Protein–RNA interactions for Protein: P51530

DNA2, DNA replication ATP-dependent helicase/nuclease DNA2, humanhuman

Predictions only

Length 1,060 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DNA2P51530 AC072061.1-201ENST00000569710 2234 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
DNA2P51530 CTSW-201ENST00000307886 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
DNA2P51530 NRDC-202ENST00000354831 3895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
DNA2P51530 LIPE-201ENST00000244289 3813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
DNA2P51530 EBF3-201ENST00000355311 2993 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
DNA2P51530 SFTPC-202ENST00000437090 773 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
DNA2P51530 RALY-AS1-203ENST00000440595 660 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
DNA2P51530 IQCF3-202ENST00000440739 505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
DNA2P51530 LINC00841-201ENST00000451929 2126 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
DNA2P51530 AC007551.1-201ENST00000457394 519 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
DNA2P51530 TMEM198B-204ENST00000484016 896 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
DNA2P51530 AC005865.1-202ENST00000543036 641 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
DNA2P51530 AC068473.4-201ENST00000587527 585 ntTSL 4 BASIC15.54■□□□□ 0.08
DNA2P51530 AC010336.6-201ENST00000595107 528 ntTSL 4 BASIC15.54■□□□□ 0.08
DNA2P51530 AC092634.8-201ENST00000639687 773 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
DNA2P51530 GPR132-202ENST00000392585 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
DNA2P51530 ZNF341-202ENST00000375200 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
DNA2P51530 KCNS2-202ENST00000521839 4340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
DNA2P51530 CCT7-201ENST00000258091 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
DNA2P51530 TRIM4-203ENST00000355947 3383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
DNA2P51530 PATL2-208ENST00000560780 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
DNA2P51530 RBM6-211ENST00000443081 4010 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
DNA2P51530 STOML1-206ENST00000561656 1833 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
DNA2P51530 CYP1B1-AS1-201ENST00000413828 1781 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
DNA2P51530 AL022326.1-201ENST00000434516 1778 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
DNA2P51530 APOB-202ENST00000399256 3128 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
DNA2P51530 UBASH3A-203ENST00000398367 1733 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
DNA2P51530 ZNF790-207ENST00000614179 2361 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
DNA2P51530 RIPOR3-202ENST00000327979 4377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
DNA2P51530 SCNN1A-215ENST00000540037 3040 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
DNA2P51530 PPP4R3B-205ENST00000616288 4310 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
DNA2P51530 CLEC18B-204ENST00000617101 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
DNA2P51530 ZBED6CL-201ENST00000343855 2933 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
DNA2P51530 AC068888.1-207ENST00000546793 2863 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
DNA2P51530 TANGO2-205ENST00000401886 1559 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
DNA2P51530 CAMKV-202ENST00000463537 2818 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
DNA2P51530 CHMP7-202ENST00000397677 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
DNA2P51530 TAGLN-207ENST00000532870 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
DNA2P51530 CACNA2D2-204ENST00000424201 5206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
DNA2P51530 AC008125.1-201ENST00000548488 1538 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
DNA2P51530 DEPTOR-201ENST00000286234 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
DNA2P51530 FAM122B-203ENST00000370790 4246 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
DNA2P51530 PRSS16-203ENST00000421826 1949 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
DNA2P51530 CROT-203ENST00000419147 2959 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
DNA2P51530 HBP1-212ENST00000485846 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
DNA2P51530 PASK-201ENST00000234040 4572 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
DNA2P51530 MUC1-228ENST00000620103 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
DNA2P51530 UBXN1-201ENST00000294119 1291 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
DNA2P51530 RPL39L-201ENST00000296277 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
DNA2P51530 UBXN1-202ENST00000301935 1153 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
DNA2P51530 PRKN-201ENST00000338468 1276 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
DNA2P51530 NTMT1-202ENST00000372481 741 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
DNA2P51530 BLVRA-202ENST00000402924 1161 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
DNA2P51530 NGDN-202ENST00000408901 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
DNA2P51530 KIF9-205ENST00000432493 633 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
DNA2P51530 C2orf27AP3-201ENST00000434123 579 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
DNA2P51530 AC016694.1-201ENST00000434179 700 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
DNA2P51530 HOXB-AS1-201ENST00000435312 806 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
DNA2P51530 SVIL-AS1-208ENST00000446807 1007 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
DNA2P51530 DMKN-216ENST00000458071 510 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
DNA2P51530 TMEM14B-204ENST00000461342 559 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
DNA2P51530 FTH1P14-201ENST00000482930 551 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
DNA2P51530 ANAPC11-215ENST00000578550 599 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
DNA2P51530 C19orf53-206ENST00000593274 491 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
DNA2P51530 SCGB1C2-201ENST00000595228 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
DNA2P51530 AL359881.2-201ENST00000602973 570 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
DNA2P51530 MIR6805-201ENST00000615055 62 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
DNA2P51530 AC145423.3-201ENST00000615987 467 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
DNA2P51530 AL354718.3-201ENST00000616414 581 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
DNA2P51530 C9orf50-202ENST00000619117 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
DNA2P51530 CR382287.1-201ENST00000623954 586 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
DNA2P51530 CHD1L-211ENST00000639534 1144 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
DNA2P51530 CD68-202ENST00000380498 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
DNA2P51530 AP003555.1-202ENST00000511013 1755 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
DNA2P51530 KSR1-204ENST00000398988 7237 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
DNA2P51530 RFESD-201ENST00000311364 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
DNA2P51530 CIITA-213ENST00000618327 4657 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
DNA2P51530 ZBP1-201ENST00000371173 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
DNA2P51530 MIRLET7BHG-201ENST00000360737 4560 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
DNA2P51530 ELN-222ENST00000458204 3147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
DNA2P51530 UBA6-202ENST00000420827 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
DNA2P51530 ARHGEF9-230ENST00000637178 2145 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
DNA2P51530 ANKS1B-208ENST00000547010 2595 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
DNA2P51530 NIN-206ENST00000453196 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
DNA2P51530 EMC10-201ENST00000334976 9446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
DNA2P51530 SNHG28-201ENST00000368102 2501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
DNA2P51530 CFAP43-201ENST00000278064 2963 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
DNA2P51530 CCHCR1-203ENST00000396268 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
DNA2P51530 GPR84-202ENST00000551809 2041 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
DNA2P51530 CYB561D2-202ENST00000418577 1533 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
DNA2P51530 PDIA3P1-201ENST00000471856 1510 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
DNA2P51530 LRSAM1-203ENST00000373322 2849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
DNA2P51530 DENND1C-202ENST00000543576 2395 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
DNA2P51530 RNF167-201ENST00000262482 1915 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
DNA2P51530 NEK9-201ENST00000238616 8310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
DNA2P51530 LINC02076-201ENST00000577684 1871 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
DNA2P51530 PNKD-203ENST00000273077 3021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
DNA2P51530 AP1B1-202ENST00000357586 4176 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
DNA2P51530 CYP51A1-AS1-201ENST00000453068 2957 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
DNA2P51530 PIAS2-201ENST00000324794 4543 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.4 ms