Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2K6

USP20, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 20, humanhuman

Predictions only

Length 914 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP20Q9Y2K6 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
USP20Q9Y2K6 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
USP20Q9Y2K6 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
USP20Q9Y2K6 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
USP20Q9Y2K6 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
USP20Q9Y2K6 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
USP20Q9Y2K6 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
USP20Q9Y2K6 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
USP20Q9Y2K6 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
USP20Q9Y2K6 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
USP20Q9Y2K6 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
USP20Q9Y2K6 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC24.84■■□□□ 1.57
USP20Q9Y2K6 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
USP20Q9Y2K6 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
USP20Q9Y2K6 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
USP20Q9Y2K6 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
USP20Q9Y2K6 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
USP20Q9Y2K6 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
USP20Q9Y2K6 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
USP20Q9Y2K6 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
USP20Q9Y2K6 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
USP20Q9Y2K6 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
USP20Q9Y2K6 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
USP20Q9Y2K6 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
USP20Q9Y2K6 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
USP20Q9Y2K6 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
USP20Q9Y2K6 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
USP20Q9Y2K6 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
USP20Q9Y2K6 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
USP20Q9Y2K6 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
USP20Q9Y2K6 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
USP20Q9Y2K6 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
USP20Q9Y2K6 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC24.82■■□□□ 1.56
USP20Q9Y2K6 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
USP20Q9Y2K6 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
USP20Q9Y2K6 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
USP20Q9Y2K6 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
USP20Q9Y2K6 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
USP20Q9Y2K6 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
USP20Q9Y2K6 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
USP20Q9Y2K6 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
USP20Q9Y2K6 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC24.81■■□□□ 1.56
USP20Q9Y2K6 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
USP20Q9Y2K6 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
USP20Q9Y2K6 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
USP20Q9Y2K6 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
USP20Q9Y2K6 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
USP20Q9Y2K6 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
USP20Q9Y2K6 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
USP20Q9Y2K6 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
USP20Q9Y2K6 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
USP20Q9Y2K6 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
USP20Q9Y2K6 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
USP20Q9Y2K6 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
USP20Q9Y2K6 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
USP20Q9Y2K6 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
USP20Q9Y2K6 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
USP20Q9Y2K6 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
USP20Q9Y2K6 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
USP20Q9Y2K6 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
USP20Q9Y2K6 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
USP20Q9Y2K6 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
USP20Q9Y2K6 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
USP20Q9Y2K6 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
USP20Q9Y2K6 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
USP20Q9Y2K6 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
USP20Q9Y2K6 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
USP20Q9Y2K6 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
USP20Q9Y2K6 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
USP20Q9Y2K6 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
USP20Q9Y2K6 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
USP20Q9Y2K6 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC24.78■■□□□ 1.56
USP20Q9Y2K6 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
USP20Q9Y2K6 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
USP20Q9Y2K6 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
USP20Q9Y2K6 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
USP20Q9Y2K6 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
USP20Q9Y2K6 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
USP20Q9Y2K6 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
USP20Q9Y2K6 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
USP20Q9Y2K6 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
USP20Q9Y2K6 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
USP20Q9Y2K6 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
USP20Q9Y2K6 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
USP20Q9Y2K6 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
USP20Q9Y2K6 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
USP20Q9Y2K6 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
USP20Q9Y2K6 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
USP20Q9Y2K6 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
USP20Q9Y2K6 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
USP20Q9Y2K6 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
USP20Q9Y2K6 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
USP20Q9Y2K6 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
USP20Q9Y2K6 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
USP20Q9Y2K6 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
USP20Q9Y2K6 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
USP20Q9Y2K6 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
USP20Q9Y2K6 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC24.76■■□□□ 1.55
USP20Q9Y2K6 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
USP20Q9Y2K6 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.9 ms