Protein–RNA interactions for Protein: O96006

ZBED1, Zinc finger BED domain-containing protein 1, humanhuman

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Length 694 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZBED1O96006 MKL1-202ENST00000396617 4505 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ZBED1O96006 RBPMS-201ENST00000287771 2974 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ZBED1O96006 ITGA6-202ENST00000409080 5306 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ZBED1O96006 MN1-201ENST00000302326 7556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ZBED1O96006 SMG8-201ENST00000300917 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ZBED1O96006 CLEC16A-202ENST00000409552 3365 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ZBED1O96006 CHIA-206ENST00000430615 1320 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ZBED1O96006 LINC00905-203ENST00000588838 1414 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ZBED1O96006 TRIM13-202ENST00000378182 7249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ZBED1O96006 PCBP2-215ENST00000549863 1619 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ZBED1O96006 TRIM23-202ENST00000274327 1829 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ZBED1O96006 FAM149A-203ENST00000389354 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ZBED1O96006 TRIM45-202ENST00000369461 2415 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ZBED1O96006 SLC29A4-203ENST00000406453 2734 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ZBED1O96006 PNPLA6-201ENST00000221249 4617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ZBED1O96006 SLIT1-201ENST00000266058 7925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ZBED1O96006 SUGP2-214ENST00000600377 4752 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ZBED1O96006 ALDH4A1-206ENST00000538839 2957 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ZBED1O96006 ZKSCAN2-201ENST00000328086 7523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ZBED1O96006 ABCA7-202ENST00000433129 6704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ZBED1O96006 RSBN1-201ENST00000261441 6621 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ZBED1O96006 AC007240.1-201ENST00000641498 1996 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ZBED1O96006 CCP110-203ENST00000396212 5549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ZBED1O96006 ALDH3A1-201ENST00000225740 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ZBED1O96006 GDF9-201ENST00000296875 1796 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ZBED1O96006 SLC35G2-201ENST00000393079 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ZBED1O96006 TEX44-201ENST00000313965 1383 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ZBED1O96006 ARHGAP45-206ENST00000586866 4120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ZBED1O96006 GRSF1-201ENST00000254799 6666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ZBED1O96006 NPFF-201ENST00000267017 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ZBED1O96006 RAB36-202ENST00000341989 936 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ZBED1O96006 FCGR1B-203ENST00000369384 1044 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ZBED1O96006 MIR769-201ENST00000390225 118 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
ZBED1O96006 MEMO1-204ENST00000407893 682 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ZBED1O96006 RNF144A-AS1-203ENST00000426122 579 ntTSL 4 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ZBED1O96006 LINC01352-201ENST00000431347 962 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ZBED1O96006 ADM-202ENST00000524948 584 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ZBED1O96006 CNGA4-202ENST00000533426 936 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ZBED1O96006 MSRB3-209ENST00000540804 884 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ZBED1O96006 IFT20-214ENST00000585089 1071 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ZBED1O96006 ADH5-213ENST00000626055 1299 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ZBED1O96006 COL6A2-202ENST00000310645 3446 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ZBED1O96006 PCDHGA6-202ENST00000610583 5650 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ZBED1O96006 ZFP36L1-201ENST00000336440 3026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ZBED1O96006 ZNF663P-201ENST00000400371 2722 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ZBED1O96006 CFLAR-206ENST00000395148 4415 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ZBED1O96006 C3orf33-205ENST00000534941 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ZBED1O96006 SNRPN-203ENST00000400097 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ZBED1O96006 SBF1-202ENST00000380817 8008 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ZBED1O96006 FKBP9-214ENST00000538336 3621 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ZBED1O96006 AL133338.1-201ENST00000565695 1517 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
ZBED1O96006 LINC00339-208ENST00000634934 1518 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ZBED1O96006 TGIF2-202ENST00000373874 3432 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ZBED1O96006 ANXA6-202ENST00000377751 1430 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ZBED1O96006 OSBPL1A-201ENST00000319481 4195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ZBED1O96006 MST1P2-201ENST00000457982 2291 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
ZBED1O96006 AL031595.1-201ENST00000623969 4709 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
ZBED1O96006 ZNF570-201ENST00000330173 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ZBED1O96006 AMACR-203ENST00000382072 2919 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ZBED1O96006 GGACT-201ENST00000376250 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ZBED1O96006 ARHGAP9-213ENST00000550288 2818 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ZBED1O96006 PIGT-203ENST00000372689 1971 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ZBED1O96006 CBX6-201ENST00000216083 3191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ZBED1O96006 CBFA2T3-201ENST00000268679 4477 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ZBED1O96006 GPAT2-202ENST00000434632 3061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ZBED1O96006 ACTL8-202ENST00000617065 1670 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ZBED1O96006 MSI1-201ENST00000257552 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ZBED1O96006 CORO7-201ENST00000251166 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ZBED1O96006 TFR2-201ENST00000223051 2888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ZBED1O96006 ROBO4-201ENST00000306534 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ZBED1O96006 AC020910.6-201ENST00000623084 1459 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
ZBED1O96006 PPIL2-202ENST00000398831 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ZBED1O96006 ZNF362-205ENST00000539719 3106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ZBED1O96006 FOXO4-201ENST00000341558 1353 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ZBED1O96006 NIT1-203ENST00000368009 1362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ZBED1O96006 LMX1B-202ENST00000373474 5797 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ZBED1O96006 GRM7-203ENST00000389336 2901 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ZBED1O96006 ABHD4-201ENST00000216327 716 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ZBED1O96006 ARF5-201ENST00000000233 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ZBED1O96006 CRYBA4-201ENST00000354760 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ZBED1O96006 KRTAP19-9P-201ENST00000421795 191 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
ZBED1O96006 AL162742.1-201ENST00000434792 954 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ZBED1O96006 AC135178.1-201ENST00000458568 537 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ZBED1O96006 AC082651.1-201ENST00000478468 832 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ZBED1O96006 AC009487.3-201ENST00000505579 560 ntTSL 4 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ZBED1O96006 HMGCLL1-208ENST00000508459 884 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ZBED1O96006 SNHG14-213ENST00000551077 638 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ZBED1O96006 AC010754.1-201ENST00000582300 1061 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ZBED1O96006 AC008133.1-201ENST00000584688 557 ntTSL 4 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ZBED1O96006 AP005264.3-201ENST00000592370 485 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ZBED1O96006 SERPINE3-204ENST00000524365 2293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ZBED1O96006 AC015712.6-201ENST00000431060 5068 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ZBED1O96006 AC011474.4-201ENST00000623523 2076 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
ZBED1O96006 ADAMTS7P1-201ENST00000613213 4793 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
ZBED1O96006 CCDC180-210ENST00000529487 5242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ZBED1O96006 DDR1-271ENST00000513240 2882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ZBED1O96006 AKNA-204ENST00000374075 5038 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ZBED1O96006 BSDC1-205ENST00000446293 1505 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ZBED1O96006 TP53I11-201ENST00000308212 3683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ZBED1O96006 MRGPRX4-201ENST00000314254 1444 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
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