Protein–RNA interactions for Protein: P54289

CACNA2D1, Voltage-dependent calcium channel subunit alpha-2/delta-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,103 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA2D1P54289 MAP3K1-201ENST00000399503 7011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CACNA2D1P54289 CEP164-201ENST00000278935 5630 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CACNA2D1P54289 KCNT1-209ENST00000490355 3708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CACNA2D1P54289 KRT8P19-201ENST00000551916 1455 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
CACNA2D1P54289 TPRX1-202ENST00000535759 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CACNA2D1P54289 CYB561-201ENST00000360793 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CACNA2D1P54289 MCHR2-202ENST00000369212 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CACNA2D1P54289 OPA1-203ENST00000361715 6384 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CACNA2D1P54289 CARD10-203ENST00000406271 3127 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CACNA2D1P54289 SACM1L-201ENST00000389061 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CACNA2D1P54289 IRF2BP2-201ENST00000366609 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CACNA2D1P54289 ATP6V0E2-207ENST00000479613 1666 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CACNA2D1P54289 ZNF77-201ENST00000314531 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CACNA2D1P54289 HDAC2-206ENST00000519108 2000 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CACNA2D1P54289 AC027612.1-201ENST00000445234 2395 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
CACNA2D1P54289 ALDH3A1-201ENST00000225740 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CACNA2D1P54289 DIAPH2-202ENST00000355827 3782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CACNA2D1P54289 METTL17-221ENST00000556670 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CACNA2D1P54289 AC022007.1-201ENST00000383808 1897 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CACNA2D1P54289 TMEM143-201ENST00000293261 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CACNA2D1P54289 SLCO2B1-217ENST00000532236 2593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CACNA2D1P54289 RSPO3-201ENST00000356698 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CACNA2D1P54289 PTPA-205ENST00000357197 2653 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CACNA2D1P54289 NUP98-201ENST00000324932 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CACNA2D1P54289 ZCCHC13-201ENST00000339534 842 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CACNA2D1P54289 COL5A1-AS1-201ENST00000371813 336 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CACNA2D1P54289 PARVG-202ENST00000415224 999 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CACNA2D1P54289 RPS9P1-201ENST00000419943 583 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
CACNA2D1P54289 LINC00313-205ENST00000427188 967 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CACNA2D1P54289 H2AFV-206ENST00000437072 589 ntTSL 4 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CACNA2D1P54289 HCFC1-AS1-201ENST00000438219 350 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CACNA2D1P54289 CEP164P1-201ENST00000455142 418 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
CACNA2D1P54289 SUPT4H1P2-201ENST00000501248 353 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
CACNA2D1P54289 PAGE3-202ENST00000519203 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CACNA2D1P54289 ANKRD11-208ENST00000563291 593 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CACNA2D1P54289 AC026803.1-201ENST00000569130 274 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
CACNA2D1P54289 CENPX-208ENST00000584347 799 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CACNA2D1P54289 AC005779.2-201ENST00000593083 550 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CACNA2D1P54289 AC106872.11-201ENST00000605838 421 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
CACNA2D1P54289 MAGEA1-201ENST00000356661 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CACNA2D1P54289 HPD-204ENST00000543163 1709 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CACNA2D1P54289 CCNH-201ENST00000256897 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CACNA2D1P54289 MPZL2-202ENST00000438295 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CACNA2D1P54289 CCNB1-201ENST00000256442 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CACNA2D1P54289 TRAK1-203ENST00000396175 5033 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CACNA2D1P54289 FECH-201ENST00000262093 3853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CACNA2D1P54289 NR6A1-205ENST00000487099 7031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CACNA2D1P54289 TMUB2-202ENST00000357984 1921 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CACNA2D1P54289 SUOX-201ENST00000266971 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CACNA2D1P54289 SPOCK3-202ENST00000357545 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CACNA2D1P54289 ZNF239-203ENST00000426961 2027 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CACNA2D1P54289 NUP54-217ENST00000514987 1563 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CACNA2D1P54289 ALDH3A2-226ENST00000631291 3822 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CACNA2D1P54289 USP31-203ENST00000567975 2142 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CACNA2D1P54289 HTR3A-206ENST00000506841 2221 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CACNA2D1P54289 CD59-201ENST00000351554 1775 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CACNA2D1P54289 ELFN2-207ENST00000613079 8360 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CACNA2D1P54289 INF2-209ENST00000617571 2956 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CACNA2D1P54289 MTMR9-202ENST00000526292 1960 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CACNA2D1P54289 TBC1D24-207ENST00000627285 4382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CACNA2D1P54289 NCOR2-203ENST00000404621 8520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CACNA2D1P54289 SP6-201ENST00000342234 3800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CACNA2D1P54289 MPHOSPH10-205ENST00000498451 2068 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CACNA2D1P54289 CAMK1D-204ENST00000619168 8153 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CACNA2D1P54289 ZSCAN5A-206ENST00000587492 1542 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CACNA2D1P54289 WDR59-201ENST00000262144 5898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CACNA2D1P54289 ZBTB20-215ENST00000481632 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CACNA2D1P54289 STXBP6-201ENST00000323944 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CACNA2D1P54289 AC013460.1-202ENST00000435062 2253 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CACNA2D1P54289 KCNH6-202ENST00000456941 2928 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CACNA2D1P54289 NOX5-209ENST00000530406 2289 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CACNA2D1P54289 PADI2-202ENST00000375486 4345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CACNA2D1P54289 DOK1-202ENST00000340004 1722 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CACNA2D1P54289 PLEKHN1-202ENST00000379409 2455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CACNA2D1P54289 PAF1-204ENST00000595564 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CACNA2D1P54289 STK33-203ENST00000396672 2558 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CACNA2D1P54289 TGIF2-201ENST00000373872 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CACNA2D1P54289 CAMK2D-204ENST00000394522 2696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CACNA2D1P54289 CLASRP-204ENST00000544944 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CACNA2D1P54289 TMEM184B-202ENST00000361906 3611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CACNA2D1P54289 DRC3-203ENST00000399187 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CACNA2D1P54289 AL022313.4-201ENST00000562756 2046 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
CACNA2D1P54289 KDELR2-201ENST00000258739 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CACNA2D1P54289 TMSB10-201ENST00000233143 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CACNA2D1P54289 PRIMA1-201ENST00000316227 1080 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CACNA2D1P54289 ESD-202ENST00000378720 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CACNA2D1P54289 ELK2AP-201ENST00000392510 1007 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
CACNA2D1P54289 INF2-203ENST00000392634 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CACNA2D1P54289 AL645608.5-201ENST00000398216 443 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CACNA2D1P54289 SAPCD1-208ENST00000415669 916 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CACNA2D1P54289 SNHG14-206ENST00000450809 677 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CACNA2D1P54289 RHEB-207ENST00000496004 744 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CACNA2D1P54289 AC093627.5-203ENST00000497320 746 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CACNA2D1P54289 AC008438.1-201ENST00000507521 549 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CACNA2D1P54289 LINC02380-201ENST00000510956 1038 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CACNA2D1P54289 AC093752.3-201ENST00000567343 901 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
CACNA2D1P54289 AL591471.1-201ENST00000621855 229 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
CACNA2D1P54289 ZNF619-201ENST00000314686 2233 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CACNA2D1P54289 TRAFD1-201ENST00000257604 3178 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CACNA2D1P54289 BRMS1-202ENST00000425825 1363 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 125.7 ms