Protein–RNA interactions for Protein: P11532

DMD, Dystrophin, humanhuman

Predictions only

Length 3,685 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DMDP11532 CPT1A-202ENST00000376618 2635 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
DMDP11532 ISCA2-204ENST00000556816 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
DMDP11532 SHROOM1-208ENST00000617339 3638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
DMDP11532 ARMCX6-208ENST00000539247 1928 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.57□□□□□ -0.24
DMDP11532 CRY2-201ENST00000417225 2053 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
DMDP11532 GP6-202ENST00000333884 2210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
DMDP11532 ASNS-201ENST00000175506 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
DMDP11532 CASC2-203ENST00000435944 3270 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
DMDP11532 DLGAP1-220ENST00000581699 2258 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
DMDP11532 BPI-201ENST00000262865 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
DMDP11532 F2RL1-201ENST00000296677 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
DMDP11532 CLEC18B-201ENST00000339953 1865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
DMDP11532 MRPL19-203ENST00000409374 1076 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
DMDP11532 PLA2G6-210ENST00000435484 612 ntTSL 4 BASIC13.57□□□□□ -0.24
DMDP11532 GYG1-209ENST00000483267 801 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
DMDP11532 CLEC18C-202ENST00000536907 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
DMDP11532 HERC2P5-202ENST00000564458 1164 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
DMDP11532 HERC2P8-203ENST00000564795 1164 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
DMDP11532 CTNNBL1-203ENST00000373473 1493 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
DMDP11532 CCNE2-201ENST00000308108 2724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
DMDP11532 BIRC5-203ENST00000374948 2446 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
DMDP11532 ADRA1A-204ENST00000380573 2548 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
DMDP11532 AC089987.1-201ENST00000551654 2209 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
DMDP11532 LINC00552-201ENST00000625151 2579 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
DMDP11532 PBX3-203ENST00000373487 2902 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
DMDP11532 AC123912.2-201ENST00000594927 2409 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
DMDP11532 ALOX15-202ENST00000570836 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
DMDP11532 AL583804.1-201ENST00000448643 810 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
DMDP11532 AP001107.9-202ENST00000531602 613 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
DMDP11532 Z82195.2-202ENST00000458525 1646 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
DMDP11532 AL139260.2-201ENST00000622355 2171 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
DMDP11532 AC004922.1-201ENST00000638617 2430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
DMDP11532 GPKOW-201ENST00000156109 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
DMDP11532 FBXL4-201ENST00000229971 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
DMDP11532 PRAMEF8-202ENST00000614831 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
DMDP11532 PRAMEF7-202ENST00000616979 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
DMDP11532 SLC25A32-201ENST00000297578 2891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
DMDP11532 FAM213A-203ENST00000372187 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
DMDP11532 NOMO2-211ENST00000621364 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
DMDP11532 SDCBP2P1-201ENST00000416115 614 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
DMDP11532 MNAT1-202ENST00000539616 1220 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
DMDP11532 AC078923.1-201ENST00000552856 748 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
DMDP11532 AC245427.1-201ENST00000633705 760 ntAPPRIS P1 BASIC13.56□□□□□ -0.24
DMDP11532 GABARAPL1-218ENST00000546017 2294 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
DMDP11532 PRNP-201ENST00000379440 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
DMDP11532 HOXA3-202ENST00000396352 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
DMDP11532 AC068946.1-202ENST00000318673 2745 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
DMDP11532 ZNF655-201ENST00000252713 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
DMDP11532 APOF-201ENST00000398189 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
DMDP11532 POU2F2-204ENST00000526816 3218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
DMDP11532 AK5-203ENST00000354567 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
DMDP11532 NOMO1-207ENST00000610363 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
DMDP11532 NUP93-201ENST00000308159 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
DMDP11532 PRMT7-203ENST00000449359 2091 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
DMDP11532 SEMA7A-201ENST00000261918 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
DMDP11532 RNF144A-AS1-203ENST00000426122 579 ntTSL 4 BASIC13.55□□□□□ -0.24
DMDP11532 FTH1-205ENST00000529631 507 ntTSL 4 BASIC13.55□□□□□ -0.24
DMDP11532 AC126177.4-201ENST00000547452 731 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
DMDP11532 AC099552.4-201ENST00000624248 949 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
DMDP11532 TMUB2-204ENST00000538716 1953 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
DMDP11532 AKAP1-202ENST00000337714 3970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
DMDP11532 PXYLP1-201ENST00000286353 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
DMDP11532 HNRNPU-201ENST00000283179 3120 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
DMDP11532 LPO-210ENST00000582328 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
DMDP11532 SLC4A1-206ENST00000631130 1433 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
DMDP11532 TNFRSF14-AS1-201ENST00000416860 3522 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
DMDP11532 BCAR1-204ENST00000418647 3387 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
DMDP11532 MGME1-201ENST00000377704 1781 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
DMDP11532 MORN2-205ENST00000410014 750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
DMDP11532 AC253536.1-201ENST00000437021 315 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
DMDP11532 MAP1LC3BP1-202ENST00000438342 516 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
DMDP11532 ALKBH2-203ENST00000440112 574 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
DMDP11532 AC004584.1-201ENST00000572187 549 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
DMDP11532 AC010335.3-201ENST00000623767 531 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
DMDP11532 TIGD4-201ENST00000304337 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
DMDP11532 AGAP7P-201ENST00000582299 2062 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
DMDP11532 AGAP14-201ENST00000624701 2060 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
DMDP11532 TRIM7-203ENST00000393315 2851 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
DMDP11532 MARK3-202ENST00000303622 3283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
DMDP11532 GUCD1-206ENST00000435822 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
DMDP11532 LINC00839-202ENST00000429940 2253 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
DMDP11532 RNF181-201ENST00000306368 569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
DMDP11532 TAGLN2-201ENST00000320307 709 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
DMDP11532 TPM3-211ENST00000368531 1115 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
DMDP11532 MIR766-201ENST00000390223 111 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
DMDP11532 SERPINB8P1-201ENST00000401898 377 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
DMDP11532 FTLP3-201ENST00000427242 528 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
DMDP11532 PGK1P2-201ENST00000431702 1214 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
DMDP11532 AC015818.1-201ENST00000451011 244 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
DMDP11532 GULOP-201ENST00000454030 748 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
DMDP11532 BICD1P1-201ENST00000457832 1222 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
DMDP11532 PDPN-208ENST00000509009 571 ntTSL 4 BASIC13.55□□□□□ -0.24
DMDP11532 HNRNPA1P11-201ENST00000580106 956 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
DMDP11532 PDZRN3-AS1-203ENST00000608743 780 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
DMDP11532 FAM83A-AS1-202ENST00000520576 1347 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
DMDP11532 ZNF577-202ENST00000451628 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
DMDP11532 GNPNAT1-203ENST00000554230 2238 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
DMDP11532 NPRL3-212ENST00000620134 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
DMDP11532 C17orf80-202ENST00000268942 3449 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
DMDP11532 LINC01184-204ENST00000501702 2977 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.7 ms