Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y446

PKP3, Plakophilin-3, humanhuman

Predictions only

Length 797 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKP3Q9Y446 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PKP3Q9Y446 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PKP3Q9Y446 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PKP3Q9Y446 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PKP3Q9Y446 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PKP3Q9Y446 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PKP3Q9Y446 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PKP3Q9Y446 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PKP3Q9Y446 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PKP3Q9Y446 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PKP3Q9Y446 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PKP3Q9Y446 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PKP3Q9Y446 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PKP3Q9Y446 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PKP3Q9Y446 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PKP3Q9Y446 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PKP3Q9Y446 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PKP3Q9Y446 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PKP3Q9Y446 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PKP3Q9Y446 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PKP3Q9Y446 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PKP3Q9Y446 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PKP3Q9Y446 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PKP3Q9Y446 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
PKP3Q9Y446 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PKP3Q9Y446 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PKP3Q9Y446 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PKP3Q9Y446 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PKP3Q9Y446 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PKP3Q9Y446 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PKP3Q9Y446 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PKP3Q9Y446 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PKP3Q9Y446 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PKP3Q9Y446 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PKP3Q9Y446 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PKP3Q9Y446 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PKP3Q9Y446 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PKP3Q9Y446 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PKP3Q9Y446 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PKP3Q9Y446 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PKP3Q9Y446 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PKP3Q9Y446 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PKP3Q9Y446 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PKP3Q9Y446 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PKP3Q9Y446 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PKP3Q9Y446 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PKP3Q9Y446 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PKP3Q9Y446 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PKP3Q9Y446 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PKP3Q9Y446 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PKP3Q9Y446 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PKP3Q9Y446 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PKP3Q9Y446 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PKP3Q9Y446 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PKP3Q9Y446 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PKP3Q9Y446 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
PKP3Q9Y446 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
PKP3Q9Y446 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PKP3Q9Y446 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PKP3Q9Y446 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PKP3Q9Y446 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PKP3Q9Y446 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PKP3Q9Y446 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PKP3Q9Y446 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PKP3Q9Y446 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PKP3Q9Y446 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PKP3Q9Y446 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PKP3Q9Y446 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PKP3Q9Y446 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PKP3Q9Y446 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PKP3Q9Y446 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PKP3Q9Y446 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PKP3Q9Y446 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PKP3Q9Y446 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PKP3Q9Y446 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
PKP3Q9Y446 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PKP3Q9Y446 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PKP3Q9Y446 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PKP3Q9Y446 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PKP3Q9Y446 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PKP3Q9Y446 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PKP3Q9Y446 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PKP3Q9Y446 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PKP3Q9Y446 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PKP3Q9Y446 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PKP3Q9Y446 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PKP3Q9Y446 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PKP3Q9Y446 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PKP3Q9Y446 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PKP3Q9Y446 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PKP3Q9Y446 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PKP3Q9Y446 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PKP3Q9Y446 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PKP3Q9Y446 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PKP3Q9Y446 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PKP3Q9Y446 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
PKP3Q9Y446 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PKP3Q9Y446 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PKP3Q9Y446 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PKP3Q9Y446 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.1 ms