Protein–RNA interactions for Protein: Q13635

PTCH1, Protein patched homolog 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,447 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTCH1Q13635 AC245595.2-201ENST00000620141 1144 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
PTCH1Q13635 OR2T8-202ENST00000641945 1226 ntAPPRIS P1 BASIC19.29■□□□□ 0.68
PTCH1Q13635 SEMA4D-204ENST00000420101 1837 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
PTCH1Q13635 PERM1-201ENST00000341290 3035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
PTCH1Q13635 MEGF10-202ENST00000418761 2238 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
PTCH1Q13635 PRKAR2B-201ENST00000265717 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
PTCH1Q13635 ZIC5-201ENST00000267294 4639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
PTCH1Q13635 ZNF586-201ENST00000391702 2265 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
PTCH1Q13635 ECI2-202ENST00000380118 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
PTCH1Q13635 ADORA2A-AS1-201ENST00000326341 2557 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
PTCH1Q13635 WDR20-205ENST00000424963 2695 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
PTCH1Q13635 LIMS2-206ENST00000409754 1620 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
PTCH1Q13635 PAF1-204ENST00000595564 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
PTCH1Q13635 RFX1-201ENST00000254325 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
PTCH1Q13635 LRFN2-201ENST00000338305 3270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
PTCH1Q13635 MARK2-206ENST00000425897 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
PTCH1Q13635 AC089987.1-201ENST00000551654 2209 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
PTCH1Q13635 STAT1-203ENST00000392323 2723 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
PTCH1Q13635 SYNM-204ENST00000594047 6407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
PTCH1Q13635 MAP4K4-204ENST00000350198 7316 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
PTCH1Q13635 CACNA2D2-201ENST00000266039 5476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
PTCH1Q13635 EIF3F-201ENST00000309828 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
PTCH1Q13635 AL513165.1-201ENST00000413915 289 ntTSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
PTCH1Q13635 KRT18P44-201ENST00000416086 1285 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
PTCH1Q13635 RPSAP6-201ENST00000417882 882 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
PTCH1Q13635 FRGCA-201ENST00000424933 422 ntTSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
PTCH1Q13635 AC007279.1-201ENST00000448547 837 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
PTCH1Q13635 PSME2P2-201ENST00000453033 700 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
PTCH1Q13635 ALG1L15P-201ENST00000482834 794 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
PTCH1Q13635 LY6E-215ENST00000523847 427 ntTSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
PTCH1Q13635 AAMDC-207ENST00000527134 693 ntTSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
PTCH1Q13635 AL162231.1-205ENST00000544078 338 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
PTCH1Q13635 NKAPP1-204ENST00000555168 557 ntTSL 4 BASIC19.28■□□□□ 0.68
PTCH1Q13635 IFI27L1-211ENST00000557066 580 ntTSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
PTCH1Q13635 RN7SL134P-201ENST00000579756 303 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
PTCH1Q13635 ZNF671-203ENST00000596939 977 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
PTCH1Q13635 AC004466.2-201ENST00000614749 516 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
PTCH1Q13635 LINC00969-253ENST00000625338 804 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
PTCH1Q13635 AL590094.1-208ENST00000636917 627 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
PTCH1Q13635 SIGLEC6-204ENST00000391797 1391 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
PTCH1Q13635 KRT37-201ENST00000225550 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
PTCH1Q13635 AL117190.1-201ENST00000637474 1985 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
PTCH1Q13635 SAP18-201ENST00000382533 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
PTCH1Q13635 DDX55-201ENST00000238146 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
PTCH1Q13635 DCLK2-201ENST00000296550 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
PTCH1Q13635 ACSL3-202ENST00000392066 3147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
PTCH1Q13635 DTNB-228ENST00000496972 2328 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
PTCH1Q13635 ABHD16A-201ENST00000395952 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
PTCH1Q13635 CASP8-202ENST00000264275 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
