Protein–RNA interactions for Protein: P24723

PRKCH, Protein kinase C eta type, humanhuman

Predictions only

Length 683 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRKCHP24723 LRP5L-202ENST00000402859 1661 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
PRKCHP24723 LIG1-202ENST00000427526 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
PRKCHP24723 LMNA-213ENST00000473598 2015 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
PRKCHP24723 CICP17-201ENST00000418553 2377 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
PRKCHP24723 DTD2-201ENST00000310850 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
PRKCHP24723 ZBTB2-201ENST00000325144 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
PRKCHP24723 TBC1D3-201ENST00000620215 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
PRKCHP24723 TBC1D3C-201ENST00000622206 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
PRKCHP24723 NCKAP5L-201ENST00000335999 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
PRKCHP24723 ARMCX6-207ENST00000538627 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
PRKCHP24723 PIGC-201ENST00000344529 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
PRKCHP24723 TMPRSS2-201ENST00000332149 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
PRKCHP24723 POTEM-201ENST00000547889 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
PRKCHP24723 CAMKK2-209ENST00000446440 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
PRKCHP24723 PARD3B-204ENST00000406610 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
PRKCHP24723 ANKRD36BP2-202ENST00000421951 1899 ntTSL 3 BASIC14.82□□□□□ -0.04
PRKCHP24723 MST1-202ENST00000449682 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
PRKCHP24723 RUSC1-204ENST00000368352 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
PRKCHP24723 FGFR1-204ENST00000356207 3824 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
PRKCHP24723 SFXN3-202ENST00000393459 3098 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
PRKCHP24723 PSEN2-202ENST00000366783 2306 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
PRKCHP24723 MARVELD2-203ENST00000436532 1563 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
PRKCHP24723 PATL2-201ENST00000434130 1950 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
PRKCHP24723 AC005899.8-201ENST00000625127 3153 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
PRKCHP24723 FGGY-203ENST00000371212 1640 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
PRKCHP24723 RAB37-216ENST00000613645 1653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
PRKCHP24723 B9D1-202ENST00000268841 755 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
PRKCHP24723 CELA3B-201ENST00000337107 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
PRKCHP24723 RPS16-202ENST00000339471 643 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
PRKCHP24723 UFM1-202ENST00000379649 846 ntTSL 4 BASIC14.82□□□□□ -0.04
PRKCHP24723 TSPO-203ENST00000396265 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
PRKCHP24723 AC069277.1-202ENST00000414438 761 ntTSL 3 BASIC14.82□□□□□ -0.04
PRKCHP24723 AC078852.2-201ENST00000504748 527 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
PRKCHP24723 IGLV3-15-201ENST00000518356 244 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
PRKCHP24723 HOXA10-AS-202ENST00000519935 1161 ntTSL 3 BASIC14.82□□□□□ -0.04
PRKCHP24723 MIR4706-201ENST00000582134 82 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
PRKCHP24723 AC105105.3-201ENST00000585470 646 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
PRKCHP24723 MEG3_2.1-201ENST00000611456 105 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
PRKCHP24723 Metazoa_SRP.69-201ENST00000615730 281 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
PRKCHP24723 AC004706.3-207ENST00000634823 977 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
PRKCHP24723 PDE8B-203ENST00000340978 3426 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
PRKCHP24723 LETMD1-235ENST00000552739 1713 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
PRKCHP24723 KIF17-201ENST00000247986 3969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
PRKCHP24723 CKMT1B-201ENST00000300283 1779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
PRKCHP24723 CKMT1A-204ENST00000434505 1779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
PRKCHP24723 BCL2L13-206ENST00000399782 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
PRKCHP24723 TOB1-AS1-201ENST00000416263 1351 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
PRKCHP24723 MYLIP-201ENST00000349606 2796 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
PRKCHP24723 ZNF718-202ENST00000609714 2772 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
PRKCHP24723 PHTF1-204ENST00000369604 3273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
PRKCHP24723 C18orf25-206ENST00000619301 5264 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
PRKCHP24723 CACNA2D1-201ENST00000356253 3858 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
PRKCHP24723 FAH-201ENST00000261755 1471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
PRKCHP24723 COL5A1-208ENST00000618395 8437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
PRKCHP24723 AHCYL2-202ENST00000446544 5026 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
PRKCHP24723 TRIT1-214ENST00000537440 2026 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
PRKCHP24723 TGOLN2-203ENST00000398263 6138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
PRKCHP24723 RBPMS-202ENST00000320203 3110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
PRKCHP24723 RPS6KA4-202ENST00000528057 3121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
PRKCHP24723 LINC00680-205ENST00000450081 1593 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
PRKCHP24723 VAC14-AS1-201ENST00000398177 2145 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
PRKCHP24723 MARK2-206ENST00000425897 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
PRKCHP24723 TNFRSF11A-206ENST00000617039 3756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
PRKCHP24723 LIPA-202ENST00000336233 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
PRKCHP24723 FZD6-206ENST00000523739 2774 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
PRKCHP24723 USP33-202ENST00000370792 2917 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
PRKCHP24723 PPP1R26P4-201ENST00000619065 3527 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
PRKCHP24723 HADH-202ENST00000403312 1752 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
PRKCHP24723 CROT-203ENST00000419147 2959 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
PRKCHP24723 C1QTNF9-201ENST00000332018 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
PRKCHP24723 CPSF7-201ENST00000340437 3695 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
PRKCHP24723 MYL12B-201ENST00000237500 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
PRKCHP24723 FKBP11-202ENST00000444214 630 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
PRKCHP24723 MAGEA5-201ENST00000446757 942 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
PRKCHP24723 JMJD8-203ENST00000562824 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
PRKCHP24723 AC011466.3-201ENST00000596563 852 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
PRKCHP24723 AC006453.1-201ENST00000636037 1257 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
PRKCHP24723 AC128714.1-201ENST00000637035 887 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
PRKCHP24723 NFYC-215ENST00000456393 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
PRKCHP24723 KCTD3-201ENST00000259154 3931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
PRKCHP24723 KLK3-216ENST00000617027 1341 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
PRKCHP24723 UBL7-201ENST00000361351 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
PRKCHP24723 DDX20-201ENST00000369702 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
PRKCHP24723 NELFE-201ENST00000375425 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
PRKCHP24723 SCGN-203ENST00000612225 1402 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
PRKCHP24723 ZNF362-201ENST00000373428 2936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
PRKCHP24723 ELOVL1-201ENST00000372458 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
PRKCHP24723 PAIP2-202ENST00000394795 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
PRKCHP24723 IGFBP5-201ENST00000233813 6215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
PRKCHP24723 RILPL1-202ENST00000376874 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
PRKCHP24723 KIFC3-204ENST00000465878 3225 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
PRKCHP24723 FAM213A-203ENST00000372187 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
PRKCHP24723 EXOC6B-202ENST00000410104 5795 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
PRKCHP24723 OGFOD1-209ENST00000568397 1681 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
PRKCHP24723 CUL3-201ENST00000264414 6741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
PRKCHP24723 HSD17B6-207ENST00000555805 1722 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
PRKCHP24723 CETP-203ENST00000566128 1733 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
PRKCHP24723 LINC00882-204ENST00000484698 2718 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
PRKCHP24723 PAK1IP1-201ENST00000379568 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
PRKCHP24723 PPM1F-203ENST00000407142 5587 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
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