Protein–RNA interactions for Protein: Q9UQ84

EXO1, Exonuclease 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 846 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EXO1Q9UQ84 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
EXO1Q9UQ84 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
EXO1Q9UQ84 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
EXO1Q9UQ84 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
EXO1Q9UQ84 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
EXO1Q9UQ84 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
EXO1Q9UQ84 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
EXO1Q9UQ84 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
EXO1Q9UQ84 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
EXO1Q9UQ84 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
EXO1Q9UQ84 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
EXO1Q9UQ84 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
EXO1Q9UQ84 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
EXO1Q9UQ84 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
EXO1Q9UQ84 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
EXO1Q9UQ84 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
EXO1Q9UQ84 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
EXO1Q9UQ84 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
EXO1Q9UQ84 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
EXO1Q9UQ84 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
EXO1Q9UQ84 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
EXO1Q9UQ84 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
EXO1Q9UQ84 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
EXO1Q9UQ84 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
EXO1Q9UQ84 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
EXO1Q9UQ84 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
EXO1Q9UQ84 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
EXO1Q9UQ84 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
EXO1Q9UQ84 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
EXO1Q9UQ84 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
EXO1Q9UQ84 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
EXO1Q9UQ84 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
EXO1Q9UQ84 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
EXO1Q9UQ84 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
EXO1Q9UQ84 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
EXO1Q9UQ84 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
EXO1Q9UQ84 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC21.41■■□□□ 1.02
EXO1Q9UQ84 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
EXO1Q9UQ84 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
EXO1Q9UQ84 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
EXO1Q9UQ84 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
EXO1Q9UQ84 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
EXO1Q9UQ84 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
EXO1Q9UQ84 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
EXO1Q9UQ84 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
EXO1Q9UQ84 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
EXO1Q9UQ84 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
EXO1Q9UQ84 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
EXO1Q9UQ84 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
EXO1Q9UQ84 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
EXO1Q9UQ84 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
EXO1Q9UQ84 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
EXO1Q9UQ84 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
EXO1Q9UQ84 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
EXO1Q9UQ84 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
EXO1Q9UQ84 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.02
EXO1Q9UQ84 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
EXO1Q9UQ84 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC21.39■■□□□ 1.02
EXO1Q9UQ84 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
EXO1Q9UQ84 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
EXO1Q9UQ84 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
EXO1Q9UQ84 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
EXO1Q9UQ84 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
EXO1Q9UQ84 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
EXO1Q9UQ84 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
EXO1Q9UQ84 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
EXO1Q9UQ84 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
EXO1Q9UQ84 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
EXO1Q9UQ84 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
EXO1Q9UQ84 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
EXO1Q9UQ84 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
EXO1Q9UQ84 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
EXO1Q9UQ84 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
EXO1Q9UQ84 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
EXO1Q9UQ84 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
EXO1Q9UQ84 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
EXO1Q9UQ84 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
EXO1Q9UQ84 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
EXO1Q9UQ84 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC21.37■■□□□ 1.01
EXO1Q9UQ84 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
EXO1Q9UQ84 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
EXO1Q9UQ84 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
EXO1Q9UQ84 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
EXO1Q9UQ84 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
EXO1Q9UQ84 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
EXO1Q9UQ84 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
EXO1Q9UQ84 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
EXO1Q9UQ84 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
EXO1Q9UQ84 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
EXO1Q9UQ84 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
EXO1Q9UQ84 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
EXO1Q9UQ84 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
EXO1Q9UQ84 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
EXO1Q9UQ84 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
EXO1Q9UQ84 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
EXO1Q9UQ84 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
EXO1Q9UQ84 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
EXO1Q9UQ84 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
EXO1Q9UQ84 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
EXO1Q9UQ84 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.5 ms