Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKT5

FBXO4, F-box only protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 387 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FBXO4Q9UKT5 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
FBXO4Q9UKT5 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
FBXO4Q9UKT5 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
FBXO4Q9UKT5 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
FBXO4Q9UKT5 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
FBXO4Q9UKT5 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
FBXO4Q9UKT5 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
FBXO4Q9UKT5 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
FBXO4Q9UKT5 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
FBXO4Q9UKT5 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
FBXO4Q9UKT5 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
FBXO4Q9UKT5 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
FBXO4Q9UKT5 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
FBXO4Q9UKT5 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
FBXO4Q9UKT5 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
FBXO4Q9UKT5 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
FBXO4Q9UKT5 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
FBXO4Q9UKT5 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
FBXO4Q9UKT5 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
FBXO4Q9UKT5 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
FBXO4Q9UKT5 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
FBXO4Q9UKT5 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
FBXO4Q9UKT5 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
FBXO4Q9UKT5 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
FBXO4Q9UKT5 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
FBXO4Q9UKT5 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
FBXO4Q9UKT5 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
FBXO4Q9UKT5 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
FBXO4Q9UKT5 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
FBXO4Q9UKT5 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
FBXO4Q9UKT5 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
FBXO4Q9UKT5 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.23
FBXO4Q9UKT5 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
FBXO4Q9UKT5 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
FBXO4Q9UKT5 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
FBXO4Q9UKT5 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
FBXO4Q9UKT5 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
FBXO4Q9UKT5 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
FBXO4Q9UKT5 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
FBXO4Q9UKT5 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
FBXO4Q9UKT5 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
FBXO4Q9UKT5 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
FBXO4Q9UKT5 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
FBXO4Q9UKT5 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
FBXO4Q9UKT5 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
FBXO4Q9UKT5 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
FBXO4Q9UKT5 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
FBXO4Q9UKT5 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
FBXO4Q9UKT5 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
FBXO4Q9UKT5 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
FBXO4Q9UKT5 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
FBXO4Q9UKT5 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
FBXO4Q9UKT5 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
FBXO4Q9UKT5 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
FBXO4Q9UKT5 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
FBXO4Q9UKT5 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
FBXO4Q9UKT5 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
FBXO4Q9UKT5 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
FBXO4Q9UKT5 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
FBXO4Q9UKT5 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
FBXO4Q9UKT5 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
FBXO4Q9UKT5 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
FBXO4Q9UKT5 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
FBXO4Q9UKT5 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
FBXO4Q9UKT5 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
FBXO4Q9UKT5 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
FBXO4Q9UKT5 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
FBXO4Q9UKT5 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
FBXO4Q9UKT5 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
FBXO4Q9UKT5 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
FBXO4Q9UKT5 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
FBXO4Q9UKT5 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
FBXO4Q9UKT5 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
FBXO4Q9UKT5 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
FBXO4Q9UKT5 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
FBXO4Q9UKT5 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
FBXO4Q9UKT5 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
FBXO4Q9UKT5 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
FBXO4Q9UKT5 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
FBXO4Q9UKT5 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
FBXO4Q9UKT5 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
FBXO4Q9UKT5 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
FBXO4Q9UKT5 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
FBXO4Q9UKT5 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
FBXO4Q9UKT5 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
FBXO4Q9UKT5 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
FBXO4Q9UKT5 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
FBXO4Q9UKT5 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
FBXO4Q9UKT5 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
FBXO4Q9UKT5 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC22.65■■□□□ 1.22
FBXO4Q9UKT5 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
FBXO4Q9UKT5 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
FBXO4Q9UKT5 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
FBXO4Q9UKT5 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
FBXO4Q9UKT5 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
FBXO4Q9UKT5 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.21
FBXO4Q9UKT5 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
FBXO4Q9UKT5 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
FBXO4Q9UKT5 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
FBXO4Q9UKT5 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.1 ms