Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULM6

CNOT6, CCR4-NOT transcription complex subunit 6, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 557 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNOT6Q9ULM6 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CNOT6Q9ULM6 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CNOT6Q9ULM6 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
CNOT6Q9ULM6 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CNOT6Q9ULM6 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CNOT6Q9ULM6 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CNOT6Q9ULM6 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CNOT6Q9ULM6 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CNOT6Q9ULM6 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CNOT6Q9ULM6 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CNOT6Q9ULM6 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
CNOT6Q9ULM6 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CNOT6Q9ULM6 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
CNOT6Q9ULM6 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CNOT6Q9ULM6 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CNOT6Q9ULM6 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CNOT6Q9ULM6 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CNOT6Q9ULM6 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CNOT6Q9ULM6 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CNOT6Q9ULM6 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CNOT6Q9ULM6 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CNOT6Q9ULM6 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CNOT6Q9ULM6 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CNOT6Q9ULM6 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
CNOT6Q9ULM6 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
CNOT6Q9ULM6 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
CNOT6Q9ULM6 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CNOT6Q9ULM6 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CNOT6Q9ULM6 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CNOT6Q9ULM6 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CNOT6Q9ULM6 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CNOT6Q9ULM6 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CNOT6Q9ULM6 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
CNOT6Q9ULM6 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CNOT6Q9ULM6 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CNOT6Q9ULM6 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
CNOT6Q9ULM6 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CNOT6Q9ULM6 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CNOT6Q9ULM6 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CNOT6Q9ULM6 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CNOT6Q9ULM6 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CNOT6Q9ULM6 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CNOT6Q9ULM6 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CNOT6Q9ULM6 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CNOT6Q9ULM6 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CNOT6Q9ULM6 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CNOT6Q9ULM6 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CNOT6Q9ULM6 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CNOT6Q9ULM6 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CNOT6Q9ULM6 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CNOT6Q9ULM6 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CNOT6Q9ULM6 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CNOT6Q9ULM6 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CNOT6Q9ULM6 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CNOT6Q9ULM6 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CNOT6Q9ULM6 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CNOT6Q9ULM6 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CNOT6Q9ULM6 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CNOT6Q9ULM6 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CNOT6Q9ULM6 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CNOT6Q9ULM6 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CNOT6Q9ULM6 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CNOT6Q9ULM6 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CNOT6Q9ULM6 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CNOT6Q9ULM6 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CNOT6Q9ULM6 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CNOT6Q9ULM6 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CNOT6Q9ULM6 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CNOT6Q9ULM6 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CNOT6Q9ULM6 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CNOT6Q9ULM6 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CNOT6Q9ULM6 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CNOT6Q9ULM6 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CNOT6Q9ULM6 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CNOT6Q9ULM6 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CNOT6Q9ULM6 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CNOT6Q9ULM6 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CNOT6Q9ULM6 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CNOT6Q9ULM6 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CNOT6Q9ULM6 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CNOT6Q9ULM6 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CNOT6Q9ULM6 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CNOT6Q9ULM6 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CNOT6Q9ULM6 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CNOT6Q9ULM6 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CNOT6Q9ULM6 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CNOT6Q9ULM6 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CNOT6Q9ULM6 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
CNOT6Q9ULM6 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CNOT6Q9ULM6 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CNOT6Q9ULM6 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CNOT6Q9ULM6 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CNOT6Q9ULM6 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CNOT6Q9ULM6 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CNOT6Q9ULM6 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CNOT6Q9ULM6 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CNOT6Q9ULM6 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CNOT6Q9ULM6 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CNOT6Q9ULM6 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CNOT6Q9ULM6 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.2 ms