Protein–RNA interactions for Protein: P29374

ARID4A, AT-rich interactive domain-containing protein 4A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,257 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARID4AP29374 SCARNA12-201ENST00000459155 270 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
ARID4AP29374 OR2T27-202ENST00000460972 1136 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ARID4AP29374 AC078852.2-201ENST00000504748 527 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ARID4AP29374 LINC02062-201ENST00000513175 478 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ARID4AP29374 AC087269.1-202ENST00000519147 400 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ARID4AP29374 EIF2B1-205ENST00000539951 848 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ARID4AP29374 LETMD1-235ENST00000552739 1713 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ARID4AP29374 AC090825.1-202ENST00000560059 665 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ARID4AP29374 IER5-201ENST00000367577 4188 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ARID4AP29374 DUOX1-201ENST00000321429 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ARID4AP29374 TSEN2-205ENST00000444864 2697 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ARID4AP29374 SLC41A1-201ENST00000367137 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ARID4AP29374 CDH1-213ENST00000612417 2068 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ARID4AP29374 ALDH1A2-201ENST00000249750 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ARID4AP29374 CADPS2-205ENST00000449022 4073 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ARID4AP29374 TTC22-202ENST00000371276 3345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ARID4AP29374 GRIK5-204ENST00000593562 3308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ARID4AP29374 NUMB-216ENST00000555394 3037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ARID4AP29374 KCNC1-201ENST00000265969 4295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ARID4AP29374 RELL1-201ENST00000314117 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ARID4AP29374 FXYD3-208ENST00000604404 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ARID4AP29374 SLC35C2-201ENST00000243896 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ARID4AP29374 MINPP1-202ENST00000371996 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ARID4AP29374 C7orf57-201ENST00000348904 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ARID4AP29374 SHMT2-203ENST00000449049 2121 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ARID4AP29374 SPN-201ENST00000360121 6894 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ARID4AP29374 FNDC1-201ENST00000297267 6552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ARID4AP29374 DDC-213ENST00000617822 1809 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ARID4AP29374 FAM219A-206ENST00000379087 3573 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ARID4AP29374 ZFP41-203ENST00000520584 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ARID4AP29374 METTL7B-201ENST00000394252 1506 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ARID4AP29374 PDP1-201ENST00000297598 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ARID4AP29374 RCOR1-201ENST00000262241 5754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ARID4AP29374 SUCO-210ENST00000616058 5495 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ARID4AP29374 VWA7-201ENST00000375688 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ARID4AP29374 COMP-203ENST00000542601 2707 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ARID4AP29374 AL139158.3-201ENST00000641212 1562 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
ARID4AP29374 MARK4-202ENST00000300843 5209 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ARID4AP29374 ANKRD23-201ENST00000318357 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ARID4AP29374 KCTD18-202ENST00000409157 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ARID4AP29374 VARS2-211ENST00000541562 3566 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ARID4AP29374 PKD1P6-NPIPP1-202ENST00000605794 2902 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ARID4AP29374 SMG8-201ENST00000300917 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ARID4AP29374 IQCE-216ENST00000611775 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ARID4AP29374 SLC26A8-201ENST00000355574 3463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ARID4AP29374 Metazoa_SRP.4-201ENST00000366232 298 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
ARID4AP29374 TCEA3-201ENST00000374601 1197 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ARID4AP29374 PEX13-203ENST00000414712 1014 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ARID4AP29374 AL121845.1-201ENST00000447343 464 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ARID4AP29374 AC108462.1-201ENST00000457467 850 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ARID4AP29374 AC092535.3-201ENST00000504969 468 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ARID4AP29374 SERGEF-208ENST00000528200 1264 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ARID4AP29374 AC135983.4-201ENST00000564116 1262 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
ARID4AP29374 SMIM22-209ENST00000591870 355 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ARID4AP29374 AC010422.5-201ENST00000597961 585 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ARID4AP29374 AC011491.1-203ENST00000637688 543 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
ARID4AP29374 CRB2-201ENST00000359999 3659 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ARID4AP29374 NAXD-201ENST00000309957 2659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ARID4AP29374 VIPAS39-208ENST00000556412 1832 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ARID4AP29374 AC046130.1-201ENST00000501954 2179 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ARID4AP29374 PPP1R1B-203ENST00000394267 1504 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ARID4AP29374 EEF1A1-202ENST00000316292 4441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ARID4AP29374 LINC00839-202ENST00000429940 2253 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ARID4AP29374 SLC20A2-207ENST00000520179 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ARID4AP29374 RHD-203ENST00000357542 1387 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ARID4AP29374 SDF2-201ENST00000247020 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ARID4AP29374 ANKRD42-201ENST00000260047 2514 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ARID4AP29374 RASGEF1C-202ENST00000393371 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ARID4AP29374 BORCS8-202ENST00000462790 1429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ARID4AP29374 CNTNAP3-202ENST00000358144 4885 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ARID4AP29374 B4GALNT3-201ENST00000266383 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ARID4AP29374 FABP1-202ENST00000393750 1839 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ARID4AP29374 XKRX-202ENST00000468904 2249 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ARID4AP29374 PNPLA3-201ENST00000216180 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ARID4AP29374 KDSR-201ENST00000326575 1024 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ARID4AP29374 MT1H-201ENST00000332374 397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ARID4AP29374 MYL3-202ENST00000395869 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ARID4AP29374 KRTAP2-2-201ENST00000398477 733 ntAPPRIS P2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ARID4AP29374 AC145207.1-201ENST00000415556 691 ntTSL 4 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ARID4AP29374 MPRIPP1-201ENST00000452433 1089 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
ARID4AP29374 TRBC2-201ENST00000466254 758 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ARID4AP29374 AL691482.3-201ENST00000504773 987 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ARID4AP29374 ENDOV-229ENST00000523999 864 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ARID4AP29374 AP000911.2-201ENST00000534330 502 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
ARID4AP29374 AC005696.1-201ENST00000572876 443 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ARID4AP29374 AC005041.3-201ENST00000606287 649 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
ARID4AP29374 LINC00969-254ENST00000625358 962 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ARID4AP29374 RETN-203ENST00000629642 400 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ARID4AP29374 SCAMP2-201ENST00000268099 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ARID4AP29374 ZNF497-201ENST00000311044 3468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ARID4AP29374 CYP1A1-207ENST00000567032 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ARID4AP29374 RTFDC1-201ENST00000023939 1745 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ARID4AP29374 STAMBPL1-204ENST00000371927 4184 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ARID4AP29374 DEF8-210ENST00000563594 4450 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ARID4AP29374 ZNF251-201ENST00000292562 2807 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ARID4AP29374 GGACT-201ENST00000376250 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ARID4AP29374 MAP3K11-208ENST00000530153 2830 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ARID4AP29374 MROH6-201ENST00000398882 3469 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ARID4AP29374 CXorf40A-209ENST00000441248 2411 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ARID4AP29374 FTX-216ENST00000638985 1367 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.3 ms