Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKL6

PCTP, Phosphatidylcholine transfer protein, humanhuman

Predictions only

Length 214 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCTPQ9UKL6 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PCTPQ9UKL6 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PCTPQ9UKL6 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PCTPQ9UKL6 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PCTPQ9UKL6 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PCTPQ9UKL6 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PCTPQ9UKL6 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PCTPQ9UKL6 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PCTPQ9UKL6 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PCTPQ9UKL6 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PCTPQ9UKL6 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PCTPQ9UKL6 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PCTPQ9UKL6 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PCTPQ9UKL6 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PCTPQ9UKL6 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PCTPQ9UKL6 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PCTPQ9UKL6 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PCTPQ9UKL6 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PCTPQ9UKL6 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PCTPQ9UKL6 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PCTPQ9UKL6 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PCTPQ9UKL6 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
PCTPQ9UKL6 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PCTPQ9UKL6 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PCTPQ9UKL6 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PCTPQ9UKL6 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
PCTPQ9UKL6 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
PCTPQ9UKL6 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
PCTPQ9UKL6 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
PCTPQ9UKL6 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
PCTPQ9UKL6 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
PCTPQ9UKL6 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
PCTPQ9UKL6 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PCTPQ9UKL6 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PCTPQ9UKL6 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.11
PCTPQ9UKL6 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.11
PCTPQ9UKL6 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PCTPQ9UKL6 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
PCTPQ9UKL6 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
PCTPQ9UKL6 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PCTPQ9UKL6 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
PCTPQ9UKL6 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PCTPQ9UKL6 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PCTPQ9UKL6 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
PCTPQ9UKL6 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PCTPQ9UKL6 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PCTPQ9UKL6 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PCTPQ9UKL6 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PCTPQ9UKL6 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
PCTPQ9UKL6 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PCTPQ9UKL6 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
PCTPQ9UKL6 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PCTPQ9UKL6 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PCTPQ9UKL6 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
PCTPQ9UKL6 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
PCTPQ9UKL6 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
PCTPQ9UKL6 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
PCTPQ9UKL6 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
PCTPQ9UKL6 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
PCTPQ9UKL6 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PCTPQ9UKL6 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
PCTPQ9UKL6 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PCTPQ9UKL6 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PCTPQ9UKL6 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
PCTPQ9UKL6 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PCTPQ9UKL6 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PCTPQ9UKL6 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
PCTPQ9UKL6 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
PCTPQ9UKL6 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
PCTPQ9UKL6 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
PCTPQ9UKL6 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
PCTPQ9UKL6 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
PCTPQ9UKL6 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC21.92■■□□□ 1.1
PCTPQ9UKL6 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PCTPQ9UKL6 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PCTPQ9UKL6 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
PCTPQ9UKL6 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
PCTPQ9UKL6 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
PCTPQ9UKL6 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PCTPQ9UKL6 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PCTPQ9UKL6 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PCTPQ9UKL6 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PCTPQ9UKL6 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC21.91■■□□□ 1.1
PCTPQ9UKL6 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
PCTPQ9UKL6 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
PCTPQ9UKL6 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
PCTPQ9UKL6 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PCTPQ9UKL6 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PCTPQ9UKL6 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PCTPQ9UKL6 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC21.91■■□□□ 1.1
PCTPQ9UKL6 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
PCTPQ9UKL6 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PCTPQ9UKL6 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PCTPQ9UKL6 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PCTPQ9UKL6 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
PCTPQ9UKL6 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
PCTPQ9UKL6 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
PCTPQ9UKL6 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
PCTPQ9UKL6 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
PCTPQ9UKL6 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.3 ms