Protein–RNA interactions for Protein: P19634

SLC9A1, Sodium/hydrogen exchanger 1, humanhuman

Predictions only

Length 815 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC9A1P19634 ENO2-201ENST00000229277 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SLC9A1P19634 ASGR1-201ENST00000269299 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SLC9A1P19634 ALG3-205ENST00000445626 1533 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SLC9A1P19634 RNASEH2C-201ENST00000308418 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SLC9A1P19634 USP36-201ENST00000312010 5234 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SLC9A1P19634 PTENP1-202ENST00000532280 3996 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
SLC9A1P19634 TRMT2B-203ENST00000372939 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SLC9A1P19634 COL11A2-203ENST00000374708 6209 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SLC9A1P19634 SEMA7A-202ENST00000542748 3228 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SLC9A1P19634 ZC2HC1A-201ENST00000263849 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SLC9A1P19634 TICAM1-201ENST00000248244 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SLC9A1P19634 THEMIS2-201ENST00000328928 2337 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SLC9A1P19634 KIAA1468-201ENST00000256858 5579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SLC9A1P19634 ATP5J2-PTCD1-201ENST00000413834 2491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SLC9A1P19634 EXT1-201ENST00000378204 8270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SLC9A1P19634 KRTAP19-5-201ENST00000334151 461 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SLC9A1P19634 COX8C-201ENST00000342144 533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SLC9A1P19634 PKIG-201ENST00000349959 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SLC9A1P19634 MS4A13-201ENST00000378185 808 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SLC9A1P19634 SMS-201ENST00000379404 1174 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SLC9A1P19634 KRTAP10-3-201ENST00000391620 971 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SLC9A1P19634 IFT20-203ENST00000395418 825 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SLC9A1P19634 PUS10-202ENST00000398658 1227 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SLC9A1P19634 LIMS1-206ENST00000414829 439 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SLC9A1P19634 HNRNPA1P63-201ENST00000427917 963 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
SLC9A1P19634 AL451065.1-201ENST00000428958 238 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SLC9A1P19634 AC093484.1-201ENST00000441875 477 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SLC9A1P19634 Z93015.1-201ENST00000451718 390 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
SLC9A1P19634 TUBB8P8-201ENST00000458717 1058 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
SLC9A1P19634 LIMS3-205ENST00000487150 782 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SLC9A1P19634 HLA-J-204ENST00000495278 958 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
SLC9A1P19634 AC009487.3-201ENST00000505579 560 ntTSL 4 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SLC9A1P19634 PAX5-211ENST00000522003 1019 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SLC9A1P19634 CD74-212ENST00000524315 584 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SLC9A1P19634 SNHG9-201ENST00000531523 275 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SLC9A1P19634 IFT20-216ENST00000588477 774 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SLC9A1P19634 KLK3-211ENST00000597483 810 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SLC9A1P19634 TNNI1-201ENST00000336092 1750 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SLC9A1P19634 HADH-202ENST00000403312 1752 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SLC9A1P19634 ACVR1C-204ENST00000409680 1786 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SLC9A1P19634 ITGB2-206ENST00000397852 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SLC9A1P19634 ZFP90-209ENST00000570495 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SLC9A1P19634 FP565260.6-203ENST00000620015 1435 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SLC9A1P19634 CCDC197-206ENST00000640978 1429 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SLC9A1P19634 ZFP2-201ENST00000361362 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SLC9A1P19634 CAMKV-201ENST00000296471 2913 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SLC9A1P19634 ARHGEF7-201ENST00000218789 5233 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SLC9A1P19634 CYB5D2-203ENST00000575251 1588 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SLC9A1P19634 MYD88-201ENST00000396334 2850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SLC9A1P19634 FBXL21-202ENST00000467490 1742 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SLC9A1P19634 HSD17B6-207ENST00000555805 1722 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SLC9A1P19634 AGAP12P-201ENST00000585227 2359 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
SLC9A1P19634 SGCE-202ENST00000415788 1871 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SLC9A1P19634 ANO9-201ENST00000332826 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SLC9A1P19634 KRT8P29-201ENST00000420409 1371 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
SLC9A1P19634 PHF24-201ENST00000242315 5718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SLC9A1P19634 RGMB-201ENST00000308234 4580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SLC9A1P19634 AATBC-201ENST00000400385 4598 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SLC9A1P19634 FAM109A-201ENST00000361483 3256 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SLC9A1P19634 LINC00863-201ENST00000439559 3287 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SLC9A1P19634 GDAP1L1-208ENST00000617075 2645 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SLC9A1P19634 WNT7A-201ENST00000285018 4041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SLC9A1P19634 SRA1-201ENST00000336283 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SLC9A1P19634 CDK5RAP1-202ENST00000346416 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SLC9A1P19634 C19orf66-202ENST00000397881 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SLC9A1P19634 PPT1-203ENST00000433473 2267 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SLC9A1P19634 INMT-201ENST00000013222 2559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SLC9A1P19634 STK25-235ENST00000543554 2556 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SLC9A1P19634 CTSW-204ENST00000528419 1341 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SLC9A1P19634 ATAT1-206ENST00000376485 1476 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SLC9A1P19634 FGD5-206ENST00000543601 5768 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SLC9A1P19634 PML-201ENST00000268058 4508 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SLC9A1P19634 CPEB2-205ENST00000442003 6797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SLC9A1P19634 SEZ6-201ENST00000317338 4471 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SLC9A1P19634 RBM47-203ENST00000381795 4473 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SLC9A1P19634 WASHC3-201ENST00000240079 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SLC9A1P19634 TMEM40-201ENST00000264728 984 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SLC9A1P19634 VPS26B-201ENST00000281187 3691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SLC9A1P19634 SH3BGR-201ENST00000333634 1251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SLC9A1P19634 GTF2A2-204ENST00000396063 970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SLC9A1P19634 GTF2A2-205ENST00000396064 633 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SLC9A1P19634 MIR663B-201ENST00000408361 115 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
SLC9A1P19634 AC004899.1-201ENST00000424687 1714 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
SLC9A1P19634 XBP1P1-201ENST00000436573 652 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
SLC9A1P19634 AL662899.1-201ENST00000461287 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SLC9A1P19634 GTF2A2-208ENST00000484743 408 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SLC9A1P19634 NME2-204ENST00000503064 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SLC9A1P19634 HMGCLL1-208ENST00000508459 884 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SLC9A1P19634 AL355310.3-201ENST00000526411 582 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SLC9A1P19634 PPP1R32-205ENST00000538185 1107 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SLC9A1P19634 AP000438.1-201ENST00000543624 749 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SLC9A1P19634 ATP6V1D-206ENST00000554236 888 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SLC9A1P19634 AC008537.4-201ENST00000595728 1103 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SLC9A1P19634 MIR6805-201ENST00000615055 62 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
SLC9A1P19634 AC022748.3-201ENST00000621828 275 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
SLC9A1P19634 NCOR2-203ENST00000404621 8520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SLC9A1P19634 SEMA4B-201ENST00000332496 3781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SLC9A1P19634 PSAP-202ENST00000394936 2872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SLC9A1P19634 CAMKK2-209ENST00000446440 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SLC9A1P19634 ZMYND15-206ENST00000592813 2274 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.1 ms