Protein–RNA interactions for Protein: O43889

CREB3, Cyclic AMP-responsive element-binding protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 395 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CREB3O43889 AL591846.1-201ENST00000451736 433 ntBASIC15.04■□□□□ -0
CREB3O43889 NME2-204ENST00000503064 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CREB3O43889 LINC01848-201ENST00000523446 518 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
CREB3O43889 RCE1-204ENST00000525356 1270 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
CREB3O43889 PPP1R32-205ENST00000538185 1107 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
CREB3O43889 USB1-203ENST00000539737 1212 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
CREB3O43889 DERL2-202ENST00000570848 657 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
CREB3O43889 ABBA01031663.1-201ENST00000635630 790 ntBASIC15.04■□□□□ -0
CREB3O43889 SHROOM1-208ENST00000617339 3638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
CREB3O43889 SNPH-201ENST00000381867 5533 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CREB3O43889 SFXN3-201ENST00000224807 3089 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
CREB3O43889 CRCP-203ENST00000395326 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CREB3O43889 CDIP1-205ENST00000563332 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CREB3O43889 RP1L1-202ENST00000382483 7973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CREB3O43889 ANKRD42-201ENST00000260047 2514 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CREB3O43889 SPRY1-208ENST00000622283 2352 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
CREB3O43889 CRTC1-202ENST00000338797 6929 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CREB3O43889 TMEM184B-202ENST00000361906 3611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CREB3O43889 PPFIA4-203ENST00000367240 6434 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
CREB3O43889 MPP2-214ENST00000523501 2121 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
CREB3O43889 HDAC2-206ENST00000519108 2000 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
CREB3O43889 KIF21B-201ENST00000332129 9897 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CREB3O43889 SMTN-223ENST00000619644 3227 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
CREB3O43889 LIG1-203ENST00000536218 3179 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
CREB3O43889 TRIM23-202ENST00000274327 1829 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CREB3O43889 ALAS2-202ENST00000335854 1795 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
CREB3O43889 PROM2-203ENST00000403131 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CREB3O43889 AC144522.1-201ENST00000625111 1658 ntBASIC15.03■□□□□ -0
CREB3O43889 PHF8-202ENST00000338154 6062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CREB3O43889 FRMD8-201ENST00000317568 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CREB3O43889 YIPF6-204ENST00000462683 6741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CREB3O43889 PELP1-212ENST00000574876 3465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CREB3O43889 ELAVL1-205ENST00000596459 1473 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
CREB3O43889 SGCE-204ENST00000428696 1409 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CREB3O43889 HSFX2-201ENST00000598963 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CREB3O43889 IQCE-216ENST00000611775 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
CREB3O43889 SMTN-202ENST00000347557 3130 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CREB3O43889 SMARCA2-208ENST00000382194 5679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
CREB3O43889 DCHS1-201ENST00000299441 10765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CREB3O43889 PLK2-201ENST00000274289 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CREB3O43889 RUFY2-202ENST00000342616 983 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
CREB3O43889 NAALADL1-202ENST00000355721 2100 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
CREB3O43889 RPF1-202ENST00000370656 724 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
CREB3O43889 ZNF248-202ENST00000374648 1286 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CREB3O43889 SPECC1-202ENST00000395522 2982 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CREB3O43889 LIMS1-206ENST00000414829 439 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CREB3O43889 TUBB8P8-201ENST00000458717 1058 ntBASIC15.03■□□□□ -0
CREB3O43889 LIMS3-205ENST00000487150 782 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
CREB3O43889 STARD4-205ENST00000505803 803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
CREB3O43889 STARD4-207ENST00000509887 1186 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CREB3O43889 AL160314.3-201ENST00000556041 767 ntBASIC15.03■□□□□ -0
CREB3O43889 DPF3-210ENST00000556509 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CREB3O43889 AL031600.1-201ENST00000563610 570 ntTSL 4 BASIC15.03■□□□□ -0
CREB3O43889 AP003096.1-203ENST00000564469 563 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
CREB3O43889 C15orf40-211ENST00000565712 559 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
CREB3O43889 AC105020.3-201ENST00000566036 560 ntTSL 4 BASIC15.03■□□□□ -0
CREB3O43889 AC008805.1-201ENST00000590892 364 ntBASIC15.03■□□□□ -0
CREB3O43889 SEPT9-233ENST00000590917 541 ntTSL 4 BASIC15.03■□□□□ -0
CREB3O43889 AC007663.3-201ENST00000609632 465 ntBASIC15.03■□□□□ -0
CREB3O43889 MIR6752-201ENST00000618442 71 ntBASIC15.03■□□□□ -0
CREB3O43889 CR381653.1-201ENST00000622961 812 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
CREB3O43889 SNX20-202ENST00000330943 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CREB3O43889 COL8A2-201ENST00000303143 4447 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
CREB3O43889 RBFADN-204ENST00000568911 5187 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
CREB3O43889 ACIN1-201ENST00000262710 4935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CREB3O43889 STRC-205ENST00000450892 5680 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
CREB3O43889 LRRFIP1-204ENST00000392000 3365 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CREB3O43889 DOCK4-206ENST00000437633 6212 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CREB3O43889 XPNPEP1-201ENST00000322238 2467 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CREB3O43889 INF2-209ENST00000617571 2956 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CREB3O43889 HNRNPH1-203ENST00000393432 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CREB3O43889 CC2D1B-201ENST00000284376 3377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
CREB3O43889 TMEM9-204ENST00000367334 1529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
CREB3O43889 NXPH3-202ENST00000513748 1530 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
CREB3O43889 ABCA7-202ENST00000433129 6704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
CREB3O43889 ALDH1A3-202ENST00000346623 3104 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
CREB3O43889 EP400NL-206ENST00000446190 3697 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
CREB3O43889 ARID3B-206ENST00000622429 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
CREB3O43889 MUTYH-210ENST00000450313 1929 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
CREB3O43889 FAM172A-206ENST00000509163 1369 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
CREB3O43889 WNT3A-201ENST00000284523 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
CREB3O43889 GRWD1-201ENST00000253237 5571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
CREB3O43889 PDE4D-203ENST00000340635 8232 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
CREB3O43889 UGT3A2-201ENST00000282507 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
CREB3O43889 RUSC1-204ENST00000368352 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
CREB3O43889 FAM149A-203ENST00000389354 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
CREB3O43889 EGR2-202ENST00000411732 2824 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
CREB3O43889 EMC4-201ENST00000249209 852 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
CREB3O43889 BX284668.5-201ENST00000422124 406 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
CREB3O43889 AL157902.1-202ENST00000425010 763 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
CREB3O43889 MIR663AHG-201ENST00000427348 1213 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
CREB3O43889 AC006122.1-201ENST00000493323 440 ntBASIC15.02■□□□□ -0
CREB3O43889 AP000438.1-201ENST00000543624 749 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
CREB3O43889 AC120498.3-201ENST00000568884 542 ntTSL 4 BASIC15.02■□□□□ -0
CREB3O43889 AC009134.1-201ENST00000571939 443 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
CREB3O43889 AC079325.2-202ENST00000641031 462 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.02■□□□□ -0
CREB3O43889 SERPING1-204ENST00000378324 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
CREB3O43889 E2F7-202ENST00000416496 5297 ntTSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
CREB3O43889 MSL2-201ENST00000309993 4692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
CREB3O43889 FASN-201ENST00000306749 8565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.7 ms