Protein–RNA interactions for Protein: P84550

SKOR1, SKI family transcriptional corepressor 1, humanhuman

Predictions only

Length 965 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKOR1P84550 APRT-204ENST00000563655 709 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SKOR1P84550 AC009134.1-201ENST00000571939 443 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SKOR1P84550 AC123786.1-201ENST00000581626 661 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SKOR1P84550 TASP1-201ENST00000337743 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SKOR1P84550 C12orf43-202ENST00000445832 2397 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SKOR1P84550 RGMB-201ENST00000308234 4580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SKOR1P84550 MAP2K6-209ENST00000613873 1509 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SKOR1P84550 AAMP-202ENST00000420660 1761 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SKOR1P84550 ATG10-203ENST00000458350 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SKOR1P84550 CAP1-203ENST00000372797 3105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SKOR1P84550 RPA3-201ENST00000223129 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SKOR1P84550 LRRC17-201ENST00000249377 2002 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SKOR1P84550 PSIP1-204ENST00000380738 3364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SKOR1P84550 KY-202ENST00000503669 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SKOR1P84550 ST7L-202ENST00000358039 4528 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SKOR1P84550 LINC01285-204ENST00000634601 1947 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SKOR1P84550 ACIN1-202ENST00000338631 2445 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SKOR1P84550 SFMBT2-203ENST00000379713 2402 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SKOR1P84550 ICOSLG-202ENST00000400377 2907 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SKOR1P84550 CLCN7-203ENST00000448525 4151 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SKOR1P84550 FAM167A-201ENST00000284486 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SKOR1P84550 SP6-202ENST00000536300 3848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SKOR1P84550 AP000437.1-201ENST00000624057 2085 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
SKOR1P84550 ATP12A-201ENST00000218548 3732 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SKOR1P84550 GNAS-213ENST00000371099 3709 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SKOR1P84550 SNX12-202ENST00000374274 2376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SKOR1P84550 ACAN-209ENST00000617301 8669 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SKOR1P84550 SLC27A4-201ENST00000300456 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SKOR1P84550 CIC-207ENST00000575354 5473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SKOR1P84550 RMND1-202ENST00000367303 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SKOR1P84550 FAM219A-201ENST00000297620 3588 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SKOR1P84550 MDM1-201ENST00000303145 2918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SKOR1P84550 HMGCL-203ENST00000374490 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SKOR1P84550 RAPH1-213ENST00000630330 4134 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SKOR1P84550 TPCN1-214ENST00000550785 5345 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SKOR1P84550 STK40-201ENST00000359297 4837 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SKOR1P84550 TMEM181-201ENST00000367090 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SKOR1P84550 TMEM51-204ENST00000428417 1942 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SKOR1P84550 CARTPT-201ENST00000296777 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SKOR1P84550 THEMIS2-204ENST00000373927 1082 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SKOR1P84550 DBI-203ENST00000393103 599 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SKOR1P84550 AL583835.2-202ENST00000421363 1104 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SKOR1P84550 AC072022.1-201ENST00000450760 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SKOR1P84550 AL121845.2-201ENST00000467211 252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SKOR1P84550 AC020659.2-202ENST00000512295 513 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SKOR1P84550 ANAPC15-214ENST00000543587 883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SKOR1P84550 VASH1-AS1-201ENST00000554058 871 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SKOR1P84550 AC024619.2-201ENST00000581964 517 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SKOR1P84550 LARP4-220ENST00000615080 856 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SKOR1P84550 RAB34-222ENST00000625712 994 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SKOR1P84550 AC009690.1-201ENST00000379915 4374 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SKOR1P84550 Z99774.1-201ENST00000382641 2613 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SKOR1P84550 COL17A1-201ENST00000353479 5734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SKOR1P84550 AC215219.1-201ENST00000400706 1817 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
SKOR1P84550 TOE1-201ENST00000372090 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SKOR1P84550 PGBD5-202ENST00000525115 1569 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SKOR1P84550 PSMC5-209ENST00000580864 1552 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SKOR1P84550 FBXO3-203ENST00000526785 5798 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SKOR1P84550 FKBP4P6-201ENST00000457486 1332 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
SKOR1P84550 GLT1D1-201ENST00000281703 2725 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SKOR1P84550 FBXO41-201ENST00000295133 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SKOR1P84550 MYADM-202ENST00000391768 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SKOR1P84550 FAM84B-201ENST00000304916 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SKOR1P84550 CDC37-201ENST00000222005 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SKOR1P84550 TRAF3IP3-204ENST00000367026 2058 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SKOR1P84550 IFT57-201ENST00000264538 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SKOR1P84550 CALB1-201ENST00000265431 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SKOR1P84550 WNK1-201ENST00000315939 10452 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SKOR1P84550 SLC12A7-201ENST00000264930 5280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SKOR1P84550 THBD-201ENST00000377103 4109 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SKOR1P84550 CLDND1-215ENST00000507874 1380 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SKOR1P84550 CALCOCO2-211ENST00000508679 1396 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SKOR1P84550 PPHLN1-206ENST00000395580 1693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SKOR1P84550 CLOCK-211ENST00000513440 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SKOR1P84550 SLC7A7-201ENST00000285850 2263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SKOR1P84550 NICN1-201ENST00000273598 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SKOR1P84550 TRMT11-201ENST00000334379 1565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SKOR1P84550 NCR3-201ENST00000340027 1042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SKOR1P84550 TSPAN32-204ENST00000381121 999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SKOR1P84550 GPR17-202ENST00000393018 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SKOR1P84550 GATD1-203ENST00000397472 790 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SKOR1P84550 PEX13-202ENST00000401576 1108 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SKOR1P84550 MORN2-204ENST00000409665 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SKOR1P84550 RMDN1-212ENST00000519966 1164 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SKOR1P84550 AC116456.1-201ENST00000526646 815 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SKOR1P84550 AP003171.2-201ENST00000528208 925 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
SKOR1P84550 INSC-208ENST00000530161 1702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SKOR1P84550 AC131206.1-201ENST00000538078 1211 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
SKOR1P84550 COX14-203ENST00000550487 739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SKOR1P84550 AC106820.3-201ENST00000561653 397 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
SKOR1P84550 RN7SL718P-201ENST00000581254 303 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
SKOR1P84550 AC004637.1-201ENST00000586675 482 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SKOR1P84550 LINC00665-206ENST00000590622 1749 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SKOR1P84550 C19orf38-203ENST00000592854 1060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SKOR1P84550 C19orf44-203ENST00000594035 2609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SKOR1P84550 AC026790.2-201ENST00000606282 430 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
SKOR1P84550 AC020910.5-201ENST00000623668 1865 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
SKOR1P84550 TRMT2B-206ENST00000545398 3106 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SKOR1P84550 XRRA1-207ENST00000527087 2505 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SKOR1P84550 RABL2B-202ENST00000395590 2380 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.1 ms