Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3E1

HDGFL3, Hepatoma-derived growth factor-related protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 203 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDGFL3Q9Y3E1 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
HDGFL3Q9Y3E1 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
HDGFL3Q9Y3E1 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
HDGFL3Q9Y3E1 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
HDGFL3Q9Y3E1 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
HDGFL3Q9Y3E1 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
HDGFL3Q9Y3E1 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
HDGFL3Q9Y3E1 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
HDGFL3Q9Y3E1 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
HDGFL3Q9Y3E1 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
HDGFL3Q9Y3E1 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
HDGFL3Q9Y3E1 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
HDGFL3Q9Y3E1 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
HDGFL3Q9Y3E1 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
HDGFL3Q9Y3E1 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
HDGFL3Q9Y3E1 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
HDGFL3Q9Y3E1 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC20.28■□□□□ 0.84
HDGFL3Q9Y3E1 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
HDGFL3Q9Y3E1 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
HDGFL3Q9Y3E1 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
HDGFL3Q9Y3E1 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
HDGFL3Q9Y3E1 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
HDGFL3Q9Y3E1 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
HDGFL3Q9Y3E1 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
HDGFL3Q9Y3E1 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
HDGFL3Q9Y3E1 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
HDGFL3Q9Y3E1 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
HDGFL3Q9Y3E1 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
HDGFL3Q9Y3E1 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
HDGFL3Q9Y3E1 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
HDGFL3Q9Y3E1 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
HDGFL3Q9Y3E1 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
HDGFL3Q9Y3E1 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC20.27■□□□□ 0.84
HDGFL3Q9Y3E1 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
HDGFL3Q9Y3E1 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
HDGFL3Q9Y3E1 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.83
HDGFL3Q9Y3E1 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
HDGFL3Q9Y3E1 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
HDGFL3Q9Y3E1 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
HDGFL3Q9Y3E1 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
HDGFL3Q9Y3E1 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
HDGFL3Q9Y3E1 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
HDGFL3Q9Y3E1 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
HDGFL3Q9Y3E1 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
HDGFL3Q9Y3E1 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC20.26■□□□□ 0.83
HDGFL3Q9Y3E1 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
HDGFL3Q9Y3E1 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
HDGFL3Q9Y3E1 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
HDGFL3Q9Y3E1 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
HDGFL3Q9Y3E1 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
HDGFL3Q9Y3E1 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
HDGFL3Q9Y3E1 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
HDGFL3Q9Y3E1 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
HDGFL3Q9Y3E1 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
HDGFL3Q9Y3E1 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
HDGFL3Q9Y3E1 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
HDGFL3Q9Y3E1 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
HDGFL3Q9Y3E1 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
HDGFL3Q9Y3E1 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
HDGFL3Q9Y3E1 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
HDGFL3Q9Y3E1 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC20.25■□□□□ 0.83
HDGFL3Q9Y3E1 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
HDGFL3Q9Y3E1 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
HDGFL3Q9Y3E1 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
HDGFL3Q9Y3E1 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
HDGFL3Q9Y3E1 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
HDGFL3Q9Y3E1 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
HDGFL3Q9Y3E1 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
HDGFL3Q9Y3E1 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
HDGFL3Q9Y3E1 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
HDGFL3Q9Y3E1 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
HDGFL3Q9Y3E1 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
HDGFL3Q9Y3E1 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
HDGFL3Q9Y3E1 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
HDGFL3Q9Y3E1 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
HDGFL3Q9Y3E1 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
HDGFL3Q9Y3E1 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
HDGFL3Q9Y3E1 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC20.23■□□□□ 0.83
HDGFL3Q9Y3E1 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
HDGFL3Q9Y3E1 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
HDGFL3Q9Y3E1 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
HDGFL3Q9Y3E1 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
HDGFL3Q9Y3E1 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
HDGFL3Q9Y3E1 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
HDGFL3Q9Y3E1 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
HDGFL3Q9Y3E1 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC20.22■□□□□ 0.83
HDGFL3Q9Y3E1 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
HDGFL3Q9Y3E1 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
HDGFL3Q9Y3E1 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
HDGFL3Q9Y3E1 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
HDGFL3Q9Y3E1 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
HDGFL3Q9Y3E1 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
HDGFL3Q9Y3E1 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
HDGFL3Q9Y3E1 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
HDGFL3Q9Y3E1 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
HDGFL3Q9Y3E1 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
HDGFL3Q9Y3E1 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
HDGFL3Q9Y3E1 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
HDGFL3Q9Y3E1 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
HDGFL3Q9Y3E1 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.5 ms