Protein–RNA interactions for Protein: Q9UQ13

SHOC2, Leucine-rich repeat protein SHOC-2, humanhuman

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Length 582 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHOC2Q9UQ13 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SHOC2Q9UQ13 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SHOC2Q9UQ13 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SHOC2Q9UQ13 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SHOC2Q9UQ13 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
SHOC2Q9UQ13 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SHOC2Q9UQ13 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SHOC2Q9UQ13 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
SHOC2Q9UQ13 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SHOC2Q9UQ13 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SHOC2Q9UQ13 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SHOC2Q9UQ13 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
SHOC2Q9UQ13 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SHOC2Q9UQ13 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SHOC2Q9UQ13 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SHOC2Q9UQ13 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SHOC2Q9UQ13 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SHOC2Q9UQ13 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
SHOC2Q9UQ13 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SHOC2Q9UQ13 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SHOC2Q9UQ13 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SHOC2Q9UQ13 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SHOC2Q9UQ13 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SHOC2Q9UQ13 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SHOC2Q9UQ13 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SHOC2Q9UQ13 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SHOC2Q9UQ13 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SHOC2Q9UQ13 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SHOC2Q9UQ13 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SHOC2Q9UQ13 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SHOC2Q9UQ13 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SHOC2Q9UQ13 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SHOC2Q9UQ13 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SHOC2Q9UQ13 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SHOC2Q9UQ13 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SHOC2Q9UQ13 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SHOC2Q9UQ13 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SHOC2Q9UQ13 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SHOC2Q9UQ13 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SHOC2Q9UQ13 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SHOC2Q9UQ13 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SHOC2Q9UQ13 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SHOC2Q9UQ13 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SHOC2Q9UQ13 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SHOC2Q9UQ13 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SHOC2Q9UQ13 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SHOC2Q9UQ13 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
SHOC2Q9UQ13 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SHOC2Q9UQ13 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SHOC2Q9UQ13 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SHOC2Q9UQ13 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SHOC2Q9UQ13 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SHOC2Q9UQ13 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SHOC2Q9UQ13 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SHOC2Q9UQ13 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SHOC2Q9UQ13 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SHOC2Q9UQ13 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SHOC2Q9UQ13 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SHOC2Q9UQ13 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SHOC2Q9UQ13 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SHOC2Q9UQ13 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SHOC2Q9UQ13 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SHOC2Q9UQ13 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SHOC2Q9UQ13 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SHOC2Q9UQ13 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SHOC2Q9UQ13 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SHOC2Q9UQ13 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SHOC2Q9UQ13 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SHOC2Q9UQ13 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SHOC2Q9UQ13 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SHOC2Q9UQ13 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SHOC2Q9UQ13 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SHOC2Q9UQ13 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SHOC2Q9UQ13 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SHOC2Q9UQ13 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
SHOC2Q9UQ13 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
SHOC2Q9UQ13 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SHOC2Q9UQ13 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SHOC2Q9UQ13 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SHOC2Q9UQ13 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SHOC2Q9UQ13 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SHOC2Q9UQ13 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SHOC2Q9UQ13 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
SHOC2Q9UQ13 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SHOC2Q9UQ13 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SHOC2Q9UQ13 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SHOC2Q9UQ13 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SHOC2Q9UQ13 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SHOC2Q9UQ13 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SHOC2Q9UQ13 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SHOC2Q9UQ13 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SHOC2Q9UQ13 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
SHOC2Q9UQ13 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SHOC2Q9UQ13 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SHOC2Q9UQ13 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SHOC2Q9UQ13 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SHOC2Q9UQ13 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SHOC2Q9UQ13 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SHOC2Q9UQ13 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SHOC2Q9UQ13 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
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