Protein–RNA interactions for Protein: Q9UL16

CFAP45, Cilia- and flagella-associated protein 45, humanhuman

Predictions only

Length 551 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CFAP45Q9UL16 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
CFAP45Q9UL16 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
CFAP45Q9UL16 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
CFAP45Q9UL16 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
CFAP45Q9UL16 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
CFAP45Q9UL16 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
CFAP45Q9UL16 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
CFAP45Q9UL16 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
CFAP45Q9UL16 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
CFAP45Q9UL16 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
CFAP45Q9UL16 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
CFAP45Q9UL16 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC25.93■■□□□ 1.74
CFAP45Q9UL16 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
CFAP45Q9UL16 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
CFAP45Q9UL16 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
CFAP45Q9UL16 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
CFAP45Q9UL16 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
CFAP45Q9UL16 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
CFAP45Q9UL16 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
CFAP45Q9UL16 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
CFAP45Q9UL16 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
CFAP45Q9UL16 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
CFAP45Q9UL16 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC25.91■■□□□ 1.74
CFAP45Q9UL16 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
CFAP45Q9UL16 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
CFAP45Q9UL16 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
CFAP45Q9UL16 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
CFAP45Q9UL16 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
CFAP45Q9UL16 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
CFAP45Q9UL16 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
CFAP45Q9UL16 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
CFAP45Q9UL16 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
CFAP45Q9UL16 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
CFAP45Q9UL16 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
CFAP45Q9UL16 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
CFAP45Q9UL16 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
CFAP45Q9UL16 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
CFAP45Q9UL16 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
CFAP45Q9UL16 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
CFAP45Q9UL16 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
CFAP45Q9UL16 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
CFAP45Q9UL16 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
CFAP45Q9UL16 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
CFAP45Q9UL16 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
CFAP45Q9UL16 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC25.89■■□□□ 1.74
CFAP45Q9UL16 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
CFAP45Q9UL16 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
CFAP45Q9UL16 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC25.89■■□□□ 1.74
CFAP45Q9UL16 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC25.89■■□□□ 1.74
CFAP45Q9UL16 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
CFAP45Q9UL16 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
CFAP45Q9UL16 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
CFAP45Q9UL16 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
CFAP45Q9UL16 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
CFAP45Q9UL16 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
CFAP45Q9UL16 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
CFAP45Q9UL16 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
CFAP45Q9UL16 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
CFAP45Q9UL16 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
CFAP45Q9UL16 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
CFAP45Q9UL16 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
CFAP45Q9UL16 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
CFAP45Q9UL16 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
CFAP45Q9UL16 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
CFAP45Q9UL16 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC25.87■■□□□ 1.73
CFAP45Q9UL16 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
CFAP45Q9UL16 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
CFAP45Q9UL16 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
CFAP45Q9UL16 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
CFAP45Q9UL16 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
CFAP45Q9UL16 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
CFAP45Q9UL16 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
CFAP45Q9UL16 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
CFAP45Q9UL16 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
CFAP45Q9UL16 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
CFAP45Q9UL16 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
CFAP45Q9UL16 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
CFAP45Q9UL16 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
CFAP45Q9UL16 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
CFAP45Q9UL16 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
CFAP45Q9UL16 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
CFAP45Q9UL16 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
CFAP45Q9UL16 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
CFAP45Q9UL16 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
CFAP45Q9UL16 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
CFAP45Q9UL16 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
CFAP45Q9UL16 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
CFAP45Q9UL16 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
CFAP45Q9UL16 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
CFAP45Q9UL16 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
CFAP45Q9UL16 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
CFAP45Q9UL16 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
CFAP45Q9UL16 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
CFAP45Q9UL16 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
CFAP45Q9UL16 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
CFAP45Q9UL16 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
CFAP45Q9UL16 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
CFAP45Q9UL16 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
CFAP45Q9UL16 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
CFAP45Q9UL16 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.9 ms