Protein–RNA interactions for Protein: P10071

GLI3, Transcriptional activator GLI3, humanhuman

Predictions only

Length 1,580 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GLI3P10071 APP-204ENST00000357903 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
GLI3P10071 PTK6-202ENST00000542869 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
GLI3P10071 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
GLI3P10071 ETS1-208ENST00000535549 4594 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
GLI3P10071 MFRP-201ENST00000360167 1663 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
GLI3P10071 NOMO3-202ENST00000399336 4356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
GLI3P10071 GARS-201ENST00000389266 2634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
GLI3P10071 WAC-AS1-202ENST00000528337 2608 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
GLI3P10071 GUCD1-204ENST00000407471 3482 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.5
GLI3P10071 GPAT2-204ENST00000453542 2466 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.5
GLI3P10071 COBLL1-201ENST00000342193 4898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
GLI3P10071 ZNF34-201ENST00000343459 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
GLI3P10071 ZNF34-202ENST00000429371 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
GLI3P10071 TRO-225ENST00000622017 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.5
GLI3P10071 ADK-205ENST00000539909 1866 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.5
GLI3P10071 MAPT-206ENST00000415613 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.5
GLI3P10071 SLC44A2-201ENST00000335757 3671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
GLI3P10071 ZBTB9-201ENST00000395064 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
GLI3P10071 MAPK7-203ENST00000395602 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
GLI3P10071 SLC34A2-202ENST00000503434 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
GLI3P10071 SLC34A2-203ENST00000504570 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
GLI3P10071 KCNG4-202ENST00000568181 2199 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
GLI3P10071 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
GLI3P10071 PRDX2-202ENST00000334482 784 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
GLI3P10071 IGLJ1-201ENST00000390320 127 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
GLI3P10071 RPL15-205ENST00000415719 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
GLI3P10071 MKNK1-205ENST00000428112 1270 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
GLI3P10071 ACTG1P23-201ENST00000437653 1074 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
GLI3P10071 AC104212.2-201ENST00000478813 628 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
GLI3P10071 AC114812.4-201ENST00000506676 757 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
GLI3P10071 UBE2D3-221ENST00000507845 577 ntTSL 4 BASIC18.14■□□□□ 0.49
GLI3P10071 ALG10-202ENST00000538927 571 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
GLI3P10071 LINC01225-202ENST00000562339 2113 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
GLI3P10071 AC015818.3-201ENST00000583797 589 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
GLI3P10071 AC063977.2-201ENST00000601996 421 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
GLI3P10071 AL109954.3-201ENST00000615088 558 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
GLI3P10071 LINC00926-201ENST00000501726 2530 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
GLI3P10071 TINF2-215ENST00000626689 1643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
GLI3P10071 RXRG-201ENST00000359842 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
GLI3P10071 BIRC5-203ENST00000374948 2446 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
GLI3P10071 AC144831.1-201ENST00000573312 2656 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
GLI3P10071 LINC00675-202ENST00000581851 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
GLI3P10071 KCNC2-207ENST00000548513 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
GLI3P10071 CEP76-201ENST00000262127 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
GLI3P10071 PSMC3IP-201ENST00000253789 1408 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
GLI3P10071 COX11-201ENST00000299335 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
GLI3P10071 ZCCHC24-202ENST00000372336 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
GLI3P10071 SMAD2-212ENST00000591214 1714 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
GLI3P10071 TUBB8P4-201ENST00000511806 1324 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
GLI3P10071 RASA4B-202ENST00000465829 2931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
GLI3P10071 RBMX2P5-201ENST00000424312 969 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
GLI3P10071 AC009517.1-201ENST00000454750 570 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
GLI3P10071 RN7SL47P-201ENST00000488710 299 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
GLI3P10071 NEMF-210ENST00000556672 590 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
GLI3P10071 AC003070.1-201ENST00000592389 457 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
GLI3P10071 AC136475.1-203ENST00000602756 1034 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
GLI3P10071 AC099552.4-201ENST00000624248 949 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
GLI3P10071 EIF3F-209ENST00000640290 372 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
GLI3P10071 ACAD8-201ENST00000281182 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
GLI3P10071 LRRN2-203ENST00000367177 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
GLI3P10071 AGPAT1-205ENST00000395497 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
GLI3P10071 HECTD2-204ENST00000446394 4939 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
GLI3P10071 AL591806.3-201ENST00000289779 2096 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
GLI3P10071 DLG2-205ENST00000398301 2070 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
GLI3P10071 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
GLI3P10071 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
GLI3P10071 PCDHGA12-202ENST00000613314 2634 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
GLI3P10071 PIK3R2-201ENST00000222254 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
GLI3P10071 ELMOD1-201ENST00000265840 2852 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
GLI3P10071 ARHGAP9-201ENST00000393791 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
GLI3P10071 BIN3-205ENST00000519513 1431 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
GLI3P10071 C2orf68-201ENST00000306336 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
GLI3P10071 ZSCAN21-203ENST00000456748 1904 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
GLI3P10071 MTHFD1L-211ENST00000611279 3475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
GLI3P10071 TAGLN3-205ENST00000478951 1301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
GLI3P10071 NEAT1-201ENST00000499732 1811 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
GLI3P10071 KCNIP2-203ENST00000348850 2089 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
GLI3P10071 SCLT1-208ENST00000506368 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
GLI3P10071 EFHC1-230ENST00000637263 2089 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
GLI3P10071 SLC7A4-201ENST00000382932 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
GLI3P10071 SLC7A4-202ENST00000403586 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
GLI3P10071 GAST-201ENST00000329402 470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
GLI3P10071 CMTM5-204ENST00000382809 378 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
GLI3P10071 NANOS3-202ENST00000397555 769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
GLI3P10071 IGFL1-201ENST00000437936 769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
GLI3P10071 AL139099.3-201ENST00000556657 401 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
GLI3P10071 IFI27L1-211ENST00000557066 580 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
GLI3P10071 TNFRSF10A-204ENST00000613472 978 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
GLI3P10071 PACRG-AS3-203ENST00000614038 1246 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
GLI3P10071 AC116631.1-201ENST00000640685 576 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
GLI3P10071 AC015813.5-201ENST00000624641 1514 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
GLI3P10071 CREB5-202ENST00000396298 2001 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
GLI3P10071 RNASE4-203ENST00000555835 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
GLI3P10071 C1orf43-206ENST00000368521 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
GLI3P10071 ECI2-202ENST00000380118 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
GLI3P10071 KCNJ11-204ENST00000528731 2146 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
GLI3P10071 AC012617.1-204ENST00000586340 2305 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
GLI3P10071 TNRC18P2-201ENST00000417666 2714 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
GLI3P10071 PLEKHB2-206ENST00000409612 2210 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
GLI3P10071 AL031280.1-201ENST00000436991 2224 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.2 ms