Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y333

LSM2, U6 snRNA-associated Sm-like protein LSm2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 95 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LSM2Q9Y333 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
LSM2Q9Y333 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
LSM2Q9Y333 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
LSM2Q9Y333 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
LSM2Q9Y333 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
LSM2Q9Y333 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
LSM2Q9Y333 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
LSM2Q9Y333 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
LSM2Q9Y333 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
LSM2Q9Y333 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
LSM2Q9Y333 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
LSM2Q9Y333 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
LSM2Q9Y333 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
LSM2Q9Y333 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
LSM2Q9Y333 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
LSM2Q9Y333 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
LSM2Q9Y333 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
LSM2Q9Y333 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
LSM2Q9Y333 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
LSM2Q9Y333 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
LSM2Q9Y333 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
LSM2Q9Y333 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
LSM2Q9Y333 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
LSM2Q9Y333 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
LSM2Q9Y333 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
LSM2Q9Y333 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
LSM2Q9Y333 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
LSM2Q9Y333 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
LSM2Q9Y333 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
LSM2Q9Y333 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
LSM2Q9Y333 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
LSM2Q9Y333 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
LSM2Q9Y333 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
LSM2Q9Y333 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
LSM2Q9Y333 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
LSM2Q9Y333 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
LSM2Q9Y333 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
LSM2Q9Y333 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
LSM2Q9Y333 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
LSM2Q9Y333 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
LSM2Q9Y333 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
LSM2Q9Y333 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
LSM2Q9Y333 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
LSM2Q9Y333 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
LSM2Q9Y333 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
LSM2Q9Y333 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
LSM2Q9Y333 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
LSM2Q9Y333 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
LSM2Q9Y333 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
LSM2Q9Y333 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
LSM2Q9Y333 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
LSM2Q9Y333 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
LSM2Q9Y333 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
LSM2Q9Y333 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
LSM2Q9Y333 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
LSM2Q9Y333 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
LSM2Q9Y333 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
LSM2Q9Y333 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
LSM2Q9Y333 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
LSM2Q9Y333 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
LSM2Q9Y333 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
LSM2Q9Y333 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
LSM2Q9Y333 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
LSM2Q9Y333 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
LSM2Q9Y333 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
LSM2Q9Y333 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
LSM2Q9Y333 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
LSM2Q9Y333 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
LSM2Q9Y333 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
LSM2Q9Y333 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
LSM2Q9Y333 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
LSM2Q9Y333 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
LSM2Q9Y333 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
LSM2Q9Y333 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
LSM2Q9Y333 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
LSM2Q9Y333 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
LSM2Q9Y333 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
LSM2Q9Y333 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
LSM2Q9Y333 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
LSM2Q9Y333 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC20.08■□□□□ 0.8
LSM2Q9Y333 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
LSM2Q9Y333 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
LSM2Q9Y333 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
LSM2Q9Y333 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
LSM2Q9Y333 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
LSM2Q9Y333 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
LSM2Q9Y333 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
LSM2Q9Y333 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
LSM2Q9Y333 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
LSM2Q9Y333 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
LSM2Q9Y333 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
LSM2Q9Y333 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
LSM2Q9Y333 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
LSM2Q9Y333 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
LSM2Q9Y333 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
LSM2Q9Y333 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
LSM2Q9Y333 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
LSM2Q9Y333 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
LSM2Q9Y333 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
LSM2Q9Y333 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.1 ms