Protein–RNA interactions for Protein: P30536

TSPO, Translocator protein, humanhuman

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Length 169 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSPOP30536 AGER-206ENST00000375070 1463 ntTSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
TSPOP30536 CAMK2A-203ENST00000398376 1493 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
TSPOP30536 AGER-208ENST00000438221 1493 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
TSPOP30536 GAP43-202ENST00000393780 1901 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
TSPOP30536 TSFM-207ENST00000540550 1935 ntTSL 2 BASIC11.11□□□□□ -0.63
TSPOP30536 DGCR8-201ENST00000351989 4514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
TSPOP30536 FAM90A12P-201ENST00000519497 2375 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
TSPOP30536 FAM90A24P-201ENST00000520792 2369 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
TSPOP30536 SH2D5-201ENST00000375031 3705 ntTSL 2 BASIC11.11□□□□□ -0.63
TSPOP30536 TNC-212ENST00000542877 5517 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
TSPOP30536 PDIA4-201ENST00000286091 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
TSPOP30536 ALDH8A1-204ENST00000367847 1587 ntTSL 2 BASIC11.11□□□□□ -0.63
TSPOP30536 PASK-203ENST00000403638 5161 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
TSPOP30536 KRTAP10-7-201ENST00000609664 1578 ntAPPRIS P1 BASIC11.11□□□□□ -0.63
TSPOP30536 PSMD13-215ENST00000621534 1572 ntTSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
TSPOP30536 RRM2B-211ENST00000621845 3483 ntTSL 2 BASIC11.11□□□□□ -0.63
TSPOP30536 SCN2B-201ENST00000278947 5826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
TSPOP30536 OTUD6A-201ENST00000338352 1689 ntAPPRIS P1 BASIC11.11□□□□□ -0.63
TSPOP30536 TDRKH-204ENST00000368825 2651 ntTSL 2 BASIC11.11□□□□□ -0.63
TSPOP30536 TPM3-205ENST00000328159 1771 ntTSL 2 BASIC11.11□□□□□ -0.63
TSPOP30536 WDR26-201ENST00000414423 6872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
TSPOP30536 AC051649.2-201ENST00000640310 3319 ntAPPRIS P1 BASIC11.11□□□□□ -0.63
TSPOP30536 CYB5R2-204ENST00000524790 1338 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
TSPOP30536 LRRC20-204ENST00000373224 3095 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.1□□□□□ -0.63
TSPOP30536 ECHDC1-220ENST00000528402 1449 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
TSPOP30536 USP47-202ENST00000339865 7775 ntTSL 2 BASIC11.1□□□□□ -0.63
TSPOP30536 ST8SIA1-203ENST00000396037 9714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
TSPOP30536 FN1-201ENST00000323926 8708 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
TSPOP30536 P2RX5-208ENST00000552050 1536 ntTSL 2 BASIC11.1□□□□□ -0.63
TSPOP30536 TNFAIP8L3-201ENST00000327536 2262 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
TSPOP30536 INHBA-203ENST00000442711 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
TSPOP30536 AC006262.1-203ENST00000598170 1634 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
TSPOP30536 GOLGA2P5-201ENST00000266746 2395 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
TSPOP30536 NEDD1-213ENST00000557644 2367 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
TSPOP30536 DLEU2-201ENST00000235290 1739 ntTSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
TSPOP30536 DNMT3L-201ENST00000270172 1706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
TSPOP30536 RIMS1-218ENST00000522291 3876 ntTSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
TSPOP30536 NHSL1-204ENST00000427025 7500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
TSPOP30536 PCBP2-202ENST00000359462 1814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
TSPOP30536 PPP1R12A-201ENST00000261207 5582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
TSPOP30536 TJAP1-204ENST00000372449 2695 ntTSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
TSPOP30536 TJAP1-205ENST00000372452 2665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
TSPOP30536 CMA1-201ENST00000206446 633 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
TSPOP30536 TSFM-201ENST00000323833 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
TSPOP30536 NCR3-204ENST00000376073 1097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
TSPOP30536 GATD1-203ENST00000397472 790 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
TSPOP30536 AL035588.1-201ENST00000438967 408 ntTSL 3 BASIC11.1□□□□□ -0.63
TSPOP30536 CRB3P1-201ENST00000449338 276 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
TSPOP30536 AP001107.3-201ENST00000534065 544 ntTSL 4 BASIC11.1□□□□□ -0.63
TSPOP30536 AC190387.1-201ENST00000551683 408 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
