Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3L3

SH3BP1, SH3 domain-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 701 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP1Q9Y3L3 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SH3BP1Q9Y3L3 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
SH3BP1Q9Y3L3 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SH3BP1Q9Y3L3 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SH3BP1Q9Y3L3 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SH3BP1Q9Y3L3 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SH3BP1Q9Y3L3 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SH3BP1Q9Y3L3 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SH3BP1Q9Y3L3 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SH3BP1Q9Y3L3 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SH3BP1Q9Y3L3 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SH3BP1Q9Y3L3 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SH3BP1Q9Y3L3 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SH3BP1Q9Y3L3 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SH3BP1Q9Y3L3 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SH3BP1Q9Y3L3 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SH3BP1Q9Y3L3 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SH3BP1Q9Y3L3 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SH3BP1Q9Y3L3 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SH3BP1Q9Y3L3 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SH3BP1Q9Y3L3 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SH3BP1Q9Y3L3 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
SH3BP1Q9Y3L3 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SH3BP1Q9Y3L3 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SH3BP1Q9Y3L3 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
SH3BP1Q9Y3L3 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
SH3BP1Q9Y3L3 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
SH3BP1Q9Y3L3 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SH3BP1Q9Y3L3 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SH3BP1Q9Y3L3 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SH3BP1Q9Y3L3 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SH3BP1Q9Y3L3 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SH3BP1Q9Y3L3 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SH3BP1Q9Y3L3 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SH3BP1Q9Y3L3 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
SH3BP1Q9Y3L3 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SH3BP1Q9Y3L3 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
SH3BP1Q9Y3L3 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
SH3BP1Q9Y3L3 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SH3BP1Q9Y3L3 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SH3BP1Q9Y3L3 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SH3BP1Q9Y3L3 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SH3BP1Q9Y3L3 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SH3BP1Q9Y3L3 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SH3BP1Q9Y3L3 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SH3BP1Q9Y3L3 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SH3BP1Q9Y3L3 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SH3BP1Q9Y3L3 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SH3BP1Q9Y3L3 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SH3BP1Q9Y3L3 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SH3BP1Q9Y3L3 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SH3BP1Q9Y3L3 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SH3BP1Q9Y3L3 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SH3BP1Q9Y3L3 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SH3BP1Q9Y3L3 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SH3BP1Q9Y3L3 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SH3BP1Q9Y3L3 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SH3BP1Q9Y3L3 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SH3BP1Q9Y3L3 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SH3BP1Q9Y3L3 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
SH3BP1Q9Y3L3 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
SH3BP1Q9Y3L3 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SH3BP1Q9Y3L3 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SH3BP1Q9Y3L3 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SH3BP1Q9Y3L3 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SH3BP1Q9Y3L3 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
SH3BP1Q9Y3L3 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
SH3BP1Q9Y3L3 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SH3BP1Q9Y3L3 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SH3BP1Q9Y3L3 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SH3BP1Q9Y3L3 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SH3BP1Q9Y3L3 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SH3BP1Q9Y3L3 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SH3BP1Q9Y3L3 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SH3BP1Q9Y3L3 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SH3BP1Q9Y3L3 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
SH3BP1Q9Y3L3 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
SH3BP1Q9Y3L3 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SH3BP1Q9Y3L3 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SH3BP1Q9Y3L3 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SH3BP1Q9Y3L3 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SH3BP1Q9Y3L3 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SH3BP1Q9Y3L3 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SH3BP1Q9Y3L3 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SH3BP1Q9Y3L3 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SH3BP1Q9Y3L3 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SH3BP1Q9Y3L3 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SH3BP1Q9Y3L3 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
SH3BP1Q9Y3L3 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
SH3BP1Q9Y3L3 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SH3BP1Q9Y3L3 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SH3BP1Q9Y3L3 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SH3BP1Q9Y3L3 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SH3BP1Q9Y3L3 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SH3BP1Q9Y3L3 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SH3BP1Q9Y3L3 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SH3BP1Q9Y3L3 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SH3BP1Q9Y3L3 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SH3BP1Q9Y3L3 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SH3BP1Q9Y3L3 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.9 ms