Protein–RNA interactions for Protein: Q13670

PMS2P11, Putative postmeiotic segregation increased 2-like protein 11, humanhuman

Predictions only

Length 270 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PMS2P11Q13670 ARAF-201ENST00000290277 2504 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
PMS2P11Q13670 DYSF-202ENST00000394120 6543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
PMS2P11Q13670 CCT3-204ENST00000368259 1815 ntTSL 2 BASIC11.58□□□□□ -0.56
PMS2P11Q13670 PGAP2-203ENST00000396986 1837 ntTSL 2 BASIC11.58□□□□□ -0.56
PMS2P11Q13670 KCNIP1-208ENST00000520740 1845 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
PMS2P11Q13670 F2-205ENST00000530231 1849 ntTSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
PMS2P11Q13670 CDIP1-206ENST00000563507 1463 ntTSL 2 BASIC11.58□□□□□ -0.56
PMS2P11Q13670 CD300LG-206ENST00000588884 1459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.58□□□□□ -0.56
PMS2P11Q13670 AL022323.5-201ENST00000624101 2059 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
PMS2P11Q13670 RTFDC1-201ENST00000023939 1745 ntTSL 2 BASIC11.58□□□□□ -0.56
PMS2P11Q13670 MAGEA4-205ENST00000393920 1721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.58□□□□□ -0.56
PMS2P11Q13670 HMBOX1-210ENST00000523613 1730 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
PMS2P11Q13670 NCSTN-201ENST00000294785 2936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
PMS2P11Q13670 AL359075.1-201ENST00000476232 2921 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
PMS2P11Q13670 FAM172A-206ENST00000509163 1369 ntTSL 2 BASIC11.58□□□□□ -0.56
PMS2P11Q13670 IL11RA-215ENST00000602473 1388 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
PMS2P11Q13670 DIRAS3-201ENST00000370981 1973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.58□□□□□ -0.56
PMS2P11Q13670 NEK4-202ENST00000383721 2576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
PMS2P11Q13670 KCTD9-201ENST00000221200 3401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
PMS2P11Q13670 GPA33-201ENST00000367868 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
PMS2P11Q13670 Z97205.2-201ENST00000564697 1639 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
PMS2P11Q13670 FBN1-201ENST00000316623 11756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
PMS2P11Q13670 CMA1-201ENST00000206446 633 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
PMS2P11Q13670 ALG5-201ENST00000239891 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
PMS2P11Q13670 HCST-201ENST00000246551 613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
PMS2P11Q13670 CCDC182-201ENST00000299415 832 ntAPPRIS P1 BASIC11.58□□□□□ -0.56
PMS2P11Q13670 AC073349.1-201ENST00000340779 1062 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
PMS2P11Q13670 HDAC8-203ENST00000373559 632 ntTSL 2 BASIC11.58□□□□□ -0.56
PMS2P11Q13670 HDAC8-208ENST00000373583 434 ntTSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
PMS2P11Q13670 OR5C1-201ENST00000373680 963 ntAPPRIS P1 BASIC11.58□□□□□ -0.56
PMS2P11Q13670 MAP9-202ENST00000379248 1165 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
PMS2P11Q13670 LINC00685-201ENST00000391707 428 ntTSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
PMS2P11Q13670 TOMM22P5-201ENST00000416399 439 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
PMS2P11Q13670 DLX2-AS1-201ENST00000448117 950 ntTSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
PMS2P11Q13670 IGFBP2-204ENST00000456764 846 ntTSL 3 BASIC11.58□□□□□ -0.56
PMS2P11Q13670 RN7SL752P-201ENST00000463779 287 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
PMS2P11Q13670 AC008406.2-201ENST00000507058 532 ntTSL 3 BASIC11.58□□□□□ -0.56
PMS2P11Q13670 HILS1-202ENST00000545329 423 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
PMS2P11Q13670 NOP2-220ENST00000545915 630 ntTSL 2 BASIC11.58□□□□□ -0.56
PMS2P11Q13670 MRPL52-211ENST00000555536 451 ntTSL 3 BASIC11.58□□□□□ -0.56
PMS2P11Q13670 AC009407.1-201ENST00000568958 598 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
PMS2P11Q13670 TP53TG3HP-202ENST00000569755 579 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
PMS2P11Q13670 SNHG15-207ENST00000582727 1039 ntTSL 2 BASIC11.58□□□□□ -0.56
PMS2P11Q13670 INO80C-210ENST00000590757 595 ntTSL 2 BASIC11.58□□□□□ -0.56
PMS2P11Q13670 AL844908.2-201ENST00000609461 460 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
PMS2P11Q13670 AC004840.1-201ENST00000636359 365 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
PMS2P11Q13670 SCP2-217ENST00000640998 1101 ntTSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
PMS2P11Q13670 ITSN1-208ENST00000399349 5191 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
PMS2P11Q13670 TUBA3E-201ENST00000312988 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
