Protein–RNA interactions for Protein: P53609

PGGT1B, Geranylgeranyl transferase type-1 subunit beta, humanhuman

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Length 377 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGGT1BP53609 USP39-207ENST00000450066 2086 ntTSL 2 BASIC14.23□□□□□ -0.13
PGGT1BP53609 HECTD3-202ENST00000372172 3610 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
PGGT1BP53609 EIF4G1-212ENST00000424196 5653 ntTSL 2 BASIC14.23□□□□□ -0.13
PGGT1BP53609 C14orf39-201ENST00000321731 2813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
PGGT1BP53609 GTF2IRD2-201ENST00000451013 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
PGGT1BP53609 MPV17-201ENST00000233545 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
PGGT1BP53609 MRPL34-201ENST00000252602 968 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
PGGT1BP53609 CLRN1-203ENST00000328863 738 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
PGGT1BP53609 MBD3L5-201ENST00000329753 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
PGGT1BP53609 SPAG11B-203ENST00000359758 612 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
PGGT1BP53609 SF3B5-201ENST00000367569 693 ntAPPRIS P1 BASIC14.23□□□□□ -0.13
PGGT1BP53609 TRAPPC3-203ENST00000373163 951 ntTSL 3 BASIC14.23□□□□□ -0.13
PGGT1BP53609 LIMS4-201ENST00000413601 1215 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
PGGT1BP53609 RPUSD3-204ENST00000424438 1005 ntTSL 2 BASIC14.23□□□□□ -0.13
PGGT1BP53609 SFTPC-202ENST00000437090 773 ntTSL 3 BASIC14.23□□□□□ -0.13
PGGT1BP53609 RPL35A-205ENST00000448864 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
PGGT1BP53609 GUSBP11-206ENST00000455485 3816 ntTSL 2 BASIC14.23□□□□□ -0.13
PGGT1BP53609 AL354710.2-201ENST00000468244 550 ntTSL 4 BASIC14.23□□□□□ -0.13
PGGT1BP53609 POLR2F-208ENST00000470701 584 ntTSL 3 BASIC14.23□□□□□ -0.13
PGGT1BP53609 LLPH-AS1-201ENST00000510317 623 ntTSL 4 BASIC14.23□□□□□ -0.13
PGGT1BP53609 AC090099.4-201ENST00000527671 1027 ntTSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
PGGT1BP53609 CCDC86-203ENST00000545580 697 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.23□□□□□ -0.13
PGGT1BP53609 AP001453.3-201ENST00000545800 853 ntTSL 3 BASIC14.23□□□□□ -0.13
PGGT1BP53609 AC023310.1-201ENST00000554836 735 ntBASIC14.23□□□□□ -0.13
PGGT1BP53609 CRHR1-208ENST00000577353 1206 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
PGGT1BP53609 AC005544.2-201ENST00000579138 229 ntTSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
PGGT1BP53609 COPS9-205ENST00000607357 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
PGGT1BP53609 AL035252.4-201ENST00000624174 288 ntBASIC14.23□□□□□ -0.13
PGGT1BP53609 AC092634.8-201ENST00000639687 773 ntTSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
PGGT1BP53609 HADH-202ENST00000403312 1752 ntTSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
PGGT1BP53609 URGCP-207ENST00000453200 4042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
PGGT1BP53609 PDE1C-205ENST00000396191 2952 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.23□□□□□ -0.13
PGGT1BP53609 ABI2-213ENST00000424558 2240 ntTSL 2 BASIC14.23□□□□□ -0.13
PGGT1BP53609 TAF9-202ENST00000328663 1461 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.23□□□□□ -0.13
PGGT1BP53609 C7orf65-201ENST00000408988 2911 ntTSL 2 BASIC14.23□□□□□ -0.13
PGGT1BP53609 ARMC5-201ENST00000268314 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
PGGT1BP53609 GRIN1-207ENST00000371560 3640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
PGGT1BP53609 ISLR-202ENST00000395118 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
PGGT1BP53609 MTSS1-216ENST00000524090 2166 ntTSL 2 BASIC14.23□□□□□ -0.13
PGGT1BP53609 AC011899.2-202ENST00000438047 4302 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
