Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2K2

SIK3, Serine/threonine-protein kinase SIK3, humanhuman

Predictions only

Length 1,263 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIK3Q9Y2K2 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SIK3Q9Y2K2 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SIK3Q9Y2K2 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
SIK3Q9Y2K2 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SIK3Q9Y2K2 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SIK3Q9Y2K2 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SIK3Q9Y2K2 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SIK3Q9Y2K2 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SIK3Q9Y2K2 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
SIK3Q9Y2K2 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SIK3Q9Y2K2 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SIK3Q9Y2K2 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SIK3Q9Y2K2 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SIK3Q9Y2K2 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SIK3Q9Y2K2 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SIK3Q9Y2K2 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SIK3Q9Y2K2 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
SIK3Q9Y2K2 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SIK3Q9Y2K2 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SIK3Q9Y2K2 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SIK3Q9Y2K2 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SIK3Q9Y2K2 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
SIK3Q9Y2K2 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC24.5■■□□□ 1.51
SIK3Q9Y2K2 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SIK3Q9Y2K2 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SIK3Q9Y2K2 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SIK3Q9Y2K2 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SIK3Q9Y2K2 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SIK3Q9Y2K2 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
SIK3Q9Y2K2 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SIK3Q9Y2K2 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SIK3Q9Y2K2 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SIK3Q9Y2K2 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SIK3Q9Y2K2 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SIK3Q9Y2K2 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SIK3Q9Y2K2 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SIK3Q9Y2K2 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SIK3Q9Y2K2 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SIK3Q9Y2K2 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SIK3Q9Y2K2 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SIK3Q9Y2K2 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SIK3Q9Y2K2 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SIK3Q9Y2K2 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SIK3Q9Y2K2 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SIK3Q9Y2K2 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SIK3Q9Y2K2 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SIK3Q9Y2K2 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
SIK3Q9Y2K2 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SIK3Q9Y2K2 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SIK3Q9Y2K2 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
SIK3Q9Y2K2 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
SIK3Q9Y2K2 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SIK3Q9Y2K2 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
SIK3Q9Y2K2 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SIK3Q9Y2K2 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
SIK3Q9Y2K2 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC24.46■■□□□ 1.51
SIK3Q9Y2K2 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.51
SIK3Q9Y2K2 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
SIK3Q9Y2K2 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
SIK3Q9Y2K2 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
SIK3Q9Y2K2 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC24.45■■□□□ 1.5
SIK3Q9Y2K2 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
SIK3Q9Y2K2 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC24.45■■□□□ 1.5
SIK3Q9Y2K2 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
SIK3Q9Y2K2 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
SIK3Q9Y2K2 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
SIK3Q9Y2K2 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
SIK3Q9Y2K2 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
SIK3Q9Y2K2 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SIK3Q9Y2K2 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SIK3Q9Y2K2 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
SIK3Q9Y2K2 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
SIK3Q9Y2K2 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
SIK3Q9Y2K2 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SIK3Q9Y2K2 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
SIK3Q9Y2K2 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
SIK3Q9Y2K2 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
SIK3Q9Y2K2 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
SIK3Q9Y2K2 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
SIK3Q9Y2K2 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SIK3Q9Y2K2 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SIK3Q9Y2K2 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SIK3Q9Y2K2 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SIK3Q9Y2K2 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SIK3Q9Y2K2 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SIK3Q9Y2K2 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SIK3Q9Y2K2 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SIK3Q9Y2K2 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SIK3Q9Y2K2 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
SIK3Q9Y2K2 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SIK3Q9Y2K2 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SIK3Q9Y2K2 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SIK3Q9Y2K2 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SIK3Q9Y2K2 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SIK3Q9Y2K2 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SIK3Q9Y2K2 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SIK3Q9Y2K2 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
SIK3Q9Y2K2 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SIK3Q9Y2K2 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SIK3Q9Y2K2 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.4 ms