PMS2P11Q13670 RAD51D-218ENST00000590016 1528 ntTSL 2 BASIC11.58□□□□□ -0.56
PMS2P11Q13670 ARID3B-206ENST00000622429 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
PMS2P11Q13670 GGA3-214ENST00000582717 2255 ntTSL 2 BASIC11.58□□□□□ -0.56
PMS2P11Q13670 XRRA1-207ENST00000527087 2505 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
PMS2P11Q13670 PNKD-203ENST00000273077 3021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
PMS2P11Q13670 STRIP2-201ENST00000249344 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
PMS2P11Q13670 SCOC-210ENST00000608372 5129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
PMS2P11Q13670 CREBZF-204ENST00000527447 4037 ntAPPRIS P1 BASIC11.58□□□□□ -0.56
PMS2P11Q13670 EMP1-211ENST00000544053 1436 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
PMS2P11Q13670 SH3PXD2A-203ENST00000369774 11468 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
PMS2P11Q13670 SMG9-201ENST00000270066 5510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
PMS2P11Q13670 RIOK3-203ENST00000577501 1904 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
PMS2P11Q13670 ETV4-202ENST00000393664 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
PMS2P11Q13670 RGL4-202ENST00000401461 2420 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
PMS2P11Q13670 NGLY1-205ENST00000417874 2062 ntTSL 2 BASIC11.58□□□□□ -0.56
PMS2P11Q13670 SLC39A9-209ENST00000556605 2065 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
PMS2P11Q13670 ACVR2A-201ENST00000241416 5728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
PMS2P11Q13670 PPP1R15B-201ENST00000367188 5227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
PMS2P11Q13670 EEF2K-201ENST00000263026 7388 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
PMS2P11Q13670 TMEM121B-202ENST00000399875 3961 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.58□□□□□ -0.56
PMS2P11Q13670 SNHG20-204ENST00000566583 1338 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
PMS2P11Q13670 YWHAQ-201ENST00000238081 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
PMS2P11Q13670 PTPN20-206ENST00000395722 1995 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
PMS2P11Q13670 FIBCD1-204ENST00000448616 3119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
PMS2P11Q13670 ESPNL-202ENST00000409169 4441 ntTSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
PMS2P11Q13670 SLC5A5-201ENST00000222248 3576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
PMS2P11Q13670 CARHSP1-218ENST00000614449 2931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
PMS2P11Q13670 PRKD1-201ENST00000331968 3726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
PMS2P11Q13670 KIF17-203ENST00000400463 3731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
PMS2P11Q13670 TESMIN-204ENST00000443940 3495 ntTSL 2 BASIC11.57□□□□□ -0.56
PMS2P11Q13670 NOX5-202ENST00000388866 2804 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
PMS2P11Q13670 ENO2-205ENST00000535366 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
PMS2P11Q13670 CNP-202ENST00000393892 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
PMS2P11Q13670 AC092053.3-201ENST00000641308 4975 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
PMS2P11Q13670 ITPRIPL1-204ENST00000439118 1946 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
PMS2P11Q13670 ADGRG3-201ENST00000333493 2728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
PMS2P11Q13670 TRAPPC9-201ENST00000389328 4474 ntTSL 2 BASIC11.57□□□□□ -0.56
PMS2P11Q13670 CCL25-201ENST00000253451 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.57□□□□□ -0.56
PMS2P11Q13670 VHLL-201ENST00000339922 676 ntAPPRIS P1 BASIC11.57□□□□□ -0.56
PMS2P11Q13670 NGF-201ENST00000369512 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
PMS2P11Q13670 RBM3-202ENST00000376755 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.57□□□□□ -0.56
PMS2P11Q13670 IGHV3-7-201ENST00000390598 430 ntAPPRIS P1 BASIC11.57□□□□□ -0.56
PMS2P11Q13670 TNFRSF14-202ENST00000409119 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.57□□□□□ -0.56
PMS2P11Q13670 C2orf76-202ENST00000409466 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
PMS2P11Q13670 ITPR1-AS1-201ENST00000412804 858 ntTSL 2 BASIC11.57□□□□□ -0.56
PMS2P11Q13670 TMEM247-204ENST00000434431 680 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
PMS2P11Q13670 AC100818.1-201ENST00000524167 563 ntTSL 4 BASIC11.57□□□□□ -0.56
PMS2P11Q13670 CSF1R-209ENST00000543093 921 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
PMS2P11Q13670 AC091544.3-201ENST00000556424 531 ntTSL 2 BASIC11.57□□□□□ -0.56
PMS2P11Q13670 AC008494.3-201ENST00000606615 944 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
PMS2P11Q13670 AC007431.3-201ENST00000623221 587 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 285.2 ms