Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULQ1

TPCN1, Two pore calcium channel protein 1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TPCN1Q9ULQ1 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
TPCN1Q9ULQ1 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
TPCN1Q9ULQ1 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC26.6■■□□□ 1.85
TPCN1Q9ULQ1 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
TPCN1Q9ULQ1 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
TPCN1Q9ULQ1 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC26.6■■□□□ 1.85
TPCN1Q9ULQ1 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
TPCN1Q9ULQ1 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
TPCN1Q9ULQ1 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
TPCN1Q9ULQ1 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
TPCN1Q9ULQ1 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
TPCN1Q9ULQ1 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
TPCN1Q9ULQ1 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
TPCN1Q9ULQ1 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
TPCN1Q9ULQ1 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
TPCN1Q9ULQ1 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
TPCN1Q9ULQ1 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
TPCN1Q9ULQ1 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
TPCN1Q9ULQ1 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
TPCN1Q9ULQ1 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
TPCN1Q9ULQ1 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
TPCN1Q9ULQ1 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
TPCN1Q9ULQ1 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
TPCN1Q9ULQ1 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
TPCN1Q9ULQ1 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC26.58■■□□□ 1.85
TPCN1Q9ULQ1 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
TPCN1Q9ULQ1 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC26.58■■□□□ 1.84
TPCN1Q9ULQ1 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.57■■□□□ 1.84
TPCN1Q9ULQ1 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
TPCN1Q9ULQ1 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
TPCN1Q9ULQ1 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
TPCN1Q9ULQ1 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC26.57■■□□□ 1.84
TPCN1Q9ULQ1 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
TPCN1Q9ULQ1 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
TPCN1Q9ULQ1 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
TPCN1Q9ULQ1 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
TPCN1Q9ULQ1 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
TPCN1Q9ULQ1 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
TPCN1Q9ULQ1 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
TPCN1Q9ULQ1 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
TPCN1Q9ULQ1 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
TPCN1Q9ULQ1 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
TPCN1Q9ULQ1 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
TPCN1Q9ULQ1 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
TPCN1Q9ULQ1 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
TPCN1Q9ULQ1 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
TPCN1Q9ULQ1 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
TPCN1Q9ULQ1 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
TPCN1Q9ULQ1 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
TPCN1Q9ULQ1 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
TPCN1Q9ULQ1 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC26.55■■□□□ 1.84
TPCN1Q9ULQ1 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
TPCN1Q9ULQ1 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
TPCN1Q9ULQ1 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
TPCN1Q9ULQ1 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
TPCN1Q9ULQ1 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
TPCN1Q9ULQ1 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC26.54■■□□□ 1.84
TPCN1Q9ULQ1 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
TPCN1Q9ULQ1 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
TPCN1Q9ULQ1 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
TPCN1Q9ULQ1 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
TPCN1Q9ULQ1 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
TPCN1Q9ULQ1 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
TPCN1Q9ULQ1 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
TPCN1Q9ULQ1 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
TPCN1Q9ULQ1 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
TPCN1Q9ULQ1 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
TPCN1Q9ULQ1 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
TPCN1Q9ULQ1 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
TPCN1Q9ULQ1 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
TPCN1Q9ULQ1 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
TPCN1Q9ULQ1 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
TPCN1Q9ULQ1 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
TPCN1Q9ULQ1 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
TPCN1Q9ULQ1 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
TPCN1Q9ULQ1 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
TPCN1Q9ULQ1 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
TPCN1Q9ULQ1 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
TPCN1Q9ULQ1 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.84
TPCN1Q9ULQ1 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.84
TPCN1Q9ULQ1 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
TPCN1Q9ULQ1 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
TPCN1Q9ULQ1 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
TPCN1Q9ULQ1 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
TPCN1Q9ULQ1 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
TPCN1Q9ULQ1 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
TPCN1Q9ULQ1 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC26.51■■□□□ 1.83
TPCN1Q9ULQ1 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
TPCN1Q9ULQ1 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
TPCN1Q9ULQ1 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
TPCN1Q9ULQ1 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
TPCN1Q9ULQ1 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
TPCN1Q9ULQ1 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
TPCN1Q9ULQ1 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
TPCN1Q9ULQ1 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
TPCN1Q9ULQ1 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
TPCN1Q9ULQ1 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
TPCN1Q9ULQ1 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
TPCN1Q9ULQ1 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
TPCN1Q9ULQ1 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
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