PGGT1BP53609 AC144522.1-201ENST00000625111 1658 ntBASIC14.23□□□□□ -0.13
PGGT1BP53609 SNAP47-203ENST00000366760 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.23□□□□□ -0.13
PGGT1BP53609 EDIL3-201ENST00000296591 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
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PGGT1BP53609 CUL7-203ENST00000535468 5504 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.22□□□□□ -0.13
PGGT1BP53609 MAN2C1-216ENST00000563622 2961 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
PGGT1BP53609 AC004899.2-201ENST00000622993 3860 ntBASIC14.22□□□□□ -0.13
PGGT1BP53609 ADGRG3-201ENST00000333493 2728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
PGGT1BP53609 KLHL34-201ENST00000379499 3641 ntAPPRIS P1 BASIC14.22□□□□□ -0.13
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PGGT1BP53609 LSM14A-203ENST00000544216 3596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
PGGT1BP53609 FH-201ENST00000366560 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
PGGT1BP53609 TEX264-205ENST00000416589 1313 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
PGGT1BP53609 LINC00327-203ENST00000576696 1308 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
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PGGT1BP53609 PHF21B-201ENST00000313237 3671 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
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PGGT1BP53609 DNM1-212ENST00000627543 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
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PGGT1BP53609 MSR1-201ENST00000262101 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
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PGGT1BP53609 LINC00595-217ENST00000635545 549 ntTSL 4 BASIC14.22□□□□□ -0.13
PGGT1BP53609 MYH6-202ENST00000405093 5941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
PGGT1BP53609 CCT8L1P-201ENST00000465400 1674 ntBASIC14.22□□□□□ -0.13
PGGT1BP53609 GOLIM4-202ENST00000470487 4373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
PGGT1BP53609 RGMB-201ENST00000308234 4580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
PGGT1BP53609 ADAM22-204ENST00000398204 9334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
PGGT1BP53609 ZC3H18-201ENST00000301011 3729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
PGGT1BP53609 NUTM2HP-201ENST00000442076 2498 ntBASIC14.22□□□□□ -0.13
PGGT1BP53609 SMIM12-206ENST00000521580 3454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
PGGT1BP53609 MRGPRX4-201ENST00000314254 1444 ntAPPRIS P1 BASIC14.22□□□□□ -0.13
PGGT1BP53609 METTL6-201ENST00000383789 1413 ntTSL 2 BASIC14.22□□□□□ -0.13
PGGT1BP53609 ACSM2A-209ENST00000573854 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
PGGT1BP53609 CTCFL-208ENST00000432255 2955 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
PGGT1BP53609 TMBIM6-217ENST00000549385 2771 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
PGGT1BP53609 KRBA2-202ENST00000396267 2562 ntTSL 2 BASIC14.22□□□□□ -0.13
PGGT1BP53609 TSC22D3-204ENST00000372384 2199 ntTSL 2 BASIC14.22□□□□□ -0.13
PGGT1BP53609 GOSR2-203ENST00000415811 2171 ntTSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
PGGT1BP53609 LINC02346-201ENST00000383019 1967 ntTSL 2 BASIC14.22□□□□□ -0.13
PGGT1BP53609 SERPING1-204ENST00000378324 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.22□□□□□ -0.13
PGGT1BP53609 MAPK4-206ENST00000592595 4330 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
PGGT1BP53609 GOSR2-233ENST00000640068 3103 ntTSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
PGGT1BP53609 SSTR1-201ENST00000267377 4295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.21□□□□□ -0.13
PGGT1BP53609 XRRA1-207ENST00000527087 2505 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
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