TSPOP30536 IL32-234ENST00000552936 713 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.1□□□□□ -0.63
TSPOP30536 TP53TG3HP-202ENST00000569755 579 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
TSPOP30536 HDDC2-203ENST00000608284 538 ntTSL 3 BASIC11.1□□□□□ -0.63
TSPOP30536 MIR8072-201ENST00000614241 80 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
TSPOP30536 ZNF655-225ENST00000626122 705 ntTSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
TSPOP30536 TUNAR-201ENST00000503525 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
TSPOP30536 SEMA6D-202ENST00000354744 5931 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
TSPOP30536 CICP1-201ENST00000416803 2410 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
TSPOP30536 KLHDC3-203ENST00000332245 1494 ntTSL 2 BASIC11.1□□□□□ -0.63
TSPOP30536 RPP40-202ENST00000380051 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
TSPOP30536 HSPA1L-201ENST00000375654 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
TSPOP30536 SLC8A3-205ENST00000394330 2622 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
TSPOP30536 MVK-214ENST00000629016 1591 ntTSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
TSPOP30536 SIGLEC9-201ENST00000250360 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
TSPOP30536 PARP1-203ENST00000366794 3958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
TSPOP30536 ARAP1-204ENST00000393609 5145 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.1□□□□□ -0.63
TSPOP30536 SALL4P5-201ENST00000419001 1760 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
TSPOP30536 LRRC34-208ENST00000522830 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
TSPOP30536 AC022007.1-201ENST00000383808 1897 ntTSL 2 BASIC11.1□□□□□ -0.63
TSPOP30536 DHX37-201ENST00000308736 4550 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
TSPOP30536 METAP1D-201ENST00000315796 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
TSPOP30536 ACADM-201ENST00000370834 2172 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
TSPOP30536 NINL-203ENST00000422516 3801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
TSPOP30536 DLGAP1-213ENST00000534970 2365 ntTSL 2 BASIC11.1□□□□□ -0.63
TSPOP30536 LPO-204ENST00000543544 2350 ntTSL 2 BASIC11.1□□□□□ -0.63
TSPOP30536 TLR6-202ENST00000436693 5880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
TSPOP30536 POU2F2-216ENST00000560558 3282 ntTSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
TSPOP30536 TP53INP2-202ENST00000374810 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
TSPOP30536 C12orf73-207ENST00000549478 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
TSPOP30536 AC006974.1-201ENST00000637928 1501 ntTSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
TSPOP30536 SPAAR-202ENST00000443779 1612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.09□□□□□ -0.63
TSPOP30536 CIC-204ENST00000572681 8218 ntTSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
TSPOP30536 OXA1L-201ENST00000285848 1719 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
TSPOP30536 RNF43-208ENST00000584437 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
TSPOP30536 EFR3B-205ENST00000405108 2432 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
TSPOP30536 COPS7B-224ENST00000620578 2500 ntTSL 2 BASIC11.09□□□□□ -0.63
TSPOP30536 HLA-E-201ENST00000376630 2601 ntAPPRIS P1 BASIC11.09□□□□□ -0.63
TSPOP30536 CDHR5-202ENST00000358353 3635 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
TSPOP30536 SP6-202ENST00000536300 3848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.09□□□□□ -0.63
TSPOP30536 NFKBIZ-202ENST00000326172 3923 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
TSPOP30536 GAPVD1-205ENST00000394084 3190 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
TSPOP30536 TRIM69-206ENST00000559390 2486 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.09□□□□□ -0.63
TSPOP30536 SPG11-202ENST00000427534 6935 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
TSPOP30536 CDK20-201ENST00000325303 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
TSPOP30536 NFE2L1-218ENST00000583378 2051 ntTSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
TSPOP30536 RAB42-201ENST00000373826 1950 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
TSPOP30536 RABL2A-206ENST00000409842 1979 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
TSPOP30536 AAAS-217ENST00000550286 1652 ntTSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
TSPOP30536 XAF1-201ENST00000346752 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
TSPOP30536 P2RY4-201ENST00000374519 1595 ntAPPRIS P1 BASIC11.09□□□□□ -0.63
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