Protein–RNA interactions for Protein: P81877

SSBP2, Single-stranded DNA-binding protein 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 361 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSBP2P81877 WDR83-201ENST00000418543 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
SSBP2P81877 PRR30-201ENST00000335524 2008 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
SSBP2P81877 THBS2-206ENST00000617924 5280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
SSBP2P81877 MAGEA4-202ENST00000360243 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
SSBP2P81877 MAGEA4-203ENST00000370335 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
SSBP2P81877 MAGEA4-204ENST00000370340 1773 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.57
SSBP2P81877 KRT74-203ENST00000549343 2858 ntTSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.57
SSBP2P81877 MAPKBP1-215ENST00000514566 5394 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
SSBP2P81877 ALAD-201ENST00000409155 3173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
SSBP2P81877 AC008429.1-202ENST00000518818 2067 ntTSL 2 BASIC11.52□□□□□ -0.57
SSBP2P81877 AC015818.8-201ENST00000587907 1519 ntBASIC11.52□□□□□ -0.57
SSBP2P81877 KIF21B-201ENST00000332129 9897 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
SSBP2P81877 TRPV6-201ENST00000359396 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
SSBP2P81877 ZFYVE28-211ENST00000515312 3247 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.52□□□□□ -0.57
SSBP2P81877 PKM-220ENST00000568459 1806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
SSBP2P81877 TDRD5-201ENST00000294848 3525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
SSBP2P81877 MRPL34-201ENST00000252602 968 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
SSBP2P81877 TEX29-201ENST00000283547 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
SSBP2P81877 CD164L2-203ENST00000374030 993 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.57
SSBP2P81877 MS4A13-201ENST00000378185 808 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
SSBP2P81877 IFT20-203ENST00000395418 825 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
SSBP2P81877 AL021707.3-201ENST00000418803 527 ntTSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.57
SSBP2P81877 EPDR1-203ENST00000425345 947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
SSBP2P81877 LINC01762-204ENST00000434879 436 ntTSL 2 BASIC11.52□□□□□ -0.57
SSBP2P81877 ST13P19-201ENST00000442505 1124 ntBASIC11.52□□□□□ -0.57
SSBP2P81877 RNF216P1-213ENST00000494947 946 ntTSL 2 BASIC11.52□□□□□ -0.57
SSBP2P81877 AC106786.2-201ENST00000506859 561 ntTSL 4 BASIC11.52□□□□□ -0.57
SSBP2P81877 RNA5SP412-201ENST00000516234 123 ntBASIC11.52□□□□□ -0.57
SSBP2P81877 AC005730.2-201ENST00000564549 1184 ntBASIC11.52□□□□□ -0.57
SSBP2P81877 IFT20-216ENST00000588477 774 ntTSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.57
SSBP2P81877 OCEL1-213ENST00000601529 942 ntTSL 3 BASIC11.52□□□□□ -0.57
SSBP2P81877 HIST1H4A-201ENST00000617569 312 ntAPPRIS P1 BASIC11.52□□□□□ -0.57
SSBP2P81877 LINC00595-217ENST00000635545 549 ntTSL 4 BASIC11.52□□□□□ -0.57
SSBP2P81877 AC079325.2-202ENST00000641031 462 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.52□□□□□ -0.57
SSBP2P81877 FBXO21-202ENST00000427718 4138 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
SSBP2P81877 ZNF691-206ENST00000372508 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
SSBP2P81877 CYP4F23P-201ENST00000593402 1579 ntBASIC11.52□□□□□ -0.57
SSBP2P81877 CENPBD1-201ENST00000314994 2744 ntAPPRIS P1 BASIC11.52□□□□□ -0.57
SSBP2P81877 MED22-209ENST00000610888 3867 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
SSBP2P81877 UBA1-202ENST00000377269 2497 ntTSL 2 BASIC11.52□□□□□ -0.57
SSBP2P81877 DNMT3B-204ENST00000353855 4237 ntTSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.57
SSBP2P81877 ARHGAP27-203ENST00000428638 4242 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.57
SSBP2P81877 PGLYRP2-201ENST00000292609 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
SSBP2P81877 RAPGEF3-218ENST00000548919 2776 ntTSL 2 BASIC11.52□□□□□ -0.57
SSBP2P81877 POMP-201ENST00000380842 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
SSBP2P81877 LDHAL6A-201ENST00000280706 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.52□□□□□ -0.57
SSBP2P81877 C2orf68-201ENST00000306336 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
SSBP2P81877 UBA5-202ENST00000356232 3705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
SSBP2P81877 FBXO34-201ENST00000313833 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
SSBP2P81877 BCAN-201ENST00000329117 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
