Protein–RNA interactions for Protein: C9J069

C9orf172, Uncharacterized protein C9orf172, humanhuman

Predictions only

Length 976 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf172C9J069 PSMG2-201ENST00000317615 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
C9orf172C9J069 ELP4-228ENST00000640954 1612 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
C9orf172C9J069 OXSM-201ENST00000280701 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
C9orf172C9J069 AC008125.1-201ENST00000548488 1538 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
C9orf172C9J069 AC004554.1-201ENST00000422830 1468 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
C9orf172C9J069 PAK4-208ENST00000599386 5735 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
C9orf172C9J069 DUT-208ENST00000559540 1441 ntTSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
C9orf172C9J069 ZNF84-202ENST00000392319 7020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
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C9orf172C9J069 C3orf67-201ENST00000295966 2650 ntTSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
C9orf172C9J069 DHRS7-209ENST00000557185 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
C9orf172C9J069 ISCA2-204ENST00000556816 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
C9orf172C9J069 CAMKK2-211ENST00000538733 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
C9orf172C9J069 AC073264.3-201ENST00000636941 2577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
C9orf172C9J069 PGLYRP3-201ENST00000290722 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
C9orf172C9J069 ZNF226-201ENST00000300823 817 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
C9orf172C9J069 GALP-201ENST00000357330 938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
C9orf172C9J069 AC073210.1-201ENST00000414799 232 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
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C9orf172C9J069 IGLV9-49-201ENST00000427632 409 ntAPPRIS P1 BASIC13.25□□□□□ -0.29
C9orf172C9J069 AL365436.2-201ENST00000434112 526 ntTSL 4 BASIC13.25□□□□□ -0.29
C9orf172C9J069 IFI35-204ENST00000438323 1232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
C9orf172C9J069 ASS1P2-201ENST00000439895 1223 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
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C9orf172C9J069 AC005323.2-202ENST00000581304 493 ntTSL 3 BASIC13.25□□□□□ -0.29
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C9orf172C9J069 BRSK1-203ENST00000585418 1104 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
C9orf172C9J069 NMRK2-202ENST00000593949 869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
C9orf172C9J069 NMRK2-204ENST00000599576 691 ntTSL 3 BASIC13.25□□□□□ -0.29
C9orf172C9J069 AL031673.1-201ENST00000611460 466 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
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C9orf172C9J069 AL135936.1-201ENST00000617956 998 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
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C9orf172C9J069 ANKMY1-203ENST00000373318 2449 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
C9orf172C9J069 C17orf80-203ENST00000359042 3645 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
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C9orf172C9J069 ZNF587-203ENST00000423137 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
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C9orf172C9J069 NID1-201ENST00000264187 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
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C9orf172C9J069 LINC01225-202ENST00000562339 2113 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
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C9orf172C9J069 ZFAND5-205ENST00000376962 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
C9orf172C9J069 TFAP2A-213ENST00000482890 2071 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
C9orf172C9J069 SIKE1-203ENST00000369528 5506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
C9orf172C9J069 OTUD7A-201ENST00000307050 10770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
C9orf172C9J069 MEX3C-204ENST00000616921 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
C9orf172C9J069 SCYL1-214ENST00000533862 2570 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
C9orf172C9J069 DERL3-202ENST00000318109 860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
C9orf172C9J069 XPNPEP2-201ENST00000371105 912 ntTSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
C9orf172C9J069 AL451105.2-201ENST00000413763 1234 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
C9orf172C9J069 HMGA1P1-201ENST00000415560 1062 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
C9orf172C9J069 KRT18P4-201ENST00000422599 1288 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
C9orf172C9J069 AC012506.1-201ENST00000423706 525 ntTSL 4 BASIC13.24□□□□□ -0.29
C9orf172C9J069 HLA-DPA2-205ENST00000433582 733 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
C9orf172C9J069 TAGLN3-203ENST00000455401 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
C9orf172C9J069 FAM3D-AS1-201ENST00000464125 821 ntTSL 3 BASIC13.24□□□□□ -0.29
C9orf172C9J069 MUSTN1-202ENST00000486659 622 ntTSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
C9orf172C9J069 GDNF-207ENST00000515058 764 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
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C9orf172C9J069 MYL6-218ENST00000550697 901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
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C9orf172C9J069 Metazoa_SRP.157-201ENST00000622819 262 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
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