Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3B8

REXO2, Oligoribonuclease, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 237 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
REXO2Q9Y3B8 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
REXO2Q9Y3B8 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
REXO2Q9Y3B8 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
REXO2Q9Y3B8 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
REXO2Q9Y3B8 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
REXO2Q9Y3B8 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
REXO2Q9Y3B8 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
REXO2Q9Y3B8 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
REXO2Q9Y3B8 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
REXO2Q9Y3B8 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
REXO2Q9Y3B8 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
REXO2Q9Y3B8 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
REXO2Q9Y3B8 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
REXO2Q9Y3B8 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
REXO2Q9Y3B8 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
REXO2Q9Y3B8 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
REXO2Q9Y3B8 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
REXO2Q9Y3B8 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
REXO2Q9Y3B8 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC24.22■■□□□ 1.47
REXO2Q9Y3B8 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
REXO2Q9Y3B8 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
REXO2Q9Y3B8 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
REXO2Q9Y3B8 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
REXO2Q9Y3B8 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
REXO2Q9Y3B8 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
REXO2Q9Y3B8 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
REXO2Q9Y3B8 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
REXO2Q9Y3B8 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
REXO2Q9Y3B8 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC24.2■■□□□ 1.47
REXO2Q9Y3B8 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
REXO2Q9Y3B8 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
REXO2Q9Y3B8 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
REXO2Q9Y3B8 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
REXO2Q9Y3B8 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
REXO2Q9Y3B8 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
REXO2Q9Y3B8 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
REXO2Q9Y3B8 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
REXO2Q9Y3B8 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
REXO2Q9Y3B8 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
REXO2Q9Y3B8 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
REXO2Q9Y3B8 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
REXO2Q9Y3B8 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
REXO2Q9Y3B8 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
REXO2Q9Y3B8 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
REXO2Q9Y3B8 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
REXO2Q9Y3B8 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
REXO2Q9Y3B8 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
REXO2Q9Y3B8 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
REXO2Q9Y3B8 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
REXO2Q9Y3B8 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
REXO2Q9Y3B8 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
REXO2Q9Y3B8 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
REXO2Q9Y3B8 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
REXO2Q9Y3B8 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
REXO2Q9Y3B8 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
REXO2Q9Y3B8 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
REXO2Q9Y3B8 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
REXO2Q9Y3B8 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
REXO2Q9Y3B8 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
REXO2Q9Y3B8 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
REXO2Q9Y3B8 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
REXO2Q9Y3B8 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
REXO2Q9Y3B8 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
REXO2Q9Y3B8 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
REXO2Q9Y3B8 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC24.16■■□□□ 1.46
REXO2Q9Y3B8 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
REXO2Q9Y3B8 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
REXO2Q9Y3B8 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
REXO2Q9Y3B8 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
REXO2Q9Y3B8 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
REXO2Q9Y3B8 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
REXO2Q9Y3B8 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
REXO2Q9Y3B8 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
REXO2Q9Y3B8 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
REXO2Q9Y3B8 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
REXO2Q9Y3B8 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
REXO2Q9Y3B8 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
REXO2Q9Y3B8 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
REXO2Q9Y3B8 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
REXO2Q9Y3B8 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
REXO2Q9Y3B8 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
REXO2Q9Y3B8 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
REXO2Q9Y3B8 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
REXO2Q9Y3B8 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
REXO2Q9Y3B8 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
REXO2Q9Y3B8 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
REXO2Q9Y3B8 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
REXO2Q9Y3B8 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
REXO2Q9Y3B8 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
REXO2Q9Y3B8 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
REXO2Q9Y3B8 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
REXO2Q9Y3B8 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC24.12■■□□□ 1.45
REXO2Q9Y3B8 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC24.12■■□□□ 1.45
REXO2Q9Y3B8 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
REXO2Q9Y3B8 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
REXO2Q9Y3B8 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
REXO2Q9Y3B8 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
REXO2Q9Y3B8 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
REXO2Q9Y3B8 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
REXO2Q9Y3B8 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.2 ms