Protein–RNA interactions for Protein: Q66GS9

CEP135, Centrosomal protein of 135 kDa, humanhuman

Predictions only

Length 1,140 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CEP135Q66GS9 LINC02076-201ENST00000577684 1871 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CEP135Q66GS9 MAP3K21-202ENST00000366623 3910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CEP135Q66GS9 DENND1B-211ENST00000620048 8378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CEP135Q66GS9 TSPEAR-AS1-202ENST00000451035 2108 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CEP135Q66GS9 TOMM40L-209ENST00000545897 2807 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CEP135Q66GS9 GPRASP1-203ENST00000444152 5809 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CEP135Q66GS9 METAP1D-201ENST00000315796 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CEP135Q66GS9 UBE3A-204ENST00000438097 8939 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CEP135Q66GS9 BRSK1-206ENST00000590333 2977 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CEP135Q66GS9 IFT57-201ENST00000264538 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CEP135Q66GS9 C1QTNF9-201ENST00000332018 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CEP135Q66GS9 AP4M1-206ENST00000429084 1836 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CEP135Q66GS9 SPATA7-217ENST00000556553 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CEP135Q66GS9 PHF2-203ENST00000610682 2921 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CEP135Q66GS9 DZANK1-202ENST00000329494 1389 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CEP135Q66GS9 PNMA5-205ENST00000535214 3198 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CEP135Q66GS9 FAM213A-203ENST00000372187 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CEP135Q66GS9 AC006001.1-201ENST00000325130 474 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
CEP135Q66GS9 CDK2-202ENST00000354056 1260 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CEP135Q66GS9 NRSN2-201ENST00000382285 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CEP135Q66GS9 SELENOM-201ENST00000400299 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CEP135Q66GS9 MCFD2-204ENST00000409207 1113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CEP135Q66GS9 SFTPC-202ENST00000437090 773 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CEP135Q66GS9 AC234783.1-201ENST00000441761 496 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
CEP135Q66GS9 SVIL-AS1-208ENST00000446807 1007 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CEP135Q66GS9 GGTLC2-202ENST00000448514 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CEP135Q66GS9 RHOXF1P1-201ENST00000454625 772 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CEP135Q66GS9 AP000345.1-201ENST00000454863 569 ntTSL 4 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CEP135Q66GS9 ZNF720-210ENST00000534369 791 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CEP135Q66GS9 ALPL-207ENST00000540617 2131 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CEP135Q66GS9 MAP1LC3B2-202ENST00000556529 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CEP135Q66GS9 LINC02299-201ENST00000556669 430 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CEP135Q66GS9 RN7SL713P-201ENST00000582127 302 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
CEP135Q66GS9 C19orf53-206ENST00000593274 491 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CEP135Q66GS9 SCN1B-204ENST00000596348 1176 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CEP135Q66GS9 AC073413.1-201ENST00000603927 732 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
CEP135Q66GS9 AL035252.4-201ENST00000624174 288 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
CEP135Q66GS9 RAB34-222ENST00000625712 994 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CEP135Q66GS9 SMAGP-203ENST00000603798 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CEP135Q66GS9 LINC01648-201ENST00000445180 1519 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CEP135Q66GS9 SLC1A1-201ENST00000262352 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CEP135Q66GS9 GABPA-202ENST00000400075 4814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CEP135Q66GS9 LRSAM1-201ENST00000300417 3146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CEP135Q66GS9 RABL6-211ENST00000629216 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CEP135Q66GS9 MN1-201ENST00000302326 7556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CEP135Q66GS9 LINC02396-202ENST00000550636 2324 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CEP135Q66GS9 GTF2A1L-203ENST00000430487 1575 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CEP135Q66GS9 C12orf76-209ENST00000615315 1580 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CEP135Q66GS9 FDFT1-223ENST00000615631 2462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CEP135Q66GS9 SPG11-210ENST00000558319 6426 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CEP135Q66GS9 AC013472.1-203ENST00000380387 1966 ntTSL 4 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CEP135Q66GS9 KRT8P4-201ENST00000509735 1454 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
CEP135Q66GS9 AC025594.2-201ENST00000609480 3902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CEP135Q66GS9 FAM122C-203ENST00000414371 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CEP135Q66GS9 GRIK4-208ENST00000638419 3593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CEP135Q66GS9 ZNF800-203ENST00000393313 4358 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CEP135Q66GS9 CCT2-201ENST00000299300 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CEP135Q66GS9 MAGEA2-203ENST00000611557 2024 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CEP135Q66GS9 BCL9L-201ENST00000334801 10005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CEP135Q66GS9 RBBP4-204ENST00000414241 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CEP135Q66GS9 MANBA-202ENST00000505239 2577 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CEP135Q66GS9 MKL1-201ENST00000355630 4496 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CEP135Q66GS9 SC5D-201ENST00000264027 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CEP135Q66GS9 LINC02135-201ENST00000599486 2065 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CEP135Q66GS9 IKBKG-208ENST00000611176 1654 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CEP135Q66GS9 CYTH2-203ENST00000427476 4606 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CEP135Q66GS9 LRRC32-201ENST00000260061 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CEP135Q66GS9 SOD1-201ENST00000270142 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CEP135Q66GS9 TMEM141-201ENST00000290079 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CEP135Q66GS9 THOC7-201ENST00000295899 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CEP135Q66GS9 AC112492.5-201ENST00000421897 457 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
CEP135Q66GS9 U82695.1-202ENST00000428676 700 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CEP135Q66GS9 C1QTNF6-203ENST00000434784 975 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CEP135Q66GS9 RPL7P3-201ENST00000441388 714 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
CEP135Q66GS9 PUDPP3-201ENST00000445368 636 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
CEP135Q66GS9 TMEM14B-210ENST00000473276 730 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CEP135Q66GS9 PRPS2-205ENST00000489404 763 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CEP135Q66GS9 NAA50-208ENST00000497255 789 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CEP135Q66GS9 CEP57L1-208ENST00000519095 908 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CEP135Q66GS9 NAPSB-201ENST00000525179 678 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CEP135Q66GS9 RAB43P1-201ENST00000561790 589 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
CEP135Q66GS9 AC103988.2-201ENST00000561804 725 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
CEP135Q66GS9 STRADA-221ENST00000582137 1238 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CEP135Q66GS9 TMEM14B-220ENST00000612333 888 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CEP135Q66GS9 RHOXF1P1-202ENST00000635473 501 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
CEP135Q66GS9 PAF1-204ENST00000595564 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CEP135Q66GS9 CD99L2-205ENST00000437787 3493 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CEP135Q66GS9 TMEM87A-201ENST00000307216 1598 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CEP135Q66GS9 MYOM3-202ENST00000374434 5804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CEP135Q66GS9 PRR12-203ENST00000615927 4479 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CEP135Q66GS9 AP1B1-201ENST00000317368 3903 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CEP135Q66GS9 AP002761.4-201ENST00000565433 3361 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
CEP135Q66GS9 CENPK-202ENST00000396679 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CEP135Q66GS9 MECP2-217ENST00000628176 1712 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CEP135Q66GS9 KIF21B-201ENST00000332129 9897 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CEP135Q66GS9 CXCL12-201ENST00000343575 1857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CEP135Q66GS9 RAB40A-202ENST00000372633 3126 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CEP135Q66GS9 AC139712.1-201ENST00000378256 1875 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
CEP135Q66GS9 ANKRD36BP2-202ENST00000421951 1899 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CEP135Q66GS9 CYB5D1-203ENST00000571846 1870 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.8 ms