Protein–RNA interactions for Protein: Q16656

NRF1, Nuclear respiratory factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 503 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NRF1Q16656 MEAF6-204ENST00000373075 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
NRF1Q16656 HORMAD1-201ENST00000322343 1771 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
NRF1Q16656 DHX30-215ENST00000619982 3574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
NRF1Q16656 NHSL1-202ENST00000343505 6535 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
NRF1Q16656 ZNF419-202ENST00000347466 3654 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.8□□□□□ -0.2
NRF1Q16656 PLEKHB2-206ENST00000409612 2210 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.8□□□□□ -0.2
NRF1Q16656 XKRX-202ENST00000468904 2249 ntTSL 2 BASIC13.8□□□□□ -0.2
NRF1Q16656 HYOU1-220ENST00000617285 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
NRF1Q16656 NSD2-203ENST00000382888 2666 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
NRF1Q16656 COG1-201ENST00000299886 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
NRF1Q16656 ZNF34-201ENST00000343459 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
NRF1Q16656 ZNF34-202ENST00000429371 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
NRF1Q16656 DDX49-214ENST00000629999 1912 ntTSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
NRF1Q16656 LINC00299-202ENST00000442956 2342 ntTSL 2 BASIC13.8□□□□□ -0.2
NRF1Q16656 ABCB8-202ENST00000358849 4683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
NRF1Q16656 KRTAP10-7-201ENST00000609664 1578 ntAPPRIS P1 BASIC13.8□□□□□ -0.2
NRF1Q16656 CCNI-201ENST00000237654 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
NRF1Q16656 LRRC17-201ENST00000249377 2002 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
NRF1Q16656 C7orf72-201ENST00000297001 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
NRF1Q16656 NME1-209ENST00000511355 1645 ntTSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
NRF1Q16656 ABCC6-201ENST00000205557 5747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
NRF1Q16656 TMEM248-201ENST00000341567 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
NRF1Q16656 UBB-201ENST00000302182 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
NRF1Q16656 CTRB1-201ENST00000361017 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
NRF1Q16656 ADIRF-201ENST00000372013 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
NRF1Q16656 WDR45-208ENST00000396681 1146 ntTSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
NRF1Q16656 KLF2P2-201ENST00000416807 1039 ntBASIC13.8□□□□□ -0.2
NRF1Q16656 COX5BP8-201ENST00000416911 349 ntBASIC13.8□□□□□ -0.2
NRF1Q16656 DFFBP1-201ENST00000433250 979 ntBASIC13.8□□□□□ -0.2
NRF1Q16656 EIF3FP3-201ENST00000434851 1086 ntBASIC13.8□□□□□ -0.2
NRF1Q16656 AJ271736.1-201ENST00000483543 773 ntTSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
NRF1Q16656 LACTB2-203ENST00000522447 1034 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.8□□□□□ -0.2
NRF1Q16656 AP003068.1-201ENST00000528887 544 ntTSL 4 BASIC13.8□□□□□ -0.2
NRF1Q16656 TP53TG3HP-202ENST00000569755 579 ntBASIC13.8□□□□□ -0.2
NRF1Q16656 AP001033.1-201ENST00000584509 466 ntTSL 3 BASIC13.8□□□□□ -0.2
NRF1Q16656 DUSP13-214ENST00000607131 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
NRF1Q16656 MIR6074-201ENST00000612054 107 ntBASIC13.8□□□□□ -0.2
NRF1Q16656 SMAD2-212ENST00000591214 1714 ntTSL 2 BASIC13.8□□□□□ -0.2
NRF1Q16656 IFT81-202ENST00000361948 3048 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
NRF1Q16656 UNK-205ENST00000589666 3925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
NRF1Q16656 PEAR1-201ENST00000292357 4866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
NRF1Q16656 FLAD1-206ENST00000368432 1839 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
NRF1Q16656 DZANK1-202ENST00000329494 1389 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
NRF1Q16656 HPS3-201ENST00000296051 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
NRF1Q16656 ADAMTSL2-203ENST00000393061 4270 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
NRF1Q16656 UCP3-202ENST00000426995 1406 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
NRF1Q16656 AMIGO3-201ENST00000320431 2862 ntAPPRIS P1 BASIC13.8□□□□□ -0.2
NRF1Q16656 AC007541.1-201ENST00000570282 1469 ntBASIC13.8□□□□□ -0.2
