Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKS6

PACSIN3, Protein kinase C and casein kinase substrate in neurons protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 424 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PACSIN3Q9UKS6 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PACSIN3Q9UKS6 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PACSIN3Q9UKS6 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
PACSIN3Q9UKS6 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PACSIN3Q9UKS6 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PACSIN3Q9UKS6 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
PACSIN3Q9UKS6 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PACSIN3Q9UKS6 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PACSIN3Q9UKS6 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PACSIN3Q9UKS6 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PACSIN3Q9UKS6 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
PACSIN3Q9UKS6 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
PACSIN3Q9UKS6 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PACSIN3Q9UKS6 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
PACSIN3Q9UKS6 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
PACSIN3Q9UKS6 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
PACSIN3Q9UKS6 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PACSIN3Q9UKS6 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
PACSIN3Q9UKS6 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PACSIN3Q9UKS6 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PACSIN3Q9UKS6 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PACSIN3Q9UKS6 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PACSIN3Q9UKS6 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
PACSIN3Q9UKS6 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PACSIN3Q9UKS6 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PACSIN3Q9UKS6 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
PACSIN3Q9UKS6 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
PACSIN3Q9UKS6 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PACSIN3Q9UKS6 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
PACSIN3Q9UKS6 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PACSIN3Q9UKS6 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PACSIN3Q9UKS6 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
PACSIN3Q9UKS6 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
PACSIN3Q9UKS6 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
PACSIN3Q9UKS6 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
PACSIN3Q9UKS6 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
PACSIN3Q9UKS6 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
PACSIN3Q9UKS6 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC21.77■■□□□ 1.08
PACSIN3Q9UKS6 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.07
PACSIN3Q9UKS6 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.07
PACSIN3Q9UKS6 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
PACSIN3Q9UKS6 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PACSIN3Q9UKS6 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
PACSIN3Q9UKS6 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC21.76■■□□□ 1.07
PACSIN3Q9UKS6 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
PACSIN3Q9UKS6 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PACSIN3Q9UKS6 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
PACSIN3Q9UKS6 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PACSIN3Q9UKS6 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
PACSIN3Q9UKS6 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PACSIN3Q9UKS6 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
PACSIN3Q9UKS6 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PACSIN3Q9UKS6 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PACSIN3Q9UKS6 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
PACSIN3Q9UKS6 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PACSIN3Q9UKS6 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PACSIN3Q9UKS6 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PACSIN3Q9UKS6 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
PACSIN3Q9UKS6 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC21.74■■□□□ 1.07
PACSIN3Q9UKS6 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PACSIN3Q9UKS6 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PACSIN3Q9UKS6 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PACSIN3Q9UKS6 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PACSIN3Q9UKS6 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
PACSIN3Q9UKS6 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PACSIN3Q9UKS6 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PACSIN3Q9UKS6 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
PACSIN3Q9UKS6 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
PACSIN3Q9UKS6 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PACSIN3Q9UKS6 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PACSIN3Q9UKS6 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
PACSIN3Q9UKS6 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PACSIN3Q9UKS6 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PACSIN3Q9UKS6 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PACSIN3Q9UKS6 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
PACSIN3Q9UKS6 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC21.72■■□□□ 1.07
PACSIN3Q9UKS6 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
PACSIN3Q9UKS6 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
PACSIN3Q9UKS6 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PACSIN3Q9UKS6 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
PACSIN3Q9UKS6 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PACSIN3Q9UKS6 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PACSIN3Q9UKS6 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PACSIN3Q9UKS6 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
PACSIN3Q9UKS6 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PACSIN3Q9UKS6 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PACSIN3Q9UKS6 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
PACSIN3Q9UKS6 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PACSIN3Q9UKS6 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PACSIN3Q9UKS6 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PACSIN3Q9UKS6 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PACSIN3Q9UKS6 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PACSIN3Q9UKS6 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PACSIN3Q9UKS6 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PACSIN3Q9UKS6 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
PACSIN3Q9UKS6 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PACSIN3Q9UKS6 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
PACSIN3Q9UKS6 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
PACSIN3Q9UKS6 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
PACSIN3Q9UKS6 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.6 ms