Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y4K3

TRAF6, TNF receptor-associated factor 6, humanhuman

Predictions only

Length 522 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAF6Q9Y4K3 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TRAF6Q9Y4K3 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
TRAF6Q9Y4K3 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TRAF6Q9Y4K3 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TRAF6Q9Y4K3 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TRAF6Q9Y4K3 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TRAF6Q9Y4K3 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TRAF6Q9Y4K3 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TRAF6Q9Y4K3 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TRAF6Q9Y4K3 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
TRAF6Q9Y4K3 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TRAF6Q9Y4K3 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
TRAF6Q9Y4K3 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
TRAF6Q9Y4K3 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
TRAF6Q9Y4K3 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
TRAF6Q9Y4K3 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TRAF6Q9Y4K3 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
TRAF6Q9Y4K3 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
TRAF6Q9Y4K3 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
TRAF6Q9Y4K3 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
TRAF6Q9Y4K3 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
TRAF6Q9Y4K3 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
TRAF6Q9Y4K3 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TRAF6Q9Y4K3 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TRAF6Q9Y4K3 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
TRAF6Q9Y4K3 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TRAF6Q9Y4K3 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TRAF6Q9Y4K3 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
TRAF6Q9Y4K3 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
TRAF6Q9Y4K3 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
TRAF6Q9Y4K3 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
TRAF6Q9Y4K3 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
TRAF6Q9Y4K3 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
TRAF6Q9Y4K3 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
TRAF6Q9Y4K3 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
TRAF6Q9Y4K3 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC21.94■■□□□ 1.1
TRAF6Q9Y4K3 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TRAF6Q9Y4K3 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC21.94■■□□□ 1.1
TRAF6Q9Y4K3 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
TRAF6Q9Y4K3 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TRAF6Q9Y4K3 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TRAF6Q9Y4K3 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
TRAF6Q9Y4K3 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
TRAF6Q9Y4K3 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
TRAF6Q9Y4K3 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
TRAF6Q9Y4K3 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC21.93■■□□□ 1.1
TRAF6Q9Y4K3 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
TRAF6Q9Y4K3 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
TRAF6Q9Y4K3 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
TRAF6Q9Y4K3 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
TRAF6Q9Y4K3 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
TRAF6Q9Y4K3 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
TRAF6Q9Y4K3 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
TRAF6Q9Y4K3 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
TRAF6Q9Y4K3 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC21.93■■□□□ 1.1
TRAF6Q9Y4K3 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
TRAF6Q9Y4K3 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
TRAF6Q9Y4K3 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
TRAF6Q9Y4K3 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
TRAF6Q9Y4K3 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
TRAF6Q9Y4K3 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
TRAF6Q9Y4K3 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
TRAF6Q9Y4K3 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC21.92■■□□□ 1.1
TRAF6Q9Y4K3 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
TRAF6Q9Y4K3 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
TRAF6Q9Y4K3 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
TRAF6Q9Y4K3 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
TRAF6Q9Y4K3 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
TRAF6Q9Y4K3 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
TRAF6Q9Y4K3 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
TRAF6Q9Y4K3 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
TRAF6Q9Y4K3 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
TRAF6Q9Y4K3 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
TRAF6Q9Y4K3 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
TRAF6Q9Y4K3 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
TRAF6Q9Y4K3 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
TRAF6Q9Y4K3 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
TRAF6Q9Y4K3 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
TRAF6Q9Y4K3 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
TRAF6Q9Y4K3 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
TRAF6Q9Y4K3 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
TRAF6Q9Y4K3 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
TRAF6Q9Y4K3 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC21.9■■□□□ 1.1
TRAF6Q9Y4K3 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
TRAF6Q9Y4K3 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
TRAF6Q9Y4K3 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
TRAF6Q9Y4K3 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
TRAF6Q9Y4K3 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
TRAF6Q9Y4K3 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
TRAF6Q9Y4K3 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC21.9■■□□□ 1.1
TRAF6Q9Y4K3 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
TRAF6Q9Y4K3 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
TRAF6Q9Y4K3 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
TRAF6Q9Y4K3 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
TRAF6Q9Y4K3 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
TRAF6Q9Y4K3 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
TRAF6Q9Y4K3 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
TRAF6Q9Y4K3 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
TRAF6Q9Y4K3 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
TRAF6Q9Y4K3 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.1 ms