXO38Q6PIJ6 URGCP-207ENST00000453200 4042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
FBXO38Q6PIJ6 PXDN-201ENST00000252804 6808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
FBXO38Q6PIJ6 CDCA3-202ENST00000422785 2760 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
FBXO38Q6PIJ6 MKL1-211ENST00000618196 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
FBXO38Q6PIJ6 AHSA1-201ENST00000216479 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
FBXO38Q6PIJ6 PIP4K2A-206ENST00000545335 1436 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
FBXO38Q6PIJ6 LIMS4-204ENST00000632897 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
FBXO38Q6PIJ6 PDLIM2-201ENST00000265810 4592 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
FBXO38Q6PIJ6 IL2RG-203ENST00000374202 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
FBXO38Q6PIJ6 RPS9-205ENST00000402367 1617 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
FBXO38Q6PIJ6 PRKAB1-205ENST00000540121 1673 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
FBXO38Q6PIJ6 HIF3A-206ENST00000472815 1709 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
FBXO38Q6PIJ6 KAT7-204ENST00000454930 1774 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
FBXO38Q6PIJ6 HSD17B6-205ENST00000554643 1751 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
FBXO38Q6PIJ6 CDHR5-202ENST00000358353 3635 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
FBXO38Q6PIJ6 CSNK1G1-205ENST00000607537 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
FBXO38Q6PIJ6 OSBPL1A-201ENST00000319481 4195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
FBXO38Q6PIJ6 C19orf12-209ENST00000623113 4242 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
FBXO38Q6PIJ6 PTPN13-203ENST00000427191 8487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
FBXO38Q6PIJ6 RERG-204ENST00000536465 2134 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
FBXO38Q6PIJ6 ZNF185-205ENST00000370270 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
FBXO38Q6PIJ6 PEX1-201ENST00000248633 4385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
FBXO38Q6PIJ6 ZNF124-202ENST00000472531 2243 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
FBXO38Q6PIJ6 SUOX-204ENST00000394115 2394 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
FBXO38Q6PIJ6 TLE3-203ENST00000451782 2356 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
FBXO38Q6PIJ6 ACTN1-202ENST00000376839 2824 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
FBXO38Q6PIJ6 ZDHHC8-201ENST00000320602 3072 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
FBXO38Q6PIJ6 KIF3A-208ENST00000618515 3333 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
FBXO38Q6PIJ6 KDM6B-201ENST00000254846 6713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
FBXO38Q6PIJ6 TBX4-202ENST00000393853 3398 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
FBXO38Q6PIJ6 AP3M2-207ENST00000518421 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
FBXO38Q6PIJ6 DCUN1D4-201ENST00000334635 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
FBXO38Q6PIJ6 CELF1-201ENST00000310513 4583 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
FBXO38Q6PIJ6 FAM13B-201ENST00000033079 5465 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
FBXO38Q6PIJ6 PLXNB3-209ENST00000538966 6377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
FBXO38Q6PIJ6 SRP54-201ENST00000216774 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
FBXO38Q6PIJ6 DAO-201ENST00000228476 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
FBXO38Q6PIJ6 WDR92-201ENST00000295121 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
FBXO38Q6PIJ6 TBC1D8B-202ENST00000310452 2589 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
FBXO38Q6PIJ6 VCX-201ENST00000341408 677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
FBXO38Q6PIJ6 CALY-202ENST00000368555 783 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
FBXO38Q6PIJ6 DMAP1-203ENST00000372289 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
FBXO38Q6PIJ6 BCL2L1-203ENST00000376062 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
FBXO38Q6PIJ6 IRF9-202ENST00000396864 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
FBXO38Q6PIJ6 BLCAP-202ENST00000397131 633 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
FBXO38Q6PIJ6 BLCAP-203ENST00000397134 566 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.3■□□□□ 0.04
FBXO38Q6PIJ6 DIRC3-201ENST00000423123 552 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.3■□□□□ 0.04
FBXO38Q6PIJ6 UFL1-AS1-201ENST00000430796 548 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
FBXO38Q6PIJ6 AC003958.1-201ENST00000435883 421 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
FBXO38Q6PIJ6 METTL6-204ENST00000450816 1221 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
FBXO38Q6PIJ6 CD81-207ENST00000481687 890 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
FBXO38Q6PIJ6 SPSB2-204ENST00000523102 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
FBXO38Q6PIJ6 SPSB2-205ENST00000524270 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
FBXO38Q6PIJ6 TDH-201ENST00000525246 1357 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
FBXO38Q6PIJ6 AP002008.1-201ENST00000530283 1155 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
FBXO38Q6PIJ6 AC087612.1-201ENST00000560238 658 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
FBXO38Q6PIJ6 TRAPPC2L-206ENST00000564365 1060 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
FBXO38Q6PIJ6 MRPS23-202ENST00000578444 580 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
FBXO38Q6PIJ6 AC005746.1-201ENST00000589244 672 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
FBXO38Q6PIJ6 FHOD3-206ENST00000590592 4869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
FBXO38Q6PIJ6 BARD1-209ENST00000613192 703 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
FBXO38Q6PIJ6 5S_rRNA.22-201ENST00000614916 106 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
FBXO38Q6PIJ6 EIF6-209ENST00000621148 1054 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
FBXO38Q6PIJ6 AC018445.4-201ENST00000624066 2291 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
FBXO38Q6PIJ6 AC025048.6-201ENST00000634326 1161 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
FBXO38Q6PIJ6 STK17B-201ENST00000263955 5287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
FBXO38Q6PIJ6 HOXB13-201ENST00000290295 3467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
FBXO38Q6PIJ6 PARP10-205ENST00000525773 3404 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
FBXO38Q6PIJ6 RASA4CP-203ENST00000446874 3193 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
FBXO38Q6PIJ6 POMT1-203ENST00000372228 3123 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
FBXO38Q6PIJ6 ZBTB20-211ENST00000471418 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
FBXO38Q6PIJ6 ALDH1L1-205ENST00000452905 2758 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
FBXO38Q6PIJ6 ESRRB-201ENST00000380887 2745 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
FBXO38Q6PIJ6 LRRK1-201ENST00000388948 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
FBXO38Q6PIJ6 SYK-203ENST00000375751 4936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
FBXO38Q6PIJ6 AC022364.1-202ENST00000617468 2409 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
FBXO38Q6PIJ6 ZNF75A-205ENST00000574298 2347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
FBXO38Q6PIJ6 CCT8L2-201ENST00000359963 2060 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
FBXO38Q6PIJ6 AL022313.4-201ENST00000562756 2046 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
FBXO38Q6PIJ6 LINC02188-202ENST00000569740 3775 ntTSL 4 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.4 ms