SSBP2P81877 RANBP1-208ENST00000430524 1389 ntTSL 3 BASIC11.52□□□□□ -0.57
SSBP2P81877 B3GAT2-201ENST00000230053 6565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
SSBP2P81877 ZNF747-202ENST00000395094 3504 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
SSBP2P81877 TMPRSS2-201ENST00000332149 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
SSBP2P81877 SFSWAP-210ENST00000541286 3219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
SSBP2P81877 CNGA3-204ENST00000409937 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.52□□□□□ -0.57
SSBP2P81877 GALNT3-201ENST00000392701 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
SSBP2P81877 ZNF717-204ENST00000478296 3875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.57
SSBP2P81877 FAM200B-201ENST00000422728 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
SSBP2P81877 AC114689.3-201ENST00000583687 2991 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
SSBP2P81877 PCOLCE-201ENST00000223061 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
SSBP2P81877 SNPH-201ENST00000381867 5533 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
SSBP2P81877 METTL6-201ENST00000383789 1413 ntTSL 2 BASIC11.52□□□□□ -0.57
SSBP2P81877 GRWD1-201ENST00000253237 5571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
SSBP2P81877 PGAP2-201ENST00000278243 2062 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
SSBP2P81877 PRC1-204ENST00000442656 2060 ntTSL 2 BASIC11.51□□□□□ -0.57
SSBP2P81877 EP400NL-206ENST00000446190 3697 ntTSL 2 BASIC11.51□□□□□ -0.57
SSBP2P81877 CBFA2T3-202ENST00000327483 4033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
SSBP2P81877 CD48-201ENST00000368045 1793 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
SSBP2P81877 SUSD5-201ENST00000309558 5008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
SSBP2P81877 NFKB2-204ENST00000428099 3416 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
SSBP2P81877 AC027288.3-202ENST00000550268 1820 ntTSL 2 BASIC11.51□□□□□ -0.57
SSBP2P81877 SLC4A7-213ENST00000454389 4159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
SSBP2P81877 SRP54-202ENST00000546080 2187 ntTSL 2 BASIC11.51□□□□□ -0.57
SSBP2P81877 OSBPL8-201ENST00000261183 7239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
SSBP2P81877 OSBPL8-218ENST00000611266 7239 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
SSBP2P81877 DCUN1D4-202ENST00000381441 4207 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
SSBP2P81877 KIR3DL2-201ENST00000270442 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
SSBP2P81877 ZNF541-203ENST00000391901 4580 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
SSBP2P81877 MED15-204ENST00000406969 3210 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
SSBP2P81877 FAM219A-201ENST00000297620 3588 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.51□□□□□ -0.57
SSBP2P81877 EPN2-210ENST00000571254 1883 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
SSBP2P81877 HEPACAM-201ENST00000298251 3602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
SSBP2P81877 SIRPA-202ENST00000358771 3996 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
SSBP2P81877 SLC6A9-203ENST00000372306 1926 ntTSL 2 BASIC11.51□□□□□ -0.57
SSBP2P81877 CDK3-201ENST00000425876 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
SSBP2P81877 CDK3-202ENST00000448471 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
SSBP2P81877 GOLIM4-202ENST00000470487 4373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
SSBP2P81877 PUF60-209ENST00000527197 1559 ntTSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
SSBP2P81877 DNM2-204ENST00000408974 3013 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.51□□□□□ -0.57
SSBP2P81877 DIRAS3-201ENST00000370981 1973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.51□□□□□ -0.57
SSBP2P81877 HELLS-202ENST00000348459 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
SSBP2P81877 UPK3A-201ENST00000216211 1051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
SSBP2P81877 OR8S1-201ENST00000310194 1080 ntBASIC11.51□□□□□ -0.57
SSBP2P81877 CALCA-201ENST00000331587 843 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
SSBP2P81877 MDP1-202ENST00000396833 582 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
SSBP2P81877 PSTK-202ENST00000405485 1047 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.51□□□□□ -0.57
SSBP2P81877 Z98749.2-201ENST00000428294 700 ntTSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
SSBP2P81877 AP000696.1-201ENST00000457669 1133 ntTSL 3 BASIC11.51□□□□□ -0.57
SSBP2P81877 CCDC153-204ENST00000503566 1295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.9 ms