NRF1Q16656 SLC35E2B-205ENST00000617444 6283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
NRF1Q16656 PSMD13-203ENST00000431206 1591 ntTSL 2 BASIC13.79□□□□□ -0.2
NRF1Q16656 TNRC18P1-201ENST00000502875 3650 ntBASIC13.79□□□□□ -0.2
NRF1Q16656 PRAMEF8-202ENST00000614831 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
NRF1Q16656 PRAMEF7-202ENST00000616979 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
NRF1Q16656 TINF2-215ENST00000626689 1643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
NRF1Q16656 TSC22D3-204ENST00000372384 2199 ntTSL 2 BASIC13.79□□□□□ -0.2
NRF1Q16656 CRISPLD2-209ENST00000567845 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
NRF1Q16656 ZSCAN16-AS1-201ENST00000600652 2163 ntTSL 2 BASIC13.79□□□□□ -0.2
NRF1Q16656 LRRC41-208ENST00000617760 2158 ntTSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
NRF1Q16656 ARAP1-201ENST00000334211 4942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
NRF1Q16656 PPHLN1-206ENST00000395580 1693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
NRF1Q16656 LARGE1-203ENST00000402320 3955 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
NRF1Q16656 TTC14-202ENST00000382584 2274 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
NRF1Q16656 LINC00665-206ENST00000590622 1749 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
NRF1Q16656 CCDC180-210ENST00000529487 5242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
NRF1Q16656 NRXN1-207ENST00000404971 7578 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
NRF1Q16656 EXOC6B-201ENST00000272427 5918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
NRF1Q16656 TP53INP2-202ENST00000374810 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
NRF1Q16656 CCT6B-201ENST00000314144 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
NRF1Q16656 CPN1-201ENST00000370418 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
NRF1Q16656 HSPA1L-201ENST00000375654 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
NRF1Q16656 CACNG5-201ENST00000307139 926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
NRF1Q16656 TSFM-201ENST00000323833 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
NRF1Q16656 TNFRSF12A-202ENST00000341627 881 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
NRF1Q16656 LYPLA2-201ENST00000374501 1117 ntTSL 2 BASIC13.79□□□□□ -0.2
NRF1Q16656 CPLX2-202ENST00000393745 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
NRF1Q16656 TRIM74-202ENST00000395244 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
NRF1Q16656 SOCS2P1-201ENST00000417727 557 ntBASIC13.79□□□□□ -0.2
NRF1Q16656 TLE1P1-201ENST00000422965 589 ntBASIC13.79□□□□□ -0.2
NRF1Q16656 UFL1-AS1-201ENST00000430796 548 ntTSL 3 BASIC13.79□□□□□ -0.2
NRF1Q16656 SPATA3-204ENST00000433428 856 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
NRF1Q16656 TRIM73-204ENST00000447409 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
NRF1Q16656 RAB3A-202ENST00000464076 1253 ntTSL 2 BASIC13.79□□□□□ -0.2
NRF1Q16656 GIMAP3P-201ENST00000495150 836 ntBASIC13.79□□□□□ -0.2
NRF1Q16656 AC095060.1-201ENST00000502455 549 ntTSL 4 BASIC13.79□□□□□ -0.2
NRF1Q16656 TIMM8B-201ENST00000504148 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
NRF1Q16656 AC084125.2-203ENST00000532766 821 ntTSL 3 BASIC13.79□□□□□ -0.2
NRF1Q16656 FAM212B-207ENST00000534365 1217 ntTSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
NRF1Q16656 AC092552.1-201ENST00000547243 906 ntBASIC13.79□□□□□ -0.2
NRF1Q16656 AL359711.2-201ENST00000563105 872 ntBASIC13.79□□□□□ -0.2
NRF1Q16656 AC015688.8-201ENST00000577746 656 ntTSL 4 BASIC13.79□□□□□ -0.2
NRF1Q16656 AC124287.1-201ENST00000582249 838 ntTSL 3 BASIC13.79□□□□□ -0.2
NRF1Q16656 AC015819.2-201ENST00000618730 555 ntTSL 3 BASIC13.79□□□□□ -0.2
NRF1Q16656 NOP16-209ENST00000618911 1087 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
NRF1Q16656 EDEM3-202ENST00000367512 6678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
NRF1Q16656 PJA1-203ENST00000374583 2692 ntAPPRIS P4 BASIC13.79□□□□□ -0.2
NRF1Q16656 BRAP-202ENST00000419234 4026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
NRF1Q16656 ELF3-202ENST00000367283 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
NRF1Q16656 LY9-204ENST00000368039 1364 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
NRF1Q16656 HERC5-201ENST00000264350 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
NRF1Q16656 AOC1-204ENST00000467291 2857 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64 ms