Protein–RNA interactions for Protein: P56746

CLDN15, Claudin-15, humanhuman

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Length 228 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDN15P56746 TINF2-215ENST00000626689 1643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
CLDN15P56746 PTGES3-207ENST00000614328 2077 ntTSL 3 BASIC12.87□□□□□ -0.35
CLDN15P56746 LRRN1-201ENST00000319331 3823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
CLDN15P56746 ERLIN2-205ENST00000518586 2623 ntTSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
CLDN15P56746 NELFE-201ENST00000375425 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
CLDN15P56746 SLC4A1-206ENST00000631130 1433 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
CLDN15P56746 PEX5L-215ENST00000485199 2992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
CLDN15P56746 UBE2A-202ENST00000371558 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
CLDN15P56746 METAP2-205ENST00000546753 1862 ntTSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
CLDN15P56746 DUSP13-208ENST00000478873 1335 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
CLDN15P56746 TNPO2-202ENST00000425528 5122 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
CLDN15P56746 VWA5B2-202ENST00000426955 4120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
CLDN15P56746 PLIN4-202ENST00000633942 6484 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
CLDN15P56746 TSC22D1-211ENST00000501704 4026 ntTSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
CLDN15P56746 EVC2-201ENST00000310917 4828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
CLDN15P56746 MTCL1-202ENST00000359865 6093 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
CLDN15P56746 CPN2-202ENST00000429275 2008 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
CLDN15P56746 AC020910.6-201ENST00000623084 1459 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
CLDN15P56746 CA12-202ENST00000344366 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
CLDN15P56746 C12orf73-201ENST00000378090 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
CLDN15P56746 SNX18-202ENST00000343017 3140 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
CLDN15P56746 COL5A1-AS1-201ENST00000371813 336 ntTSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
CLDN15P56746 FOLR1-202ENST00000393676 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
CLDN15P56746 HDDC2-202ENST00000398153 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
CLDN15P56746 AC131097.3-203ENST00000420272 1193 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
CLDN15P56746 AC007274.2-201ENST00000421675 662 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
CLDN15P56746 RLN3-201ENST00000431365 580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
CLDN15P56746 PTPA-217ENST00000434095 870 ntTSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
CLDN15P56746 AC026320.2-201ENST00000434379 478 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
CLDN15P56746 HCFC1-AS1-201ENST00000438219 350 ntTSL 3 BASIC12.86□□□□□ -0.35
CLDN15P56746 CEP164P1-201ENST00000455142 418 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
CLDN15P56746 RAMP3-202ENST00000481345 559 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC12.86□□□□□ -0.35
CLDN15P56746 ZNF124-204ENST00000491356 956 ntTSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
CLDN15P56746 RNA5SP423-201ENST00000517127 109 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
CLDN15P56746 SPAG5-AS1-203ENST00000554154 491 ntTSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
CLDN15P56746 ANKRD11-208ENST00000563291 593 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
CLDN15P56746 MIR3907-201ENST00000579424 151 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
CLDN15P56746 AC007718.1-201ENST00000621078 280 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
CLDN15P56746 AC015967.2-201ENST00000624092 234 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
CLDN15P56746 AC006435.4-201ENST00000625037 234 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
CLDN15P56746 AL356737.1-201ENST00000634391 234 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
CLDN15P56746 AC006453.1-201ENST00000636037 1257 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
CLDN15P56746 AC068587.10-201ENST00000641210 219 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
CLDN15P56746 CCDC180-210ENST00000529487 5242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
CLDN15P56746 RNF123-202ENST00000432042 2670 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
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CLDN15P56746 HPGD-209ENST00000510901 1535 ntTSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
CLDN15P56746 CDH16-202ENST00000394055 2821 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
CLDN15P56746 PCDHGA6-202ENST00000610583 5650 ntAPPRIS P1 BASIC12.86□□□□□ -0.35
CLDN15P56746 CLN8-204ENST00000519254 1769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
CLDN15P56746 LGALS12-202ENST00000340246 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
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CLDN15P56746 TAF1C-216ENST00000566732 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
CLDN15P56746 PPIL2-212ENST00000626352 2625 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
CLDN15P56746 ACTL8-202ENST00000617065 1670 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
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CLDN15P56746 MCHR2-202ENST00000369212 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
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CLDN15P56746 RIC1-201ENST00000251879 4127 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
CLDN15P56746 OTOF-202ENST00000338581 4954 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
CLDN15P56746 WNT9B-202ENST00000393461 2654 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
CLDN15P56746 POU6F1-208ENST00000550824 2664 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
CLDN15P56746 ILK-201ENST00000299421 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
CLDN15P56746 DHRS4-AS1-204ENST00000555045 1848 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
CLDN15P56746 NDFIP2-205ENST00000612570 4648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
CLDN15P56746 HELZ2-204ENST00000467148 8064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
CLDN15P56746 WNT7B-201ENST00000339464 3919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
CLDN15P56746 C2orf68-201ENST00000306336 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
CLDN15P56746 GGACT-201ENST00000376250 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.85□□□□□ -0.35
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CLDN15P56746 POU5F1-204ENST00000471529 1723 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
CLDN15P56746 AC007240.1-201ENST00000641498 1996 ntAPPRIS P1 BASIC12.85□□□□□ -0.35
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CLDN15P56746 PRR12-203ENST00000615927 4479 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
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CLDN15P56746 ARHGAP4-203ENST00000370028 3372 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
CLDN15P56746 MARK2-206ENST00000425897 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
CLDN15P56746 MPP2-214ENST00000523501 2121 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
CLDN15P56746 ACP2-212ENST00000533929 1366 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
CLDN15P56746 ZC3HAV1-203ENST00000464606 4776 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
CLDN15P56746 MRPL32-201ENST00000223324 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
CLDN15P56746 C6orf52-201ENST00000259983 619 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
CLDN15P56746 AC091046.1-201ENST00000331871 207 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
CLDN15P56746 AC073316.1-202ENST00000402115 988 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
CLDN15P56746 HLA-DQB2-229ENST00000411527 1059 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
CLDN15P56746 Z82214.1-201ENST00000419643 988 ntTSL 3 BASIC12.85□□□□□ -0.35
CLDN15P56746 LAMA4-208ENST00000431543 1080 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
CLDN15P56746 BMS1P17-203ENST00000444357 552 ntTSL 4 BASIC12.85□□□□□ -0.35
CLDN15P56746 AC083949.1-202ENST00000458490 552 ntTSL 3 BASIC12.85□□□□□ -0.35
CLDN15P56746 FAM167A-AS1-202ENST00000533578 1222 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
CLDN15P56746 SNHG21-204ENST00000559366 674 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
CLDN15P56746 AC099684.2-201ENST00000574520 870 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
CLDN15P56746 NEAT1-203ENST00000601801 487 ntTSL 4 BASIC12.85□□□□□ -0.35
CLDN15P56746 BMS1P22-203ENST00000609679 552 ntTSL 4 BASIC12.85□□□□□ -0.35
CLDN15P56746 AP001043.1-205ENST00000623098 1033 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
CLDN15P56746 ATL2-210ENST00000452935 2199 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
CLDN15P56746 GALNT4-201ENST00000529983 5399 ntAPPRIS P1 BASIC12.85□□□□□ -0.35
CLDN15P56746 POLR2E-213ENST00000615234 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
CLDN15P56746 SLC38A6-201ENST00000267488 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
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