Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y512

SAMM50, Sorting and assembly machinery component 50 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 469 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SAMM50Q9Y512 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
SAMM50Q9Y512 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
SAMM50Q9Y512 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
SAMM50Q9Y512 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
SAMM50Q9Y512 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
SAMM50Q9Y512 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
SAMM50Q9Y512 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
SAMM50Q9Y512 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
SAMM50Q9Y512 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
SAMM50Q9Y512 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
SAMM50Q9Y512 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
SAMM50Q9Y512 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
SAMM50Q9Y512 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
SAMM50Q9Y512 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
SAMM50Q9Y512 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
SAMM50Q9Y512 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
SAMM50Q9Y512 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
SAMM50Q9Y512 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
SAMM50Q9Y512 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
SAMM50Q9Y512 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
SAMM50Q9Y512 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
SAMM50Q9Y512 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
SAMM50Q9Y512 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
SAMM50Q9Y512 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
SAMM50Q9Y512 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
SAMM50Q9Y512 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
SAMM50Q9Y512 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.67
SAMM50Q9Y512 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
SAMM50Q9Y512 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
SAMM50Q9Y512 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
SAMM50Q9Y512 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
SAMM50Q9Y512 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC25.45■■□□□ 1.66
SAMM50Q9Y512 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
SAMM50Q9Y512 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
SAMM50Q9Y512 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
SAMM50Q9Y512 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
SAMM50Q9Y512 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
SAMM50Q9Y512 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
SAMM50Q9Y512 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
SAMM50Q9Y512 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
SAMM50Q9Y512 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
SAMM50Q9Y512 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
SAMM50Q9Y512 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
SAMM50Q9Y512 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
SAMM50Q9Y512 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
SAMM50Q9Y512 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
SAMM50Q9Y512 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
SAMM50Q9Y512 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
SAMM50Q9Y512 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
SAMM50Q9Y512 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
SAMM50Q9Y512 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
SAMM50Q9Y512 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
SAMM50Q9Y512 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
SAMM50Q9Y512 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
SAMM50Q9Y512 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
SAMM50Q9Y512 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
SAMM50Q9Y512 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
SAMM50Q9Y512 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
SAMM50Q9Y512 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
SAMM50Q9Y512 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
SAMM50Q9Y512 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
SAMM50Q9Y512 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
SAMM50Q9Y512 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
SAMM50Q9Y512 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
SAMM50Q9Y512 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
SAMM50Q9Y512 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
SAMM50Q9Y512 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC25.42■■□□□ 1.66
SAMM50Q9Y512 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
SAMM50Q9Y512 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
SAMM50Q9Y512 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
SAMM50Q9Y512 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
SAMM50Q9Y512 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
SAMM50Q9Y512 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
SAMM50Q9Y512 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
SAMM50Q9Y512 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
SAMM50Q9Y512 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
SAMM50Q9Y512 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
SAMM50Q9Y512 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
SAMM50Q9Y512 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
SAMM50Q9Y512 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
SAMM50Q9Y512 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
SAMM50Q9Y512 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
SAMM50Q9Y512 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
SAMM50Q9Y512 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
SAMM50Q9Y512 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
SAMM50Q9Y512 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
SAMM50Q9Y512 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
SAMM50Q9Y512 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
SAMM50Q9Y512 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
SAMM50Q9Y512 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
SAMM50Q9Y512 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
SAMM50Q9Y512 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
SAMM50Q9Y512 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
SAMM50Q9Y512 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
SAMM50Q9Y512 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC25.38■■□□□ 1.65
SAMM50Q9Y512 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
SAMM50Q9Y512 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
SAMM50Q9Y512 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SAMM50Q9Y512 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SAMM50Q9Y512 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.7 ms