PTCH1Q13635 HSF5-201ENST00000323777 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
PTCH1Q13635 BRCC3-201ENST00000330045 2496 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
PTCH1Q13635 AC009053.1-204ENST00000429810 2355 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
PTCH1Q13635 TGOLN2-204ENST00000409015 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
PTCH1Q13635 RNF144A-201ENST00000320892 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
PTCH1Q13635 SPIRE1-201ENST00000309836 1877 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
PTCH1Q13635 NRADDP-202ENST00000641269 1585 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
PTCH1Q13635 VARS-215ENST00000375663 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
PTCH1Q13635 POLL-206ENST00000370172 2308 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
PTCH1Q13635 AL031280.1-201ENST00000436991 2224 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
PTCH1Q13635 DYNLT1-201ENST00000367085 774 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
PTCH1Q13635 HDGF-202ENST00000368206 960 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
PTCH1Q13635 CCL19-202ENST00000378800 414 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
PTCH1Q13635 ACOT6-201ENST00000381139 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
PTCH1Q13635 RPL15-205ENST00000415719 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
PTCH1Q13635 AC093495.1-201ENST00000420253 1067 ntTSL 4 BASIC19.27■□□□□ 0.68
PTCH1Q13635 MAGEA7P-201ENST00000436482 942 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
PTCH1Q13635 AC005009.2-201ENST00000452471 687 ntTSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.68
PTCH1Q13635 AC022113.2-201ENST00000504935 704 ntTSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.68
PTCH1Q13635 APOPT1-215ENST00000556253 783 ntTSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.68
PTCH1Q13635 AC142086.5-202ENST00000562500 217 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
PTCH1Q13635 TRAPPC2L-212ENST00000567312 499 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
PTCH1Q13635 NDNF-201ENST00000379692 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
PTCH1Q13635 TGFB1-201ENST00000221930 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
PTCH1Q13635 SMARCA4-203ENST00000429416 5691 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
PTCH1Q13635 SPRY1-208ENST00000622283 2352 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
PTCH1Q13635 USP39-207ENST00000450066 2086 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
PTCH1Q13635 PISD-209ENST00000439502 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
PTCH1Q13635 TMEM229B-201ENST00000357461 4068 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
PTCH1Q13635 PHF3-209ENST00000509330 2969 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
PTCH1Q13635 MELTF-201ENST00000296350 3963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
PTCH1Q13635 FMR1-203ENST00000370470 1774 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
PTCH1Q13635 SEMA3C-201ENST00000265361 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
PTCH1Q13635 AC079336.5-201ENST00000581360 2480 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.67
PTCH1Q13635 DMC1-207ENST00000616615 1595 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
PTCH1Q13635 SYDE1-204ENST00000600440 3058 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
PTCH1Q13635 PKM-220ENST00000568459 1806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
PTCH1Q13635 KIAA1549-201ENST00000422774 6283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
PTCH1Q13635 AC046130.1-201ENST00000501954 2179 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
PTCH1Q13635 MIF4GD-201ENST00000245551 1358 ntTSL 3 BASIC19.26■□□□□ 0.67
PTCH1Q13635 POLR1C-203ENST00000372389 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
PTCH1Q13635 VASH2-205ENST00000366967 1206 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
PTCH1Q13635 AL359649.1-202ENST00000375713 443 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
PTCH1Q13635 SAPCD1-AS1-202ENST00000419679 461 ntTSL 3 BASIC19.26■□□□□ 0.67
PTCH1Q13635 HFE-209ENST00000461397 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
PTCH1Q13635 RN7SL578P-201ENST00000477781 283 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
PTCH1Q13635 AF274856.1-202ENST00000509345 871 ntTSL 4 BASIC19.26■□□□□ 0.67
PTCH1Q13635 KHDRBS3-206ENST00000520981 1243 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
PTCH1Q13635 BLOC1S5-205ENST00000543936 368 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
PTCH1Q13635 SLC13A2-205ENST00000545060 1276 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
PTCH1Q13635 SLC25A3-206ENST00000547534 556 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
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