Protein–RNA interactions for Protein: P15428

HPGD, 15-hydroxyprostaglandin dehydrogenase [NAD(+)], humanhuman

Predictions only

Length 266 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HPGDP15428 AP000350.4-201ENST00000433835 788 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
HPGDP15428 AC092800.1-201ENST00000449492 579 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
HPGDP15428 TUBB8P8-201ENST00000458717 1058 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
HPGDP15428 AC105362.1-201ENST00000511234 564 ntTSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
HPGDP15428 AC011773.1-201ENST00000520129 468 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
HPGDP15428 ZNF385A-213ENST00000551771 1111 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
HPGDP15428 C14orf132-204ENST00000556728 774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
HPGDP15428 RANGRF-205ENST00000580434 749 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
HPGDP15428 MIR4259-201ENST00000584466 101 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
HPGDP15428 ANKS3-227ENST00000592711 580 ntTSL 4 BASIC13.4□□□□□ -0.26
HPGDP15428 AC009955.4-201ENST00000597192 544 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
HPGDP15428 GGACT-201ENST00000376250 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
HPGDP15428 SAMD4A-201ENST00000251091 6565 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
HPGDP15428 PRICKLE3-204ENST00000453382 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
HPGDP15428 ZDHHC3-201ENST00000296127 3101 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
HPGDP15428 TMEM143-201ENST00000293261 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
HPGDP15428 C20orf166-AS1-203ENST00000475015 2585 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
HPGDP15428 KCND3-201ENST00000302127 2659 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
HPGDP15428 SLCO6A1-205ENST00000506729 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
HPGDP15428 ADGRD1-201ENST00000261654 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
HPGDP15428 TIAM1-201ENST00000286827 7200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
HPGDP15428 CNOT3-201ENST00000221232 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
HPGDP15428 SRRT-217ENST00000618411 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
HPGDP15428 CEP131-202ENST00000374782 3505 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
HPGDP15428 OTUD4-201ENST00000447906 3829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
HPGDP15428 CENPP-203ENST00000375587 8766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
HPGDP15428 PAX2-202ENST00000361791 3193 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
HPGDP15428 PORCN-201ENST00000326194 1755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
HPGDP15428 MAP3K21-202ENST00000366623 3910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
HPGDP15428 STXBP6-202ENST00000396700 4021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
HPGDP15428 PSD-209ENST00000611678 3382 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
HPGDP15428 DFFA-202ENST00000377038 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.27
HPGDP15428 ZNF717-204ENST00000478296 3875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
HPGDP15428 LINC00327-203ENST00000576696 1308 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
HPGDP15428 AL008718.2-201ENST00000609206 1313 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
HPGDP15428 AC064801.2-201ENST00000625052 1303 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
HPGDP15428 KBTBD4-202ENST00000430070 2372 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
HPGDP15428 SPOCK3-226ENST00000541354 2797 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
HPGDP15428 RCHY1-202ENST00000380840 1735 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
HPGDP15428 HLA-DPA1-242ENST00000419277 1704 ntAPPRIS P2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
HPGDP15428 PAF1-204ENST00000595564 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
HPGDP15428 ARHGAP36-201ENST00000276211 3083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
HPGDP15428 CSNK1G3-201ENST00000345990 4635 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
HPGDP15428 LARP4-201ENST00000293618 6296 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
HPGDP15428 TNIP1-214ENST00000522226 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
HPGDP15428 TMCO3-207ENST00000474393 2843 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
HPGDP15428 AC211486.1-201ENST00000275590 980 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
HPGDP15428 TEX29-201ENST00000283547 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
HPGDP15428 MBD3L5-201ENST00000329753 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
HPGDP15428 FCRLB-201ENST00000336830 1193 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
HPGDP15428 SPDYE7P-201ENST00000355920 1064 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
HPGDP15428 AL365277.1-206ENST00000417869 487 ntTSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
HPGDP15428 LINC01840-201ENST00000421870 571 ntTSL 4 BASIC13.39□□□□□ -0.27
HPGDP15428 SGK2-207ENST00000426287 1182 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
HPGDP15428 AL592464.1-201ENST00000429389 429 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
HPGDP15428 ZNF529-AS1-201ENST00000448373 1004 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
HPGDP15428 AL365277.1-204ENST00000450157 599 ntTSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
HPGDP15428 AL365277.1-203ENST00000458207 693 ntTSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
HPGDP15428 GLYCTK-203ENST00000461183 889 ntTSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
HPGDP15428 AC092944.1-202ENST00000487238 483 ntTSL 4 BASIC13.39□□□□□ -0.27
HPGDP15428 OSGIN2-203ENST00000520659 801 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
HPGDP15428 RIT1-205ENST00000539040 919 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
HPGDP15428 PUDP-206ENST00000540122 825 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
HPGDP15428 IL32-232ENST00000552356 623 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
HPGDP15428 AC011495.3-201ENST00000596472 427 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
HPGDP15428 NCR1-206ENST00000598576 996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
HPGDP15428 IGHV1OR21-1-201ENST00000622028 353 ntAPPRIS P1 BASIC13.39□□□□□ -0.27
HPGDP15428 PRRC2B-210ENST00000638390 1084 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
HPGDP15428 WDR83-201ENST00000418543 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
HPGDP15428 AC020910.6-201ENST00000623084 1459 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
HPGDP15428 DEF8-219ENST00000567874 1554 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
HPGDP15428 NIPAL3-202ENST00000339255 1676 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
HPGDP15428 FBXL7-203ENST00000510662 1758 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
HPGDP15428 PIGT-203ENST00000372689 1971 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
HPGDP15428 C22orf34-204ENST00000414287 2197 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
HPGDP15428 CACNA1G-207ENST00000429973 7120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
HPGDP15428 CACNA1G-217ENST00000507336 7116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
HPGDP15428 RFTN1-203ENST00000432519 2695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
HPGDP15428 USP19-207ENST00000434032 4677 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
HPGDP15428 SLC19A1-201ENST00000311124 3811 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
HPGDP15428 KCNC3-202ENST00000474951 3347 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
HPGDP15428 MKRN2-201ENST00000170447 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
HPGDP15428 ZNF251-201ENST00000292562 2807 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
HPGDP15428 LINC00475-202ENST00000416438 2506 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
HPGDP15428 CPN2-202ENST00000429275 2008 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
HPGDP15428 NTM-205ENST00000425719 1607 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
HPGDP15428 ZNF318-201ENST00000361428 8006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
HPGDP15428 TCAM1P-207ENST00000485295 1537 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
HPGDP15428 NXPH3-202ENST00000513748 1530 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
HPGDP15428 SERP1-201ENST00000239944 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
HPGDP15428 ANKRD36B-204ENST00000438709 6067 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
HPGDP15428 NBEA-204ENST00000400445 11119 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
HPGDP15428 TLR6-202ENST00000436693 5880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
HPGDP15428 SMAD2-203ENST00000402690 12075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
HPGDP15428 PAIP2-202ENST00000394795 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
HPGDP15428 RCSD1-202ENST00000367854 3135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
HPGDP15428 LINC01671-201ENST00000419628 1775 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
HPGDP15428 ZNF133-203ENST00000377671 2701 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
HPGDP15428 HSD17B4-206ENST00000504811 2740 ntTSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
HPGDP15428 RCAN3-207ENST00000538532 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.7 ms