Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULI2

RIMKLB, Beta-citrylglutamate synthase B, humanhuman

Predictions only

Length 386 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RIMKLBQ9ULI2 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
RIMKLBQ9ULI2 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
RIMKLBQ9ULI2 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
RIMKLBQ9ULI2 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
RIMKLBQ9ULI2 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
RIMKLBQ9ULI2 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
RIMKLBQ9ULI2 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
RIMKLBQ9ULI2 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
RIMKLBQ9ULI2 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
RIMKLBQ9ULI2 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
RIMKLBQ9ULI2 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
RIMKLBQ9ULI2 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
RIMKLBQ9ULI2 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
RIMKLBQ9ULI2 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
RIMKLBQ9ULI2 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
RIMKLBQ9ULI2 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
RIMKLBQ9ULI2 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
RIMKLBQ9ULI2 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
RIMKLBQ9ULI2 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
RIMKLBQ9ULI2 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
RIMKLBQ9ULI2 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
RIMKLBQ9ULI2 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
RIMKLBQ9ULI2 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
RIMKLBQ9ULI2 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
RIMKLBQ9ULI2 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
RIMKLBQ9ULI2 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
RIMKLBQ9ULI2 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
RIMKLBQ9ULI2 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
RIMKLBQ9ULI2 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
RIMKLBQ9ULI2 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
RIMKLBQ9ULI2 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
RIMKLBQ9ULI2 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
RIMKLBQ9ULI2 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
RIMKLBQ9ULI2 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
RIMKLBQ9ULI2 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
RIMKLBQ9ULI2 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
RIMKLBQ9ULI2 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
RIMKLBQ9ULI2 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
RIMKLBQ9ULI2 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
RIMKLBQ9ULI2 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
RIMKLBQ9ULI2 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
RIMKLBQ9ULI2 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
RIMKLBQ9ULI2 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
RIMKLBQ9ULI2 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
RIMKLBQ9ULI2 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
RIMKLBQ9ULI2 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
RIMKLBQ9ULI2 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
RIMKLBQ9ULI2 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
RIMKLBQ9ULI2 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
RIMKLBQ9ULI2 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
RIMKLBQ9ULI2 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
RIMKLBQ9ULI2 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
RIMKLBQ9ULI2 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
RIMKLBQ9ULI2 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
RIMKLBQ9ULI2 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
RIMKLBQ9ULI2 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
RIMKLBQ9ULI2 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
RIMKLBQ9ULI2 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.19
RIMKLBQ9ULI2 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.19
RIMKLBQ9ULI2 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
RIMKLBQ9ULI2 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
RIMKLBQ9ULI2 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
RIMKLBQ9ULI2 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
RIMKLBQ9ULI2 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
RIMKLBQ9ULI2 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
RIMKLBQ9ULI2 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
RIMKLBQ9ULI2 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
RIMKLBQ9ULI2 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
RIMKLBQ9ULI2 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
RIMKLBQ9ULI2 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
RIMKLBQ9ULI2 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
RIMKLBQ9ULI2 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
RIMKLBQ9ULI2 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
RIMKLBQ9ULI2 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
RIMKLBQ9ULI2 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC22.5■■□□□ 1.19
RIMKLBQ9ULI2 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
RIMKLBQ9ULI2 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
RIMKLBQ9ULI2 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
RIMKLBQ9ULI2 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
RIMKLBQ9ULI2 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
RIMKLBQ9ULI2 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
RIMKLBQ9ULI2 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
RIMKLBQ9ULI2 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
RIMKLBQ9ULI2 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
RIMKLBQ9ULI2 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
RIMKLBQ9ULI2 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
RIMKLBQ9ULI2 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
RIMKLBQ9ULI2 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
RIMKLBQ9ULI2 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
RIMKLBQ9ULI2 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
RIMKLBQ9ULI2 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
RIMKLBQ9ULI2 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
RIMKLBQ9ULI2 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
RIMKLBQ9ULI2 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
RIMKLBQ9ULI2 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
RIMKLBQ9ULI2 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
RIMKLBQ9ULI2 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
RIMKLBQ9ULI2 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
RIMKLBQ9ULI2 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
RIMKLBQ9ULI2 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28 ms