Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2T2

AP3M1, AP-3 complex subunit mu-1, humanhuman

Predictions only

Length 418 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AP3M1Q9Y2T2 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
AP3M1Q9Y2T2 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
AP3M1Q9Y2T2 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
AP3M1Q9Y2T2 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
AP3M1Q9Y2T2 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
AP3M1Q9Y2T2 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
AP3M1Q9Y2T2 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
AP3M1Q9Y2T2 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
AP3M1Q9Y2T2 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC21.31■■□□□ 1
AP3M1Q9Y2T2 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
AP3M1Q9Y2T2 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC21.31■■□□□ 1
AP3M1Q9Y2T2 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
AP3M1Q9Y2T2 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC21.3■■□□□ 1
AP3M1Q9Y2T2 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
AP3M1Q9Y2T2 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
AP3M1Q9Y2T2 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
AP3M1Q9Y2T2 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC21.3■■□□□ 1
AP3M1Q9Y2T2 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
AP3M1Q9Y2T2 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC21.3■■□□□ 1
AP3M1Q9Y2T2 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
AP3M1Q9Y2T2 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
AP3M1Q9Y2T2 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
AP3M1Q9Y2T2 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
AP3M1Q9Y2T2 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
AP3M1Q9Y2T2 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC21.29■■□□□ 1
AP3M1Q9Y2T2 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
AP3M1Q9Y2T2 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
AP3M1Q9Y2T2 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
AP3M1Q9Y2T2 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
AP3M1Q9Y2T2 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
AP3M1Q9Y2T2 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
AP3M1Q9Y2T2 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
AP3M1Q9Y2T2 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
AP3M1Q9Y2T2 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
AP3M1Q9Y2T2 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
AP3M1Q9Y2T2 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
AP3M1Q9Y2T2 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
AP3M1Q9Y2T2 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
AP3M1Q9Y2T2 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC21.28■■□□□ 1
AP3M1Q9Y2T2 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
AP3M1Q9Y2T2 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
AP3M1Q9Y2T2 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
AP3M1Q9Y2T2 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
AP3M1Q9Y2T2 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
AP3M1Q9Y2T2 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
AP3M1Q9Y2T2 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
AP3M1Q9Y2T2 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
AP3M1Q9Y2T2 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
AP3M1Q9Y2T2 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
AP3M1Q9Y2T2 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
AP3M1Q9Y2T2 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
AP3M1Q9Y2T2 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
AP3M1Q9Y2T2 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
AP3M1Q9Y2T2 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
AP3M1Q9Y2T2 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
AP3M1Q9Y2T2 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
AP3M1Q9Y2T2 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
AP3M1Q9Y2T2 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
AP3M1Q9Y2T2 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
AP3M1Q9Y2T2 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
AP3M1Q9Y2T2 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
AP3M1Q9Y2T2 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
AP3M1Q9Y2T2 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
AP3M1Q9Y2T2 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
AP3M1Q9Y2T2 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
AP3M1Q9Y2T2 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
AP3M1Q9Y2T2 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
AP3M1Q9Y2T2 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
AP3M1Q9Y2T2 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
AP3M1Q9Y2T2 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
AP3M1Q9Y2T2 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
AP3M1Q9Y2T2 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
AP3M1Q9Y2T2 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
AP3M1Q9Y2T2 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
AP3M1Q9Y2T2 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
AP3M1Q9Y2T2 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
AP3M1Q9Y2T2 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
AP3M1Q9Y2T2 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
AP3M1Q9Y2T2 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
AP3M1Q9Y2T2 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
AP3M1Q9Y2T2 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
AP3M1Q9Y2T2 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
AP3M1Q9Y2T2 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
AP3M1Q9Y2T2 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
AP3M1Q9Y2T2 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
AP3M1Q9Y2T2 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
AP3M1Q9Y2T2 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
AP3M1Q9Y2T2 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
AP3M1Q9Y2T2 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
AP3M1Q9Y2T2 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
AP3M1Q9Y2T2 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
AP3M1Q9Y2T2 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC21.22■□□□□ 0.99
AP3M1Q9Y2T2 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
AP3M1Q9Y2T2 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
AP3M1Q9Y2T2 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
AP3M1Q9Y2T2 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
AP3M1Q9Y2T2 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
AP3M1Q9Y2T2 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
AP3M1Q9Y2T2 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
AP3M1Q9Y2T2 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.3 ms