Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6A4

CFAP20, Cilia- and flagella-associated protein 20, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 193 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CFAP20Q9Y6A4 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CFAP20Q9Y6A4 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CFAP20Q9Y6A4 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CFAP20Q9Y6A4 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CFAP20Q9Y6A4 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CFAP20Q9Y6A4 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CFAP20Q9Y6A4 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CFAP20Q9Y6A4 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
CFAP20Q9Y6A4 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CFAP20Q9Y6A4 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CFAP20Q9Y6A4 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CFAP20Q9Y6A4 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CFAP20Q9Y6A4 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CFAP20Q9Y6A4 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CFAP20Q9Y6A4 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
CFAP20Q9Y6A4 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CFAP20Q9Y6A4 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CFAP20Q9Y6A4 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CFAP20Q9Y6A4 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CFAP20Q9Y6A4 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CFAP20Q9Y6A4 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CFAP20Q9Y6A4 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CFAP20Q9Y6A4 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CFAP20Q9Y6A4 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CFAP20Q9Y6A4 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CFAP20Q9Y6A4 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CFAP20Q9Y6A4 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CFAP20Q9Y6A4 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CFAP20Q9Y6A4 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CFAP20Q9Y6A4 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CFAP20Q9Y6A4 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CFAP20Q9Y6A4 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CFAP20Q9Y6A4 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CFAP20Q9Y6A4 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CFAP20Q9Y6A4 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CFAP20Q9Y6A4 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CFAP20Q9Y6A4 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CFAP20Q9Y6A4 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CFAP20Q9Y6A4 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CFAP20Q9Y6A4 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CFAP20Q9Y6A4 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CFAP20Q9Y6A4 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CFAP20Q9Y6A4 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CFAP20Q9Y6A4 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CFAP20Q9Y6A4 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
CFAP20Q9Y6A4 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
CFAP20Q9Y6A4 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
CFAP20Q9Y6A4 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CFAP20Q9Y6A4 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CFAP20Q9Y6A4 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CFAP20Q9Y6A4 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CFAP20Q9Y6A4 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CFAP20Q9Y6A4 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CFAP20Q9Y6A4 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CFAP20Q9Y6A4 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CFAP20Q9Y6A4 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CFAP20Q9Y6A4 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
CFAP20Q9Y6A4 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CFAP20Q9Y6A4 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CFAP20Q9Y6A4 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CFAP20Q9Y6A4 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CFAP20Q9Y6A4 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CFAP20Q9Y6A4 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CFAP20Q9Y6A4 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CFAP20Q9Y6A4 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CFAP20Q9Y6A4 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CFAP20Q9Y6A4 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CFAP20Q9Y6A4 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CFAP20Q9Y6A4 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CFAP20Q9Y6A4 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CFAP20Q9Y6A4 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CFAP20Q9Y6A4 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CFAP20Q9Y6A4 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CFAP20Q9Y6A4 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CFAP20Q9Y6A4 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CFAP20Q9Y6A4 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CFAP20Q9Y6A4 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CFAP20Q9Y6A4 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CFAP20Q9Y6A4 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CFAP20Q9Y6A4 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CFAP20Q9Y6A4 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CFAP20Q9Y6A4 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CFAP20Q9Y6A4 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CFAP20Q9Y6A4 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CFAP20Q9Y6A4 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CFAP20Q9Y6A4 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CFAP20Q9Y6A4 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CFAP20Q9Y6A4 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CFAP20Q9Y6A4 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CFAP20Q9Y6A4 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CFAP20Q9Y6A4 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CFAP20Q9Y6A4 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CFAP20Q9Y6A4 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CFAP20Q9Y6A4 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CFAP20Q9Y6A4 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CFAP20Q9Y6A4 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CFAP20Q9Y6A4 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CFAP20Q9Y6A4 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CFAP20Q9Y6A4 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CFAP20Q9Y6A4 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.2 ms